Page 34 - 《中国药房》2026年2期

正后 P＜0.01）。为进一步探讨这些差异表达靶点的临 SRC TP53 －9
床意义，本研究利用 PanCanSurvPlot 数据库评估其表达 17-beta-estradiol －8.0 －7.5
水平与 DLBCL 患者总生存期的相关性。结果（图 2）显 5-cis-cyclopentadecen-l-one －6.2 －5.5
P-menth-4-en-3-one －5 －4.9
示，SRC 的总生存期显著低于低表达患者（风险比＝
androst-4-ene-3，17-dione －7.5 －6.4
1.39，P＝0.028 8），TP53 高表达患者则相反（风险比＝
testosterone －7.5 －6.5
0.64，P＝0.002 5），提示SRC高表达和TP53低表达是不
quercetin －8.2 －7.1 －4
良预后因素。
注：颜色深度代表分子对接的结合能得分（单位kcal/mol），得分越
表1 核心靶点在DLBCL中的表达中位数比较
低，表明理论结合亲和力越强，颜色也越深。
靶点 DLBCL样本（n＝47） 全血细胞样本（n＝337） log 2FC 校正P值 图3 核心成分与关键靶点的分子对接结果热图
TP53 38.17 4.06 2.953 ＜0.01
Akt 41.11 19.98 1.005 ＜0.01 2.1.8 分子动力学模拟与结合自由能计算验证
HDAC1 126.35 23.81 2.360 ＜0.01 为进一步验证17β-雌二醇、槲皮素与SRC的对接稳
SRC 11.34 1.89 2.094 ＜0.01
CTNNB1 48.05 14.02 1.707 ＜0.01 定性，本研究使用Amber 20.0软件进行了200 ns的分子
TNF 6.38 1.44 1.597 ＜0.01
动力学模拟，计算均方根偏差（root mean square devia‐
FC：差异倍数。
tion，RMSD）、均方根波动（root mean square fluctuation，
1.00 1.00
低表达 低表达 RMSF）、回转半径（radius of gyration，Rg）并绘制相应的
0.75 高表达 0.75 高表达
生存率 0.50 生存率 0.50 曲线。RMSD 曲线结果（图 4A）显示，SRC-槲皮素复合

0.25 P＝0.028 8 0.25 P＝0.002 5 物的RMSD曲线处于较低水平且保持平稳，RMSD值波
风险比：1.39 风险比：0.64
95%置信区间：1.02～1.89 95%置信区间：0.47～0.86 动均小于2 Å，而SRC-17β-雌二醇复合物的RMSD 曲线
0 0
0 20 40 60 80 0 20 40 60 80 波动稍大。RMSF曲线结果（图4B）显示，两个复合物的
总生存期/月 总生存期/月
A. SRC B. TP53 RMSF曲线整体趋势相似，但在一些残基区域（如200～
图2 SRC、TP53 的表达水平与 DLBCL 患者总生存期 250 和 300～400 残基处），SRC-槲皮素复合物的波动幅
的关系图 度略大。Rg曲线结果（图4C）显示，两个复合物的Rg值
2.1.7 西黄丸核心成分与关键靶点的分子对接 相对稳定，均保持较为稳定的结构构型。
根据上述结果，本研究最终选择 TP53 和 SRC 2 个 最后，根据分子力学泊松-玻尔兹曼表面积（molecu‐
关键靶点分别与西黄丸的核心成分进行分子对接。从 lar mechanics Poisson-Boltzmann surface area，MM-
PubChem数据库获取西黄丸核心成分的3D结构作为对 PBSA）计算蛋白质和分子之间的结合自由能。为探究
接配体；从 RCSB PDB 数据库下载 TP53（ID：6GGE）和 不同类型键的各自贡献，本研究将两个复合物的结合能
SRC（ID：2SRC）的 3D 结构作为对接受体；在 AutoDock 分解为4个能量分量：范德华能（ΔEvdW ）、静电能（ΔEele ）、
Vina软件中进行核心成分与关键靶点对接，当结合能小 极性溶剂化能（ΔGGB ）和非极性溶剂化自由能（ΔGSA ）。
[18]
于－5.0 kcal/mol时证明分子间显示出更强的亲和力 。 结果（表2）显示，SRC-17β-雌二醇复合物和SRC-槲皮素
核心成分与2个关键靶点的对接得分以热图形式展示， 复合物的总结合自由能（ΔGbind ）分别为（－23.1±4.1）、
结果（图3）显示，17β-雌二醇、槲皮素与SRC的结合亲和 （－29.3±3.0）kcal/mol，可见SRC与槲皮素的结合更强，
力更高。 SRC可能是西黄丸发挥药效最有希望的靶点。
4.0 SRC-17β-雌二醇复合物 20 SRC-17β-雌二醇复合物 25.2 SRC-17β-雌二醇复合物
3.5 SRC-槲皮素复合物 18 SRC-槲皮素复合物 SRC-槲皮素复合物
3.0 16 25.0
2.5 14 24.8
RMSD/Å 2.0 RMSF/Å 12 Rg/Å
10
1.5
1.0 8 24.6
0.5 6 24.4
0 4
－0.5 2 24.2
0 50 100 150 200 0 100 200 300 400 0 50 100 150 200
时间/ns 残基索引 时间/ns
A.两个复合物的RMSD曲线 B.两个复合物的RMSF曲线 C.两个复合物的Rg曲线
图4 17β-雌二醇、槲皮素与SRC对接复合物的相互作用曲线图

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