Page 51 - 《中国药房》2023年13期
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3.2.3 GO功能富集和KEGG通路富集分析结果 3.2.4 分子对接结果
通过GO功能富集共得到248个条目(P<0.01)。结 选择综合排名前 5 位的关键蛋白与“化学成分-靶
果显示,生物过程(biological process,BP)主要涉及细胞 点-疾病”网络的中心度值、亲中心度值及等级值综合排
对化学应激的反应(cellular response to chemical stress)、 名前12位的化学成分进行分子对接。结果显示,化学成
对氧化应激的反应(response to oxidative stress)等;细胞 分与核心靶点结合活性较好,其中化学成分白桦脂酸
组成(cell composition,CC)主要涉及膜筏(membrane (mairin)、lappadilactone、木香烃内酯(costunolide)、去氢
raft)、膜微域(membrane microdomain)等;分子功能(mo‐ 木香内酯(dehydrocostus lactone)等成分与核心靶点 IL-
lecular function,MF)主要涉及细胞因子受体结合(cyto‐ 1β(PDB 编号 lilb)、TNF(PDB 编号 4k8u)、AKT1(PDB
kine receptor binding)、DNA 结合转录因子结合(DNA-
编号7nh4)、TP53(PDB编号4xzs)、IL-6(PDB编号2e43)
binding transcription factor binding)等,详见图3A。通过
结合活性较高,可能是治疗肠炎的主要成分,详见图4。
KEGG通路富集分析共得到153条信号通路(P<0.01),主
IL-1β TNF AKT1 TP53 IL-6
要涉及促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)信号通路 sanguinarine -7.76 -7.31 -6.87 -8.07 -7.68
(MAPK signaling pathway)、TNF 信号通路(TNF signal‐ dihydrochelirubine -7.97 -7.40 -7.66 -7.37 -7.51
ing pathway)、IL-17 信号通路(IL-17 signaling pathway)、 dihydrochelerythine -7.30 -6.67 -6.51 -6.52 -6.39
缺氧诱导因子1(hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)信号通 stigmasterol -8.64 -7.21 -7.92 -8.52 -8.00
路(HIF-1 signaling pathway)等,详见图 3B。该结果提 sitosterol -8.59 -7.56 -8.10 -7.46 -7.80
示,WZDK 中的化学成分可协同作用于多条信号通路, mairin -9.24 -9.29 -8.13 -6.98 -7.11
lappadilactone -9.47 -8.92 -7.95 -8.67 -6.25
调控细胞因子受体结合、对化学应激的反应等,从而起
chelamidine -7.10 -7.35 -6.40 -7.76 -6.45
到治疗肠炎的作用。
(S)-Stylopine -7.90 -7.53 -7.24 -7.16 -7.08
cellular response to chemical stress
response to oxidative stress poriferast-5-en-3beta-ol -8.62 -7.51 -6.83 -8.31 -7.61
cellular response to oxidative stress
response to lipopolysaccharide
response to molecule of bacterial origin costunolide -9.02 -8.93 -7.49 -6.03 -8.69
epithelial cell proliferation
reactive oxygen species metabolic process Count
response to reactive oxygen species 5 dehydrocostus lactone -8.58 -8.94 -6.89 -6.59 -9.03
regulation of reactive oxygen species metabolic process 10
cellular response to reactive oxygen species 15
membrane raft 20 注:对接分数越小则结合能越大,在图中颜色越深。
membrane microdomain 25
membrane region
vesicle lumen 30 图4 分子对接结合能分数色阶图
cyloplasmic vesicle lumen 35
secretory granule lumen
caveola
plasma membrane raft qvalue 3.3 体内实验验证结果
protein kinase complex
cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex 0.000 025
cytokine receptor binding 0.000 050 3.3.1 WZDK对小鼠一般状况及DAI评分的影响
DNA-binding transcription factor binding 0.000 075
RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding 0.000 100
cytokine activity 0.000 125 采用 4%DSS 诱导构建小鼠急性肠炎模型期间,正
ubiquitin-like protein ligase binding
phosphatase binding
protein tyrosine kinase activity 常对照组小鼠的粪便形态未见明显异常,其余各组小鼠
sterold binding
nuclear receotor actiyity ligand-activated
transcription factor activity 均出现了腹泻、肉眼血便、脓便等症状,说明急性肠炎小
0.1 0.2 0.3
GeneRatio 鼠模型造模成功。
A. GO功能富集分析气泡图(前10位)
给药结束后,正常对照组、模型组、美沙拉嗪组、肠
lipid and atherosclerosis
hepatitis B
AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications 炎宁组、WZDK低剂量组、WZDK中剂量、WZDK高剂量
fluid shear stress and atherosclerosis
chemical carcinogenesis-receptor activation 组小鼠的DAI评分分别为0、(2.10±0.42)、(1.71±0.33)、
MAPK signaling pathway
kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
proteoglycans in cancer qvalue (1.80±0.32)、(1.83±0.32)、(1.67±0.38)、(1.60±0.38)
human cytomegalovirus infection
human T-cell leukemia virus 1 infection
TNF signaling pathway 1×10 -13 分。与正常对照组比较,模型组小鼠的DAI评分显著升高
tuberculosis
epstein-barr virus infection 2×10 -13
prostate cancer (P<0.01)。与模型组比较,WZDK中、高剂量组小鼠的稀
endocrine resistance
chagas disease Count 便和血便情况明显改善,DAI评分显著降低(P<0.05)。
hepatitis C
hepatocellular carcinoma 15
influenza A 20 3.3.2 WZDK对小鼠结肠组织病理学的影响
measles 25
bladder cancer
IL-17 signaling pathway 30 正常对照组小鼠结肠组织结构基本正常,未见炎症
HIF-1 signaling pathway 35
C-type lectin receptor signaling pathway
leishmaniasis 细胞浸润、黏膜组织损伤等病理性改变。与正常对照组
colorectal cancer
small cell lung cancer
EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance 比较,模型组小鼠结肠可见不同程度的炎症细胞浸润、
glioma
bladder cancer 黏膜组织损伤、变性和坏死,部分可见隐窝破坏、消失,
0.15 0.20 0.25 0.30
GeneRatio 可见脱落坏死的组织,发生了严重的病理损伤。与模型
B. KEGG信号通路富集分析气泡图(前30位)
组比较,各给药组小鼠结肠组织炎症细胞浸润减少,黏
注:图中气泡大小、颜色与富集基因和显著性有关,气泡越大表示
富集基因数目越多,颜色越深表示通路越显著。 膜组织损伤减轻,部分可见隐窝破坏,病变程度有所减
图3 GO功能富集和KEGG通路富集分析气泡图 轻,尤其WZDK高剂量组改善作用明显。结果见图5。
中国药房 2023年第34卷第13期 China Pharmacy 2023 Vol. 34 No. 13 · 1581 ·