Page 43 - 《中国药房》2022年17期
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表2 20批KSC样品中6个成分的含量(n=3,mg/g)
样品 去甲异波尔定 盐酸益母草碱 连翘酯苷B 毛蕊花糖苷 金石蚕苷 异毛蕊花糖苷
S1 1.483 0.143 5.676 0.604 6.226 0.869
S2 1.455 0.093 5.637 0.551 5.927 0.785
S3 1.452 0.111 5.247 0.565 5.629 0.796
S4 1.496 0.097 5.298 0.525 5.606 0.822
S5 1.548 0.133 5.407 0.525 5.544 0.821
S6 1.613 0.110 5.570 0.582 5.779 0.847
S7 1.599 0.102 5.524 0.569 5.708 0.839
S8 1.718 0.110 5.888 0.610 6.158 0.895
S9 1.387 0.103 5.135 0.537 5.327 0.787
S10 1.440 0.111 5.340 0.566 5.577 0.866
S11 1.548 0.141 5.697 0.623 6.114 0.886
S12 1.578 0.111 5.545 0.588 5.907 0.884
S13 1.498 0.133 5.203 0.581 5.578 0.801
S14 1.547 0.108 5.245 0.554 5.476 0.795
S15 1.336 0.106 5.233 0.551 5.447 0.791
S16 1.493 0.143 5.170 0.554 5.413 0.791
S17 1.406 0.136 4.970 0.505 5.206 0.788
S18 1.507 0.141 5.329 0.539 5.581 0.808
S19 1.485 0.136 5.156 0.557 5.524 0.812
S20 1.774 0.141 5.359 0.584 5.785 0.840 图3 KSC治疗宫颈炎的“药物-成分-靶点”网络
2.3 网络药理学研究 节点的度值(degree)、介数中心性(betweenness centrali-
通过分析20批KSC的指纹图谱及含量测定结果,推 ty,BC)和接近中心性(closeness centrality,CC),以 de-
测金石蚕苷、连翘酯苷B、毛蕊花糖苷、异毛蕊花糖苷、去 gree、BC、CC 的中位数为阈值筛选得到 14 个核心靶点
甲异波尔定、盐酸益母草碱可能为 KSC 的 Q-marker,遂 (图 4),即为 KSC 治疗宫颈炎的关键靶点。按照 degree
采用网络药理学方法进行进一步的分析。 对关键靶点进行排序,将排名前2位的靶点即蛋白激酶
2.3.1 活性成分靶点及宫颈炎相关靶点筛选 将金石 B1(protein kinase B1,AKT1)和肿瘤坏死因子(tumor
蚕苷(poliumoside)、连翘酯苷B(forsythoside B)、毛蕊花 necrosis factor,TNF)作为核心靶点进行分析。
糖苷(acteoside)、异毛蕊花糖苷(isoacteoside)、去甲异波
尔定(norisoboldine)、盐酸益母草碱(leonurine hydro-
chloride)作为关键词输入 TCMSP 数据库与分析平台
(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),共获取到这 6 个成分
的 126 个靶点,通过 UniProt 数据库(http://www.uniprot.
org/)将靶点名转换为对应的基因名。通过 PubChem 数
据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)进行检索,
将所得成分分子结构文件导入 SwissTargetPrediction
(http://www.swisstargetprediction.ch/)进 行 靶 点 预 测 。
图4 KSC治疗宫颈炎关键靶点的PPI网络图
检 索 GeneCards(http://www.genecards.org/)、OMIM
2.3.3 基因本体和 KEGG 通路富集分析 将潜在核心
(https://omim.org/)数据库获取与宫颈炎相关的靶点。
靶点导入 DAVID 数据库(https://david.ncifcrf.gov/sum-
将GeneCard、OMIM数据库检索到的宫颈炎的靶点结果
mary.jsp)进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和
合并,去除重复数据,获得宫颈炎相关疾病靶点 1 447
京 都 基 因 与 基 因 组 百 科 全 书(Kyoto encyclopedia of
个。对药物靶点与疾病靶点取交集,得到KSC治疗宫颈
炎的作用靶点 52 个,将结果导入 Cytoscape 3.7.2 软件, genes and genomes,KEGG)通路富集分析。KEGG 通路
获得“药物-成分-靶点”网络(图3)。 富集分析显示,潜在靶点参与了94条通路,主要包括炎
2.3.2 蛋白-蛋白互作网络 将KSC治疗宫颈炎的52个 症反应、免疫调节、激素调节、氧化应激、癌症通路及细
潜在靶点导入 STRING 在线数据库(https://string-db. 胞生长、增殖、凋亡等,其中磷脂酰肌醇-3-激酶(phos-
org/),限定物种为“Homo sapiens”,设置最低置信度为 phoinositide 3 kinase,PI3K)-AKT 通路是最重要的一条
0.9,同时隐藏游离的靶点,将所得靶点的相互作用信息 通路。GO 富集分析共涉及 230 条信息,其中生物学过
导入Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析,构建蛋白-蛋 程184条,主要涉及炎症反应、信号转导、药物反应;细胞
白互作(protein-protein interaction,PPI)网络。利用“An- 组分25条,主要与胞液、细胞核等有关;分子功能21条,
alyze Network”功能对PPI网络进行拓扑学分析,计算各 主要包括调控蛋白激酶、PI3K活性等。
中国药房 2022年第33卷第17期 China Pharmacy 2022 Vol. 33 No. 17 ·2085 ·