Page 47 - 《中国药房》2021年第4期
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基于网络药理学的“柴胡-黄芩”药对干预足细胞病变作用机制探
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1*
窦一田 ,尚懿纯 ,刘春柳(1.天津中医药大学第一附属医院肾病科,天津 300381;2.天津中医药大学中医学
3
院,天津 301617;3.天津中医药大学研究生院,天津 301617)
中图分类号 R256.5;R285.5 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2021)04-0425-07
DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2021.04.07
摘 要 目的:预测辛通畅络法载体——复方肾苏Ⅱ之君药“柴胡-黄芩”药对干预足细胞病变的可能作用靶点与机制,为辛通畅
络法防治足细胞病变序贯临床和基础研究的开展提供参考。方法:基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库,检索柴胡、黄
芩化学成分及其对应靶点蛋白,借助 Cytoscape 3.2.1 软件绘制“中药-成分-靶点”网络图。在 OMIM 数据库、DrugBank 数据库及
DigSee在线文本中检索足细胞病变相关靶点,利用Venny 2.1.0在线作图工具获取其与“柴胡-黄芩”作用靶点的交集基因。分别应
用STRING数据库及Cytoscape 3.2.1软件的“CytoNCA”插件构建交集基因蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络图并进行拓扑
学分析,获取核心预测靶点。借助DAVID数据库对交集基因进行基因本体(GO)功能注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)
通路富集,并通过OmicShare Tools在线作图平台实现富集结果的可视化。结果:基于TCMSP数据库检索结果,获得有对应靶点
的活性成分44种,其中柴胡13种、黄芩32种,豆甾醇为两者共有成分;潜在作用靶点较多的化合物为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素
等;节点度值较高靶点蛋白为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、PTGS1、核受体共激活因子2、热休克蛋白90α等,分别与37、
30、25、25 个活性成分相关联。获取“柴胡-黄芩”作用靶点与足细胞病变相关靶点交集基因 20 个,包括 PTGS2、VEGFA、MMP9、
TNF、IL6等。上述交集基因的PPI网络图共包含节点20个、连线110条,MMP9、VEGFA、IL6等基因处于核心位置。GO分析结果
显示,共获得生物信息条目154个(P<0.05),包括生物过程条目139个、细胞组成条目8个、分子功能条目7个。其中,生物过程主
要涉及一氧化氮生物合成过程的正调控、炎症反应、免疫反应等,细胞组成主要涉及细胞外间隙、胞外区、质膜外侧等,分子功能主
要涉及蛋白质结合、细胞因子活性、生长因子活性等。同时,获得KEGG通路富集条目47个(P<0.05),主要涉及细胞因子-细胞因
子受体相互作用、类风湿关节炎、疟疾、癌症信号通路等相关信号转导途径。结论:复方肾苏Ⅱ之“柴胡-黄芩”药对活性成分可能
通过细胞因子-细胞因子受体相互作用、类风湿关节炎、疟疾、癌症信号通路等相关信号转导途径作用于MMP9、VEGFA、IL6、TNF
等靶点,从而发挥对足细胞病变的干预作用。
关键词 网络药理学;“柴胡-黄芩”药对;足细胞病变;靶点;机制
Exploration of the Mechanism about Couplet Medicine of Bupleurum falcatum-Scutellaria baicalensis
Intervening in Podocyte Lesion Based on Network Pharmacology
DOU Yitian ,SHANG Yichun ,LIU Chunliu(1. Dept. of Nephrology,the First Affiliated Hospital of Tianjin
2
1
3
Medical University of TCM,Tianjin 300381,China;2. College of TCM,Tianjin Medical University of TCM,
Tianjin 301617,China;3. Graduate School,Tianjin University of TCM,Tianjin 301617,China)
ABSTRACT OBJECTIVE:To predict the potential target and mechanism of Xintong Changluo Method carrier-Compund Shensu
Ⅱ couplet medicine of Bupleurum falcatum-Scutellaria baicalensis intervening in podocyte lesion,and to provide reference for the
development of sequential clinical and basic research of Xintong Changluo Method in the prevention and treatment of podocyte
lesion. METHODS:Based on TCMSP database,chemical components and target protein of B. falcatum and S. baicalensis were
retrieved,and Cytoscape 3.2.1 software was used to draw a“TCM-component-target”network. The targets related to podocyte
lesion were searched from OMIM database,DrugBank database and Digsee online text,and the intersection genes of above targets
and“B. falcatum-S. baicalensis”target were obtained by Venny 2.1.0 online mapping tool. The protein-protein interaction(PPI)
network was constructed by STRING database,and the core targets were obtained by topology analysis of the network by using
CytoNCA plug-in Cytospace 3.2.1 software. With the help of DAVID database,the function of Gene Ontology(GO)was annotated
and KEGG pathway was enriched;and the enrichment results
Δ 基 金 项 目 :国 家 自 然 科 学 基 金 青 年 项 目(No.81703968,
were visualized through OmicShare Tools online mapping
No.81403333);天津市教委科研计划项目(No.2017KJ154)
platform. RESULTS:Based on retrieval results of TCMSP
*副主任医师,硕士生导师,博士。研究方向:慢性肾脏病中医、
中西医临床与基础。电话:022-27987020。E-mail:hczar1745@163. database,44 active components were obtained,involving 13
com of B. falcatum and 32 of S. baicalensis; stigmasterol is
# 通信作者:副教授,博士。研究方向:温病、中医内科学。电话: common component of B. falcatum and S. baicalensis.
022-59596195。E-mail:x_meshang@126.com Quercetin,kaempferol and wogonin were the compounds with
中国药房 2021年第32卷第4期 China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 4 ·425 ·