Page 47 - 2020年1月第31卷第2期
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表6 “五味麝香丸-真布病-靶标-通路网络”靶标的节点
度值
Tab 6 Target node degree values of Wuwei shexiang
pills-“Grum bu”disease-target-pathway net-
work
序号 靶标 节点度值 序号 靶标 节点度值
1 TNF 28 8 GNAS 9
2 FAS 21 9 TCF3 7
3 IL6 20 10 TNFSF11 7
4 IL10 18 11 BDKRB2 7
5 FASLG 17 12 ALOX5 6
6 PTGS2 13 13 TRPV1 6
7 IL1B 11 14 TNFAIP3 6
化合物主要通过范德华力和氢键的方式与这两个靶标
结合。
百里酚与FAS、IL1B的结合亲和力较强,Glide score
图4 五味麝香丸-“真布”病-靶标-通路网络 分别为-4.231、-6.383,其绝对值分别大于FAS自身配
Fig 4 Wuwei shexiang pills-“Grum bu”disease-tar- 体和 IL1B 阳性对照药米诺环素的 Glide score(-4.012、
get-pathway network
-4.954)绝对值。从 2D 和 3D 构象可见,百里酚可与
别为-5.932、-6.703,且该化合物与 IL6 结合的 Glide FAS中的氨基酸残基Arg55形成Pi-cation键、与Gly66形
score 绝对值大于 IL6 阳性对照药穿心莲内酯的 Glide 成氢键;与IL1B中的Lys65形成氢键;此外,由于各键定
score(-4.283)绝对值。从 2D 和 3D 构象可见,奎宁酸 向力(如结构中羟基、氨基等强吸电子基或苯环等供电
可分别与 FASLG、IL6 的 Loop 区中的氨基酸残基形成 6 子基)的差异,导致化合物在结合区域中的位置构型发
个氢键,并完全处于两个靶标的疏水Loop区内,表明该 生了一定的变化,从而影响整个蛋白的构型。
表7 五味麝香丸有效成分与“真布”病核心靶标对接的Glide score
Tab 7 Glide scores of Wuwei shexiang pills effective component-core targets of“Grum bu”disease docking
有效成分(英文名称) FASLG IL6(穿心莲内酯:-4.283) FAS(自身配体:-4.012) PTGS2(自身配体:-10.182) TNF(自身配体:-6.954) IL10 IL1B(米诺环素:-4.954)
奎宁酸(Quinic acid) -5.932 -6.703 -3.876 -6.056 -5.082 - -5.271
异丁香酚甲醚(Methyl isoeugenol) -5.010 -4.665 -2.767 -6.122 -5.239 -5.035 -4.476
5α-雄甾烷二酮(5α-androstane-3,17-dione) -5.526 -4.208 - -6.916 -5.960 -4.903 -4.492
α-荜澄茄烯(α-cubebene) -4.620 -3.982 - -7.009 -5.887 -5.463 -4.761
雄烯二酮(Androstenedione) -5.326 -4.303 - -7.094 -5.905 -4.914 -5.059
2α,19α,23-三羟基齐墩果酸(Arjungenin) - -3.183 - -3.591 -5.152 -3.498 -3.289
裂叶苣荚莱内酯(Balchanin) -4.192 -3.790 - -6.799 -5.820 -5.564 -4.130
β-细辛脑(β-asarone) -4.494 -4.057 -3.156 -6.343 -5.488 -5.441 -5.316
β-石竹烯(β-caryophyllene) -4.731 -4.056 - -5.967 -6.117 -5.491 -4.475
β-古芸烯(β-gurjunene) -4.619 -3.949 -2.808 -6.570 -5.723 -5.458 -4.549
邻苯二酚(Catechol) -5.371 -5.473 -4.062 -5.815 -5.387 -4.613 -5.045
胆固醇(Cholesterol) -4.065 -2.984 - -6.201 -6.137 -5.092 -4.028
环阿屯醇(Cycloartenol) -3.362 -2.969 - -6.271 -5.599 -5.338 -3.331
去氢表雄酮(Dehydroepiandrosterone) -5.639 -4.428 - -7.313 -6.821 -5.841 -4.645
榄香素(Elemicin) -3.973 -4.264 -2.737 -5.743 -5.326 -5.287 -4.783
γ-细辛醚(γ-sarone) -4.241 -3.903 -3.337 -6.193 -5.570 -5.127 -4.590
愈创木酚(Guaiacol) -5.208 -5.356 -3.770 -5.997 -5.443 -5.368 -5.032
愈创醇(Guaiol) -5.647 -4.098 - -5.418 -6.372 -5.437 -5.355
异菖蒲酮(Isoacoramone) -4.902 -5.368 -2.850 -6.518 -5.413 -3.840 -5.639
异石竹烯(Isocaryophyllene) -4.346 -3.818 - -6.356 -6.138 -5.670 -4.430
白桦脂酸(Mairin) -3.029 -1.899 - -5.163 -5.114 -4.758 -3.143
甲基丁香酚(Methyleugenol) -4.472 -4.187 -2.705 -5.626 -4.870 -4.990 -4.474
诺卡酮(Nootkatone) -5.431 -3.488 - -6.410 -5.579 -6.428 -5.302
β-谷甾醇(β-sitosterol) -3.651 -2.179 - -5.508 -5.837 -4.965 -4.011
豆甾醇(Stigmasterol) -4.071 - - -5.798 -6.216 -6.022 -3.933
百里酚(Thymol) -5.820 -5.206 -4.231 -6.627 -6.242 -5.675 -6.383
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