Page 42 - 《中国药房》2025年6期
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2.1.2 三七丹参片治疗NAFLD的核心靶点筛选 Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集
首先,为明确三七丹参片活性成分、交集靶点与 分析。
NAFLD的相互作用关系,本研究采用CytoScape 3.9.1软 GO功能富集分析结果(图2)显示,核心靶点共涉及
件构建了“单味药材-有效成分-交集靶点-疾病”网络(限 46 个条目,其中生物过程 23 个,包括对生物调节、对刺
于篇幅,该图可扫描本文首页二维码链接页面中“增强 激的反应、生物过程的正/负向调节等;细胞组分 14 个,
出版”板块查看)。随后,本研究将三七丹参片治疗 包括细胞膜、细胞器、胞外区等;分子功能 9 个,包括结
NAFLD 的潜在作用靶点导入 STRING 数据库(https:// 合、催化活性等。
String-db.org/),获得其蛋白-蛋白相互作用(protein- 生物调节
细胞过程
多细胞有机体过程
protein interaction,PPI)网络,并通过 CytoScape 3.9.1 软 生物过程调节
对刺激的反应
件中的“cytoHubba”插件对该网络进行拓扑学分析,以 信号
单器官过程
发展过程
最大团中心度(maximal clique centrality,MCC)排前 20 代谢过程
生物过程的负向调节
[13]
位的靶点 作为三七丹参片治疗 NAFLD 的核心靶点。 生物过程的正向调节
多器官过程
细胞成分组成或生物发生
最后,以上述核心靶点为对象,同法构建 PPI 网络(图 定位
免疫系统过程
1),这20个核心靶点主要涉及炎症反应、氧化应激反应 运动
复制
复制过程
及脂质代谢过程。 行为
生物黏附
生长
节律过程
EGF 脱毒
STAT3 AKT1 细胞
细胞组分
IL-6 TP53 细胞器
膜封闭官腔
细胞器组分
大分子复合物
CASP3 TNF
细胞膜
细胞膜组分
胞外区
胞外区组成
FOS IL-1β 突触
细胞连接
突触组成
细胞外基质
结合
CCND1 CXCL8 催化活性
分子功能调节剂
核酸结合转录因子
信号转导活性
分子转导活性
STAT1 PTGS2 抗氧化活性
化学附着剂活性
转录因子活性及蛋白结合
PTEN VEGFA 0 5 10 15 20
基因数
红色:生物过程;绿色:细胞组成;蓝色:分子功能。
RELA MYC
图2 三七丹参片治疗 NAFLD 核心靶点的 GO 功能富
EGFR MMP9
HIF1A 集图
VEGFA:血管内皮生长因子A;IL-6、IL-1β:白细胞介素6、1β; KEGG 通路富集分析结果(图 3)显示,核心靶点主
TNF:肿瘤坏死因子;STAT1、STAT13:信号转导及转录活化因子1、3; 要富集于15条通路,其中与NAFLD有关的通路涉及炎
MMP9:基质金属蛋白酶9;PTGS2:前列腺素内过氧化物合酶2; [3-4]
症反应、氧化应激与脂质代谢等 ,因此本研究后续动
CXCL8:趋化因子CXC配体8:CASP3:胱天蛋白酶3;AKT1:丝氨酸/苏
物实验拟针对炎症、氧化应激以及脂质代谢相关指标进
氨酸蛋白激酶1;HIF1A:缺氧诱导因子1A;EGF:表皮生长因子;
EGFR:表皮生长因子受体;MYC:原癌蛋白c-myc;FOS:原癌蛋白c- 行验证。
fos;CCND1:周期蛋白D1;PTEN:人第10号染色体缺失的磷酸酶及张 2.2 动物实验
力蛋白同源物;TP53:肿瘤蛋白p53;RELA:凋亡相关蛋白RelA。
2.2.1 动物模型制备、分组与给药
图1 三七丹参片治疗NAFLD核心靶点的PPI网络
将SD大鼠随机分为对照组(8只)和高脂饮食(high-
2.1.3 三七丹参片治疗NAFLD的核心靶点富集分析 fat diet,HFD)组(43只),分别喂食普通饲料和60%高脂
利用 OmicShare 平台(https://www.omicshare.com/ 饲料,连续饲喂8周。第8周末,HFD组随机选取3只大
tools/Home/Task),将物种设定为“Homo sapiens”,以P< 鼠处死,取其肝组织进行油红 O 染色,若显示肝脏脂肪
[14]
0.05 为标准 ,对核心靶点进行基因本体(gene onto- 变性,则表明NAFLD模型建立成功。
logy,GO)功 能 及 京 都 基 因 和 基 因 组 数 据 库(Kyoto 造模后,将 HFD 组大鼠随机分为模型组,三七丹参
· 676 · China Pharmacy 2025 Vol. 36 No. 6 中国药房 2025年第36卷第6期