Page 33 - 《中国药房》2026年2期
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2.1.2 DLBCL 疾 病 相 关 靶 点 的 收 集 与 西 黄 丸 治 疗 HDAC1)、雌激素受体 1、连环蛋白 β1(catenin beta 1,
DLBCL潜在靶点的获取 CTNNB1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、
使用GeneCards数据库、OMIM数据库和DisGeNET JUN原癌基因。
数据库,以“diffuse large B-cell lymphoma”为检索词,限 2.1.5 潜在靶点生物功能富集分析
定物种为“homo sapiens”,得到 DLBCL 疾病相关靶点, 将 PPI 网络中按度值大小排序前 100 个靶点导入
合并所有靶点并去重后最终得到 2 059 个与 DLBCL 相 Metascape 数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功
关的疾病靶点。将所获西黄丸活性成分相关靶点与 能和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of
DLBCL 疾病相关靶点上传至 Venny 2.1.0 平台取交集, Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,物种设置为
最终获得410个西黄丸治疗DLBCL的潜在靶点。 “homo sapiens”,设定 P<0.01。结果显示,共富集到
2.1.3 “西黄丸-活性成分-靶点-DLBCL”网络构建及 1 763个生物过程(biological process,BP)条目、141个分
分析 子功能(molecular function,MF)条目、68 个细胞成分
将“2.1.2”项下获得的 410 个交集靶点导入 Cyto‐ (cellular component,CC)条目以及 193 条 KEGG 通路。
scape 3.9.1 软件构建“西黄丸-活性成分-靶点-DLBCL” 分别将 GO 功能富集结果排序前 10 位的条目和 KEGG
网络图。借助 Network Analyzer 插件进行拓扑分析,结 通路富集结果排序前20位的通路导入微生信网站,生成
果显示,该网络图包含 500 个节点、1 839 条边。根据度 GO 功能 BP、CC、MF 条目的三合一柱状图(图 1A)和
值大小排序选取前6个成分作为西黄丸的核心成分,分 KEGG 通路的气泡图(图 1B)。结果显示,GO 功能富集
别为 17 beta-estradiol(17β-雌二醇)、quercetin(槲皮素)、 主要与apoptotic signaling pathway(凋亡信号通路)、tran‐
5-cis-cyclopentadecen-L-one(5-顺-环十五烷-L-酮)、P- scription factor binding(转 录 因 子 结 合)、transcription
menth-4-en-3-one(5-甲基-2-丙-2-基环己-2-烯-1-酮)、an‐ regulator complex(转录调节因子复合物)等有关;KEGG
drost-4-ene-3,17-dione(雄烯二酮)、testosterone(睾酮), 通路富集分析主要涉及 pathways in cancer(癌症信号通
度值分别为114、108、95、95、94、93。 路)、PI3K-Akt signaling pathway(PI3K/Akt 信号通路)、
2.1.4 蛋白质-蛋白质相互作用网络构建及分析 FoxO signaling pathway(叉头框蛋白O信号通路)等。
进一步将410个交集靶点导入String数据库构建蛋 2.1.6 核心靶点的临床相关性分析
白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网 本研究进一步利用 GEPIA 数据库分析 PPI 网络获
络,设置物种为“homo sapiens”,阈值设置为“highest 得的10个核心靶点在DLBCL样本和健康人全血细胞样
confidence(>0.9)”。将PPI网络导入Cytoscape 3.9.1软 本之间的表达差异。GEPIA数据库收集到47份DLBCL
件进行可视化和分析。根据度值大小排序选取前 10 个 样本和 337 份健康人全血细胞样本的相关数据,采用方
靶点作为核心靶点,包括:肿瘤蛋白 53(tumor protein 差分析比较各核心靶点在两组间表达水平的差异。如
53,TP53)、Akt、E1A结合蛋白300、信号转导和转录激活 表 1 所 示 ,核 心 靶 点 中 的 TP53、Akt、SRC、HDAC1、
因子3、SRC、组蛋白脱乙酰基酶1(histone deacetylase 1, CTNNB1、TNF在DLBCL样本中高表达(经多次检验校
response to hormone pathways in cancer
cellular response to nitrogen compound
cellular response to organonitrogen compound response to hormone
response to peptide PI3K-Akt signaling pathway
enzyme-linked receptor protein signaling pathway
response to growth factor BP human cytomegalovirus infection
cellular response to peptide
apoptotic signaling pathway human T-cell leukemia virus 1 infection -log 10 (P value)
cellular response to growth factor stimulus hepatitis B 90
response to peptide hormone kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
transcription factor binding 80
DNA-binding transcription factor binding human papillomavirus infection 70
RNA polymerase Ⅱ-specific DNA-binding transcription factor binding -log 10 (P value) proteoglycans in cancer
kinase binding 60
protein kinase binding 40 prostate cancer 50
chromatin binding MF 30 FoxO signaling pathway
phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor
protein kinase activity 20 lipid and atherosclerosis Count
kinase activity 10 cellular senescence
transcription coregulator binding AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications 30
transcription regulator complex 40
RNA polymerase Ⅱ transcription regulator complex breast cancer 50
transcription repressor complex 60
plasma membrane protein complex endocrine resistance
membrane raft thyroid hormone signaling pathway
membrane microdomain CC
transferase complex, transferring phosphorus-containing groups pancreatic cancer
plasma membrane raft chronic myeloid leukemia
protein kinase complex
receptor complex EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance
0 10 20 30 40 50 30 40 50 60
Counts Counts
A. GO功能富集分析柱状图 B. KEGG通路富集分析气泡图
图1 西黄丸治疗DLBCL潜在靶点的GO功能和KEGG通路富集分析图
中国药房 2026年第37卷第2期 China Pharmacy 2026 Vol. 37 No. 2 · 163 ·

