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型偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)和正交偏最小二 确定|r|=0.754(n=6)作为代谢物变化是否具有显著性
乘法-判别分析(OPLS-DA),其中非监督型 PCA 可用以 差异的阈值(P<0.05),即当 r>0.754 或 r<-0.754 时,
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绘制所有样品的 H-NMR 代谢轮廓;监督型 PLS-DA 可 该代谢物组间比较差异有统计学意义 ;在此基础上,结
用以分析 NMR 数据(X 变量)和分组信息(Y 变量)之间 合人类代谢组数据库(HMDB)和相关文献 [8-11] ,最终确
的相关性,可通过 200 次置换试验对模型的有效性进行 定差异性代谢物。
验证;OPLS-DA则有助于辨别不同组间的主要代谢物, 3 结果
最大化地反映模型内部不同组别之间的差异,以寻找出 3.1 CⅡⅡ-3对MFC荷瘤小鼠瘤体的影响
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具有特征性的差异性代谢物 。根据 OPLS-DA 的相关 与模型组比较,CⅡ-3组荷瘤小鼠的瘤体明显减小,
系数结果,通过 Pearson 相关系数(r)显著性差异检测, 详见图1。
模型组
CⅡ-3组
图1 两组荷瘤小鼠瘤体的照片
Fig 1 Photographs of tumor body in tumor-bearing mice of 2 groups
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3.2 小鼠肝组织的 H-NMR图谱分析 见图3。由图3 可见,模型组和CⅡ-3组均呈现出良好的
两组小鼠的 H-NMR图谱存在一定差异。依据δ值、 聚类趋势,说明模型组与CⅡ-3组小鼠整体代谢轮廓可
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HMDB和相关文献 [8-11] 对上述代谢进行分析,共指认出6 很好的区分。模型的质量可以R X和Q 进行评价,其中
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个潜在的差异性代谢物,分别为精氨酸、羟脯氨酸、糖 R X表示可解释变量,Q 表示模型的可预测度 。非监督
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原、丙酮酸、肌苷、烟酰胺,涉及精氨酸代谢、能量代谢和 型PCA模型拟合参数(R X)为0.73,Q 为0.58,表明建立
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核酸代谢。两组荷瘤小鼠肝组织的 H-NMR 图谱见 的数据模型比较可靠 。
图2。 模型组
0.6 CⅡ-3组
0.4
8
0.2
模型组
0
6 t[2]
-0.2
% -0.4
relative intensity, 4 -0.6
-0.8
-1 -0.8 -0.4 0 0.2 0.4 0.6 0.8
2 t[1]
CⅡ-3组
图3 非监督型PCA分析散点图
0 Fig 3 Unsupervised PCA analysis scatter diagram
10 8 6 4 2 0
δ,ppm 3.3.2 监督型PLS-DA分析 监督型PLS-DA数据模型
图2 两组荷瘤小鼠肝组织的 H-NMR图谱 的 200 次 置 换 检 验 图 见 图 4。 由 图 4 所 示 ,R =(0,
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Fig 2 1 H-NMR spectra of liver tissue in tumor- 0.785),Q =(0,-0.085 1),图中累积的 R 、Q 均小于原
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bearing mice of 2 groups 始值,且 Q 在 Y 轴上有负截距,提示数据模型成立且有
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3.3 小鼠肝组织 H-NMR的多元统计分析 较好的预测能力 。
3.3.1 非监督型PCA分析 非监督型PCA分析散点图 3.3.3 OPLS-DA 分析 OPLS-DA 分析散点图见图 5。
·1448 · China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 12 中国药房 2020年第31卷第12期