Page 30 - 2020年19期
P. 30
3 结果 表1 沙棘活性成分
3.1 沙棘活性成分与其作用靶点 Tab 1 Active constituents of H. rhamnoides
经DL≥0.18、OB≥30%条件筛选,获得沙棘活性成 序号 活性成分名称 OB,% DL
分 33 个,删除无对应靶点信息的活性成分后得到 22 个 MOL001004 天竺葵素(Pelargonidin) 37.99 0.21
活性成分,主要包括多酚及油脂类成分,例如槲皮素、山 MOL010212 14-甲基-α-谷甾醇(14-methyl-alpha-sitosterol) 43.49 0.78
MOL010241 麦角甾醇(Ergostenol) 35.41 0.71
柰酚、异鼠李素、β-胡萝卜素、β-谷固醇等,结果详见表 MOL001979 (3S,5R,10S,13R,14R,17R)-4,4,10,13,14-五甲基-17-[(2R)-6-甲基庚-5- 42.12 0.75
1。22 个活性成分共对应 423 个作用靶点,删除重复靶 烯-2-基] -2,3,5,6,7,11,12,15,16,17-十氢-1H-环戊[a]菲蒽-3-醇(LAN)
点后剩余 213 个作用靶点,包括 AKT1、JUN、MAPK8、 MOL001420 (8S,9S,10R,13R,14S,17R)-17-[((1R,4R)-4-乙基-1,5-二甲基己基] -10, 38.00 0.76
13-二甲基-1,2,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-十二烷基氢化环戊[a]菲蒽
MAPK14等。 (ZINC04073977)
3.2 沙棘活性成分-疾病靶点网络 MOL001494 十八碳-6,9-二烯酸乙酯(Mandenol) 42.00 0.19
由 GeneCards 数据库得到 8 731 个 AD 相关基因,经 MOL001510 24-表氨酯(24-epicampesterol) 37.58 0.71
MOL002268 大黄酸(Rhein) 47.07 0.28
R 语言 Venny 映射,得到 147 个沙棘治疗 AD 的潜在靶
MOL002588 (3S,5R,10S,13R,14R,17R)-17-[(1R)-1,5-二甲基-4-亚甲基己基] -4,4, 42.37 0.77
点。建立的沙棘活性成分-AD靶点网络图中共包括171 10,13,14-五甲基-2,3,5,6,7,11,12,15,16,17-十氢-1H-环戊[a]菲蒽-3-醇
个节点及450条边,其中槲皮素、山柰酚、β-胡萝卜素、异 MOL002773 β-胡萝卜素(β-carotene) 37.18 0.58
MOL000354 异鼠李素(Isorhamnetin) 49.6 0.31
鼠李素、β-谷甾醇、豆甾醇的度值较高,为主要活性成
MOL000358 β-谷甾醇(β-sitosterol) 36.91 0.75
分,结果详见图1(图中,一个活性成分可对应多个靶点, MOL000359 谷甾醇(Sitosterol) 36.91 0.75
如槲皮素对应IL-6、IL-1β、JUN等;一个靶点也可与多个 MOL000422 山柰酚(Kaempferol) 41.88 0.24
活性成分相对应,如JUN对应槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇 MOL000433 (2S)-2-[[[4-[(2-氨基-4-氧代-1H-蝶啶-6基)甲基氨基]苯甲酰基]氨基]戊二 68.96 0.71
酸(FA)
等)。 MOL000449 豆甾醇(Stigmasterol) 43.83 0.76
3.3 PPI网络 MOL000492 (+)-儿茶素 [(+)-catechin] 54.83 0.24
采用 Cytoscape 3.7.1 软件构建的沙棘治疗 AD 靶点 MOL005100 5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯基)苯并-4-酮(5,7-dihydroxy-2- 47.74 0.27
(3-hydroxy-4-methoxyphenyl)chroman-4-one)
PPI网络图共包括129个节点及514条边,图中度值越大 MOL006756 仙人掌固醇(Schottenol) 37.42 0.75
则节点颜色越深。度值排名靠前的靶点有AKT1、JUN、 MOL000073 表儿茶素(Ent-Epicatechin) 48.96 0.24
MAPK1、转 录 因 子 p65 (RELA)、IL-6、MAPK8、 MOL000953 胆固醇(CLR) 37.87 0.68
MOL000098 槲皮素(Quercetin) 46.43 0.28
MAPK14、表皮生长因子受体(EGFR)、c-fos原癌基因蛋
白(FOS),结果详见图2。 分子对接结果显示,沙棘主要活性成分与主要靶点
3.4 分子对接结果 蛋白的结合分值均在4.25以上,部分分值超过5.0、接近
图1 沙棘活性成分-AD靶点网络图
Fig 1 Network of ingredients of H. rhamnoides-AD target
·2328 · China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 19 中国药房 2020年第31卷第19期