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2.6 “活性成分-靶点-通路”网络的构建 3.3 活性成分和胃溃疡的共同靶点
整理富集在与胃溃疡相关通路的靶点，找出作用于 将高良姜活性成分的作用靶点和胃溃疡相关的靶
这些靶点的活性成分，以节点表示活性成分、靶点、通 点通过 Venny2.1 软件筛选，得到共有靶点 35 个。这些
路，以边表示某个活性成分作用于某个靶点或某个靶点 靶点既是高良姜活性成分的作用靶点，也是胃溃疡的相
与某条通路的关联，建立三者的相互作用关系，将文件 关靶点，提示高良姜可能通过上述35个共有靶点发挥治
数据导入Cytoscape 3.7.1软件中，绘制“活性成分-靶点- 疗胃溃疡的作用。高良姜活性成分作用靶点和胃溃疡
通路”网络，并使用该软件的“CytoNCA”插件对该网络 相关靶点的韦恩图见图1，靶点信息见表3。
进行节点度数的拓扑学属性分析，明确高良姜治疗胃溃 活性成分作用靶点 胃溃疡相关靶点

疡多成分、多靶点、多通路的物质基础和分子作用机制。
3 结果

3.1 高良姜活性成分和作用靶点 174 35 160
从 TCMSP、TCMID 数据库中共得到高良姜活性成
分16个。此外，经文献挖掘和整理，发现黄酮类成分在
治疗胃溃疡方面有一定数量的研究报道，因此将 OB 值 图1 高良姜活性成分作用靶点和胃溃疡相关靶点的韦
未达标但研究证据较多的槲皮素-3-O-甲基、鼠李柠檬素 恩图
和芹菜素也一并纳入。最终，本研究筛选出活性成分19 Fig 1 Venn diagram of related targets of active ingre-
个，高良姜主要活性成分见表 2。将上述活性成分输入 dients of A. officinarum and gastric ulcer
到 TCMSP 数据库中查询作用靶点，最终获得其作用靶 3.4 共同靶点PPI网络分析
点209个。 共同靶点PPI网络中共有节点35个，边320条；平均
表2 高良姜主要活性成分 节点度值为18，平均介数为16.9。其中，节点表示靶点，
Tab 2 Information of main active ingredients of A. 边表示靶点与靶点的相互作用关系；度值反映节点与其
officinarum 他节点的连接数目，度值越大，节点越大；介数是网络中
序号 化合物编号 化合物（英文名称） OB，％ DL 所有最短路径中经过该节点的路径数目与最短路径总
1 MOL001771 多孔甾-5-烯-3β-醇（Poriferast-5-en-3beta-ol） 36.91 0.75 数之比 。本研究以网络中度值和介数均不小于平均
[11]
2 MOL002543 （2S，3R）-2-（3，4-二甲氧基苯基）-5，7-二甲氧基苯并吡喃-3-醇[2S， 51.89 0.37
[11]
3R）-2-（3，4-dimethoxyphenyl）-5，7-dimethoxychroman-3-ol] 值的靶点作为高良姜治疗胃溃病的关键靶点 。结果，
3 MOL002544 1，7-双苯-5-羟基-3-庚酮（1，7-diphenyl-5-hydroxy-3-heptanone） 61.90 0.18 该 PPI 网络中共有关键靶点 11 个，分别是 PTGS2、VEG-
4 MOL002554 5-甲氧基-1，7-双苯-3-庚酮（5-methoxy-1，7-diphenyl-3-heptanone） 68.29 0.20
5 MOL002556 7-甲氧基-8-（2′-乙氧基-3′-羟基-3′-甲基丁基）-香豆精[7-meth- 40.36 0.21 FA、IL6、IL1B、CCL2、MMP9、MYC、EGFR、HIF1A、ESR1、
oxy-8-（2′-ethoxy-3′-hydroxy-3′-methybutyl）-coumarin] BCL2L1。活性成分和胃溃疡共同靶点拓扑学属性信息
6 MOL002575 邻苯二甲酸丁基酯2-乙基己基酯（Butyl-2-ethylhexyl phthalate） 44.52 0.22 见表3，PPI网络图见图2（图中，内圈为核心靶点）。
7 MOL002563 高良姜素（Galangin） 45.55 0.21
8 MOL002565 美迪紫檀素（Medicarpin） 49.22 0.34 3.5 共同靶点GO功能富集分析
9 MOL000354 异鼠李素（Isorhamnetin） 49.60 0.31 共同靶点在生物过程中富集了 848 个 GO 功能，主
10 MOL000358 β-谷甾醇（Beta-sitosterol） 36.91 0.75
11 MOL000359 谷甾醇（Sitosterol） 36.91 0.75 要富集于氧化应激反应、炎症反应调节、活性氧代谢过
12 MOL000422 山柰酚（Kaempferol） 41.88 0.24 程/反应、凋亡信号通路的调控等；在分子功能中富集了
13 MOL000098 槲皮素（Quercetin） 46.43 0.28 32 个 GO 功能，主要富集于蛋白磷酸酶结合、生长因子
14 MOL000230 乔松素（Pinocembrin） 57.56 0.20
15 MOL004564 山柰素（Kaempferide） 73.41 0.27 受体结合、血红素结合、抗氧化活性等以及在细胞组分
16 MOL004093 杜鹃黄素（Azaleatin） 54.28 0.30 中富集于血小板 α颗粒腔、线粒体外膜、囊腔、细胞器外
17 MOL002566 槲皮素-3-O-甲基（3-O-methylquercetin） 10.10 0.30
18 MOL000251 鼠李柠檬素（Rhamnocitrin） 12.90 0.27 膜等（P＜0.01），以P值从小到大排序，详见图3。
19 MOL000008 芹菜素（Apigenin） 23.06 0.21 3.6 共同靶点KEGG通路富集分析
3.2 胃溃疡相关靶点 设置 P＜0.01，共得到共同靶点参与的信号通路 73
以“Gastric ulcer”为关键词，在 TTD（4 个）、CTD（18 条，以 P 值从小到大排序，前 25 条富集显著的 KEGG 通
个）、OMIM（25个）、PubMed（106个）、DrugBank（16个）、 路气泡图见图4。
DisGeNet（94 个）数据库中共检索到与胃溃疡相关的靶 通过分析图 4 中的通路，发现与胃溃疡相关的信号
点263个；经整理并删除重复项后，最终获得与胃溃疡相 通路有PI3K/Akt、HIF-1、TNF、IL-17、NF-κB [12-20] 等通路，
关的靶点195个。 提示高良姜主要是通过调控这5条信号通路而起到治疗

·1442 · China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 12 中国药房 2020年第31卷第12期