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胃溃疡的作用。与胃溃疡相关的 KEGG 通路富集信息
见表4。
表3 高良姜活性成分和胃溃疡共同靶点及其拓扑学属
性信息
Tab 3 Information of common targets and their topo-
logical properties of active ingredients of A. of-
ficinarum and gastric ulcer
序号 靶点蛋白(英文名称) 编码基因 UniProt识别码 度值 介数
1 前列腺素G/H合酶2(Prostaglandin G/H synthase 2) PTGS2 P35354 31 60.4
2 血管内皮生长因子A(Vascular endothelial growth factor A) VEGFA P15692 31 76.4
3 白细胞介素6(Interleukin-6) IL6 P05231 31 60.4
4 白细胞介素1β(Interleukin-1 beta) IL1B P01584 27 23.9
5 C-C基序趋化因子2(C-C motif chemokine-2) CCL2 P13500 27 23.8
6 基质金属蛋白酶9(Matrix metalloproteinase-9) MMP9 P14780 26 22.9
7 Myc原癌基因蛋白(Myc proto-oncogene protein) MYC P01106 26 62.5
8 前表皮生长因子(Pro-epidermal growth factor) EGF P01133 24 13.7
9 表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor) EGFR P00533 24 24.0
10 72 kDa Ⅳ型胶原酶(72 kDa type Ⅳ collagenase) MMP2 P08253 23 9.3 图2 高良姜活性成分和胃溃疡共同靶点的PPI网络
11 缺氧诱导因子1α(Hypoxia-inducible factor-1alpha) HIF1A Q16665 22 20.3 Fig 2 PPI network of common targets of active ingre-
12 一氧化氮合酶3(Nitric oxide synthase,endothelial) NOS3 P29474 22 13.1 dients of A. officinarum and gastric ulcer
13 雌激素受体1(Estrogen receptor-1) ESR1 P03372 21 20.0
14 过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome prolifer- PPARG P37231 21 9.2 氧化应激反应
ator-activated receptor-gamma) 活性氧代谢过程
炎症反应调节 P
15 纤溶酶原激活物抑制剂1(Plasminogen activator inhibitor-1) SERPINE1 P05121 21 5.5 活性氧反应
对氧水平的反应 1×10 -9
16 白细胞介素2(Interleukin-2) IL2 P60568 20 14.5 细胞对氧化应激的反应 2×10 -9 -9
3×10
17 血管细胞黏附蛋白1(Vascular cell adhesion protein-1) VCAM1 P19320 20 6.2 凋亡信号通路的调控 4×10 -9
凋亡信号通路的负调控
18 髓过氧化物酶(Myeloperoxidase) MPO P05164 20 7.8 内在凋亡信号通路的调控
19 基质溶素1(Stromelysin-1) MMP3 P08254 19 3.7 细胞对活性氧的反应
0 5 10
20 B淋巴细胞瘤2样蛋白1(Bcl-2-like protein-1) BCL2L1 Q07817 18 65.3
基因数
21 可诱导一氧化氮合酶(Nitric oxide synthase,inducible) NOS2 P35228 17 6.3 A. 生物过程(前10个)
22 受体酪氨酸蛋白激酶 erbB-2(Receptor tyrosine-protein ERBB2 P04626 17 5.2 蛋白磷酸酶结合
kinase erbB-2) Bcl-2同源域结合
死亡域结合
23 E选择素(E-selectin) SELE P16581 16 1.3 磷酸酶结合 P
24 超氧化物歧化酶1(Superoxide dismutase) SOD1 P00441 16 12.1 生长因子受体结合 0.000 5
血红素结合 0.001 0
25 C反应蛋白(C-reactive protein) CRP P02741 16 1.6 四吡咯结合 0.001 5
抗氧化活性
26 尿激酶型纤溶酶原激活剂(Urokinase-type plasminogen PLAU P00749 15 0.9 细胞因子活性
activator) 核受体活性
27 核因子 E2相关因子 2(Nuclear factor erythroid 2-related NFE2L2 Q16236 14 1.6 0 2 4 6
factor-2) 基因数
28 雌激素受体2(Estrogen receptor beta) ESR2 Q92731 10 0.3 B.分子功能(前10个)
29 前列腺素G/H合酶1(Prostaglandin G/H synthase-1) PTGS1 P23219 10 2.1 血小板 α 粒腔
30 干扰素调节因子1(Interferon regulatory factor-1) IRF1 P10914 10 0.3 线粒体外膜 P
31 凋亡调节剂Bcl-2(Apoptosis regulator Bcl-2) BCL2 P10415 7 8.9 囊腔
0.009 637 51
32 前列腺素E2受体EP3亚型(Prostaglandin E2 receptor EP3 PTGER3 P43115 6 0.5 小窝
subtype) 细胞器外膜
33 凋亡调节剂BAX(Apoptosis regulator BAX) BAX Q07812 5 6.1 外膜
34 腺瘤性息肉病大肠杆菌蛋白(Adenomatous polyposis coli APC P25054 4 0 0 1 2 3 4 5
protein) 基因数
35 Bcl-2相关的细胞凋亡激动剂(Bcl-2-associated agonist of BAD Q92934 3 0 C. 细胞组分(共6个)
cell death) 图3 GO功能富集的可视化柱状图
3.7 “活性成分-靶点-通路”网络分析 Fig 3 Visual histograms of GO functions enrichment
基于“3.6”项下的 5 条信号通路构建“活性成分-靶 皮素、芹菜素、山柰酚和高良姜素,提示这些成分可能是
点-通路”网络,见图5(图中,外圈为活性成分,中间圈为 高良姜治疗胃溃疡的物质基础;连接活性成分和通路较
靶点,最内圈为信号通路)。由图5可见,该网络中共有 多 的 靶 点 是 PTGS2、NOS2、BCL2、IL6、VEGFA、IL1B、
43 个节点(包括 15 个活性成分、23 个靶点、5 条通路)和 MMP9、BCL2L1,提示这些靶点可能是高良姜治疗胃溃
98 条边。节点越大表示其连接的化合物或者靶点或者 疡的关键靶点,与“3.4”项下 PPI 网络分析结果基本一
通路越多 。该网络中,作用靶点较多的活性成分是槲 致。由此可见,高良姜中的槲皮素、芹菜素、山柰酚、高
[11]
中国药房 2020年第31卷第12期 China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 12 ·1443 ·