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shows anti-gastric ulcer effect with the characteristics of multi-ingredient，multi-target and multi-path.
        KEYWORDS    Network pharmacology；Alpinia officinarum；Gastric ulcer；Active ingredients；Mechanism


            胃溃疡（Gastric ulcer）是一种常见的消化系统疾病，                      表1 本研究所用数据库、软件和在线工具
        其主要发病原因是胃黏膜防御、修复因子与进攻因子失                           Tab 1 Database，software and online tools used in
          [1]
        衡 。导致失衡的因素有以下 4 个：一是幽门螺旋杆菌                                 this study
        感染；二是长期服用对胃黏膜有损害的药物；三是饮酒                           数据库/软件/在线工具           网址                 功能
                            [2]
        或吸烟；四是精神因素 。现代医学提出了“无酸无溃                           中 药 系 统 药 理 学 分 析 平 台（Traditional http：//tcmspw.com/tcmsp.php  活性成分筛选和
                                                           Chinese Medicine Systems Pharmacology    靶点预测
        疡”的治疗观点，目前抗酸或抑酸类药物是治疗胃溃疡                           Database and Analysis Platform，TCMSP）
        的常规药物，该类药物虽然治愈率高，但停药后患者复                           中药综合数据库（Traditional Chinese Medi- http：//119.3.41.228：8000/tcmid/
                                                           cines Integrated Database，TCMID）
        发率也高 。近年来，学者们广泛开展的中医药治疗胃
                [3]
                                                           中国知网                  https：//www.cnki.net
        溃疡的临床研究表明，中医药疗法具有疗效显著、复发                           TTD（Therapeutic Target Database）  http：//db.idrblab.net/ttd/  胃溃疡靶点预测
                             [4]
        率低、毒副作用小等优势 。                                      CTD（Comparative Toxicogenomics Database） http：//ctdbase.org/
                                                           OMIM（Online Mendelian Inheritance in Man） https：//www.omim.org/
            高良姜（Alpiniae Officinarum Rhizome）出自《名医
                                                           PubMed数据库             https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
        别录》，为姜科植物高良姜（Alpinia officinarum Hance）的           DrugBank数据库           https：//www.drugbank.ca/
        干燥根茎。本品性热、味辛，具有温胃散寒、消食止痛的                          DisGeNet数据库           https：//www.disgenet.org/
                                                           UniProt数据库            https：//www.uniprot.org/  蛋白编码基因名
        功效，常用于治疗脘腹冷痛、胃寒呕吐、嗳气吞酸等                                                                     称校正
          [5]
        症 。现代研究表明，高良姜中主要含有黄酮类、二苯基                          Venny 2.1软件           https：//bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/ 绘制共同靶点图
                                                           STRING数据库             https：//string-db.org/  蛋白质相互作用
        庚烷类及挥发油类成分；除传统疗效外，还具有抗肿瘤、
                                                           Cytoscape 3.7.1软件                        绘制网络图
        抗氧化、抗病毒、抗菌、治疗胃溃疡和保护胃黏膜等作                           ClusterProfiler R功能包                     靶点富集分析
        用 。目前对高良姜治疗胃溃疡作用机制有一些报道，                           2.2  胃溃疡相关靶点的预测
          [6]
        如魏娜等 通过实验推测，高良姜水提物可能通过抑制                               在 TTD、CTD、OMIM、PubMed、DrugBank、DisGeN-
                [7]
                                                [8]
        炎症因子分泌起到治疗胃溃疡的作用；江涛等 研究发                           et 等数据库中以“Gastric ulcer”为关键词检索与疾病相
        现，高良姜总黄酮治疗胃溃疡的机制可能与抗氧化、清                           关的潜在作用靶点，经整理并删除重复项后，最终获得
        除自由基有关，但是这些单一靶点或者单一通路的研究                           胃溃疡的相关靶点。
        难以全面解释中药多组分-多靶点-多通路的协同作用机                          2.3  共同靶点的筛选
        制。基于现有文献，本研究借助英国药理学家 Hopkins                           将“2.1”“2.2”项下所得靶点导入 Venny 2.1 软件中
        AL于2007年提出的“网络药理学”研究方法 ，通过构建                       绘制韦恩图，所获得的交集靶点即为高良姜活性成分与
                                             [9]
        化合物与靶点、靶点与疾病的相互作用网络，探讨高良                           胃溃疡的共同靶点。
        姜治疗胃溃疡的潜在活性成分、作用靶点和信号通路，                           2.4  共同靶点相互作用网络的构建
        以期为该药治疗胃溃疡作用机制的进一步研究提供理                                将“2.3”项下所得共同靶点导入STRING数据库，选
        论依据和新的思路。                                          择物种“Homo sapiens”，最低相互作用分值设为“Medi-
        1 资料                                               um confidence（0.400）”，获取相互作用关系。将相互作
            本研究所用数据库、软件和在线工具见表1。                           用关系的 TSV 格式数据导入 Cytoscape 3.7.1 软件中绘
        2 方法                                               制蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络，并使用该软件的“Cy-
        2.1 高良姜活性成分的筛选和作用靶点的预测                             toNCA”插件对该网络进行节点度值、介数 的拓扑学属
                                                                                               [10]
            在 TCMSP 和 TCMID 数据库中以“高良姜”为关键                  性分析，明确PPI网络中的关键靶点。
        词 检 索 高 良 姜 的 化 学 成 分 ，使 用 口 服 生 物 利 用 度           2.5  共同靶点基因本体（GO）功能和 KEGG 通路富集
       （OB）≥30％和类药性（DL）≥0.18 为条件进行筛选，同                     可视化分析
        时在中国知网和PubMed数据库中以“高良姜”“胃溃疡”                           本研究使用 ClusterProfiler R 功能包对共同靶点进
        为关键词查阅文献，将已有报道化学成分一并纳入本研                           行 GO 功能和 KEGG 通路富集分析，对显著富集（P＜
        究。整理并删除重复项后，将整理好的活性成分导入                            0.01）的功能和通路制作可视化柱状图和气泡图。P 值
        TCMSP 数据库中获取潜在作用蛋白，并使用 UniProt 数                   越小，说明在该功能富集越显著。GO 功能可以分析靶
        据库提取所有蛋白的基因名称，选择物种“Homo sapi-                      点参与的生物学功能，包括生物过程、分子功能以及细
        ens”，最终获得高良姜活性成分的作用靶点。                             胞组分；KEGG通路可以分析靶点参与的代谢通路。


        中国药房    2020年第31卷第12期                                            China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 12  ·1441  ·
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