Page 46 - 2020年1月第31卷第2期
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活性、花生四烯酸结合等为主;细胞部位以胞外区、细胞 表5 五味麝香丸-“真布”病-基因的KEGG通路富集分
核、细胞外间隙等为主,其中富集基因数较多的15条生 析结果
物学功能见表4。 Tab 5 KEGG pathway enrichment results of Wuwei
shexiang pils-“Grum bu”disease-gene
信号通路(英文名称) P 富集基因
TNF信号通路(TNF signaling pathway) 1.7×10 -5 IL6、NOD2、TNF、PTGS2、FAS、TNFAIP3
癌症通路(Pathways in cancer) 5.9×10 -3 IL6、PTGS2、FASLG、GNAS、BDKRB2、FAS
细 胞 因 子 - 细 胞 因 子 - 受 体 相 互 作 用 3.2×10 -4 IL6、TNF、TNFSF11、FASLG、FAS、IL10
(Cytokine-cytokine-receptor interaction)
查加斯病(Chagas disease) 1.6×10 -5 IL6、TNF、FASLG、GNAS、FAS、IL10
非洲锥虫病(African trypanosomiasis) 3.1×10 -5 IL6、TNF、FASLG、FAS、IL10
叉头框转录因子 O 亚族信号通路(FoxO 6.9×10 -4 IL6、RAG1、FASLG、RAG2、IL10
signaling pathway)
阿米巴病(Amoebiasis) 2.7×10 -4 IL6、TNF、GNAS、IL10、COL5A1
NF-κB 信号通路(NF-kappa B signaling path- 2.6×10 -3 TNF、TNFSF11、PTGS2、TNFAIP3
way)
图3 五味麝香丸“组方-药性-疾病”网络 炎症性肠病(Inflammatory bowel disease) 8.6×10 -4 IL6、NOD2、TNF、IL10
Fig 3 Network diagram of“formulation-property-di- 结节样受体信号通路(NOD-like receptor 4.5×10 -4 IL6、NOD2、TNF、TNFAIP3
signaling pathway)
sease”of Wuwei shexiang pills 移植物抗宿主病(Graft-versus-host disease) 1.5×10 -4 IL6、TNF、FASLG、FAS
表4 五味麝香丸-“真布”病-基因的GO分析结果 同种异体排斥反应(Allograft rejection) 1.9×10 -4 TNF、FASLG、FAS、IL10
麻疹(Measles) 7.8×10 -3 IL6、FASLG、FAS、TNFAIP3
Tab 4 GO analysis results of Wuwei shexiang pills-
1型糖尿病(Type 1 diabetes mellitus) 7.1×10 -3 TNF、FASLG、FAS
“Grum bu”disease-gene 自身免疫性甲状腺疾病(Autoimmune thyroid 1.1×10 -2 FASLG、FAS、IL10
disease)
类别 基因功能 富集基因,个 P
生物学过程 免疫反应 6 9.0×10 -5 鸟苷酸结合蛋白活性刺激肽,PIK3R1为磷脂酰肌醇3激
炎症反应 5 9.3×10 -4
RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的阳性调控 5 1.9×10 -2 酶调节亚基 1,TNFSF11 为肿瘤坏死因子配体成员 11,
参与凋亡过程的半胱氨酸型内肽酶活性的激活 4 7.4×10 -5 COMT 为咖啡酸-O-甲基转移酶,LRRC8A 为富含亮氨
核因子κB(NF-κB)活性的阳性调节 3 1.3×10 -2 酸重复蛋白 8A,TCF3 为 T 细胞因子 3,RAG1、RAG2 为
固有免疫应答 3 6.0×10 -2
质膜外侧 3 2.4×10 -2 重组激活基因蛋白亚型,TNFAIP3 为肿瘤坏死因子α诱
分子功能 细胞因子活性 6 8.5×10 -6 导蛋白3,HPRT1为次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶1,
花生四烯酸结合 3 3.4×10 -5
蛋白质同二聚化活性 3 1.3×10 -2 APOE 为载脂蛋白 E,GDF5 为生长分化因子 5,TRPV1
肿瘤坏死因子受体结合 2 1.7×10 -2 为瞬时受体电位香草酸受体 1,PTPN2 为非受体型蛋白
细胞部位 胞外区 12 1.3×10 -4
细胞核 11 5.6×10 -3 酪氨酸磷酸酶2,S100A8、S100A9为血清S100钙结合蛋
细胞外间隙 10 1.1×10 -5 白A8、A9,ALOX5AP 为5-脂氧合酶激活蛋白,COL1A1
细胞表面 3 9.5×10 -2
为胶原蛋白Ⅰ,PLA2G1B 为磷脂酶 A2ⅠB,COL5A1 为
2.2.2 五味麝香丸-“真布”病-基因的KEGG通路富集分 人Ⅴ型胶原α1 链,ALOX5 为人花生四烯酸 5-脂加氧
析结果 两者共同靶标共筛选出KEGG富集通路33条, 酶)。由图4可见,该网络共含共同靶标相应有效成分、
其中 P<0.05 的有 31 条。肿瘤坏死因子(TNF)信号通 靶标、通路等节点94个、边460条。
路、癌症通路、细胞因子-细胞因子-受体相互作用等 15 “五味麝香丸-真布病-靶标-通路网络”靶标的节点
条通路富集的基因数≥3,详见表 5(按富集基因数量由 度值详见表6。由表6可见,TNF、FAS、IL6、IL10的节点
多到少排列)。 度值较高,可能是五味麝香丸治疗“真布”病的核心靶标。
2.2.3 五味麝香丸-“真布”病-靶标-通路网络 构建的 2.3 分子对接结果
五味麝香丸-“真布”病-靶标-通路网络详见图 4(图中, 选择网络节点度值≥11 的 7 个核心靶标(TNF、
“▲”表示有效成分,“◆”表示靶标蛋白,“●”表示通路; FAS、IL6、IL10、FASLG、PTGS2、IL1B)与五味麝香丸的
MIF 为巨噬细胞移动抑制因子,FAS、FASLG 为自杀相 29 种有效成分进行分子对接,结果见表 7(表中,“-”表
关因子及其配体超家族成员6,IL1B、IL10、IL6为白细胞 示无对应Glide score;有3种成分Glide score的绝对值小
介素亚型,BDKRB2 为缓激肽 B2 受体,NOD2 为核苷酸 于自身配体或小于 5,故未列出)、图 5(对接结果以
结合寡聚域样受体 2,SLC22A6 为人类有机阴离子转运 Glide score绝对值最高的为例)。
蛋白 1,PTGS2 为前列腺素内过氧化物合酶 2,GNAS 为 奎宁酸可与FASLG、IL6很好地结合,Glide score分
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