Page 48 - 《中国药房》2021年第4期

main potential targets. The target proteins with high node degree were prostaglandin endoperoxide synthase 2（PTGS2），PTGS1，
nuclear receptor coactivator 2 and heat shock protein 90 α ，which were associated with 37，30，25 and 25 active components
respectively. Twenty genes were obtained from the interaction between“B. falcatum-S. baicalensis”and podocyte lesion related
targets，including PTGS2，VEGFA，MMP9，TNF and IL6. PPI network diagram of the above intersection genes contained 20 nodes
and 110 lines，with MMP9，VEGFA，IL6 and other genes at the core. The results of GO analysis showed that a total of 154
biological information items were obtained（P＜0.05），including 139 biological process items，8 cell composition items and 7
molecular function items. Among them，biological processes mainly involved in the positive regulation of NO biosynthesis process，
inflammatory response，immune response. Cell composition mainly involved in extracellular space，extracellular region，external
side of plasma membrane，etc.，and molecular function mainly involved in protein binding，cytokine activity，growth factor
activity，etc. At the same time，47 KEGG pathways were obtained （P＜0.05），mainly including cytokine-cytokine receptor
interaction，rheumatoid arthritis，malaria，cancer signaling pathways. CONCLUSIONS：The active components of Compund
Shensu Ⅱ couplet medicine of“B. falcatum-S. baicalensis”may act on MMP9，VEGFA，IL6，TNF and other targets through
cytokine-cytokine receptor interaction，rheumatoid arthritis，malaria，cancer signal pathway，so as to play its intervention effect on
podocyte lesion.
KEYWORDS Network pharmacology；Couplet medicine of“Bupleurum falcatum-Scutellaria baicalensis”；Podocyte lesion；
Target；Mechanism

生理状态下，足细胞附着于肾小球基底膜（GBM）外 及其对应的靶点基因导入 Cytoscape 3.2.1 软件中，构建
侧，是肾小球滤过屏障的重要组成部分；同时，作为高度 “柴胡-黄芪”药对的“中药-成分-靶点”网络图，以可视化
特异性终末分化细胞，足细胞一旦损伤脱落就很难再 图形直观展示药物成分与潜在靶点间的作用关系，并借
生 。目前学者普遍认为，足细胞病变广泛存在，是微小 助该软件的“Cyto NCA”插件进行拓扑学分析。
[1]
病变肾病、膜性肾病、局灶节段性肾小球硬化、狼疮性肾 1.3 疾病靶点基因的筛选
炎以及糖尿病肾病等常见原发、继发性肾小球疾病的共 以“Minimal change nephropathy”“Focal segmental
同病理改变 。进入21世纪后，伴随足细胞病变概念的 glomurular sclerosis”“Membranous nephropathy”“Diabet-
[2]
[3]
提出及全球足细胞病变发生率的显著上升 ，该病的防 ic nephropathy”等足细胞病变的相关疾病为关键词，在
治日益被肾脏病专业领域的学者所关注。近年来，中医 OMIM 数 据 库（http：//omim.org/）、DrugBank 数 据 库
药对足细胞病变的防治介入广泛，其疗效确切、卫生经 （https：//www.drugbank.ca/）和 DigSee 在线文本（http：//
济学效益较好，逐渐成为慢性肾脏病（CKD）足细胞病变 210.107.182.61/geneSearch/）中检索与足细胞病变相关
[4]
综合防治的重要组成部分 。但由于中医学独特的理论 基因。
体系，其物质基础阐释与作用机制分析仍属“短板”，而 1.4 蛋白质相互作用网络构建
网络药理学技术的发展使特定疾病的中医药干预靶点 将柴胡、黄芩活性成分潜在靶点蛋白的对应基因与
与机制途径预测成为可能 。鉴于此，本研究以既往证 足细胞病变相关基因分别上传至 Venny 2.1.0 在线作图
[5]
实可有效延缓足细胞病变进程的辛通畅络法载体—— 工具（http：//bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html）
复方肾苏Ⅱ之君药“柴胡-黄芩”药对为例 [6－7] ，基于网络 中，绘制韦恩图以获取交集基因。将“柴胡-黄芩”与足
药理学技术初步探索中医药干预足细胞病变的针对性 细 胞 病 变 的 交 集 基 因 导 入 STRING 数 据 库（https：//
靶点与潜在机制，为辛通畅络法干预足细胞病变序贯临 string-db.org）中，获取交集基因蛋白质-蛋白质相互作用
床与基础研究的开展提供参考。 关系（PPI）网络图，并通过 Cytoscape 3.2.1 软件的“Cy-
1 材料与方法 toNCA”插件对PPI网络进行拓扑学分析，获取节点的节
1.1 “柴胡-黄芩”活性成分及潜在靶点收集 点度、介度性和中心紧密度等网络拓扑特征值。其中，
研究基于中药系统药理学技术平台（TCMSP）数据 节点度指和该节点相关联的边的条数，介度性指经过网
库（https：//tcmspw.com/tcmsp.php）进行，设置口服生物 络中某一点的最短路径数目在所有节点的最短路径数
[8]
利用度（OB）≥30％、类药性指数（DL）≥0.18 ，分别以 目中所占的比例，中心紧密度指该节点到网络中其他所
“柴胡”“黄芩”为关键词，检索两味药材的化学成分及其 有节点的平均距离的倒数；三者的值越高表示该节点在
对应靶点蛋白，并剔除无对应靶点的成分。将检索条件 网络中越重要 。
[9]
设置为“Organism：Homo sapiens”，在UniProt KB数据库 1.5 基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百
（http：//www.uniprot.org/）中查询活性成分潜在靶点蛋白 科全书（KEGG）信号通路富集
的对应基因。 基 于 DAVID 数 据 库（https：//david.ncifcrf.gov/）对
1.2 “中药-成分-靶点”网络图构建 “柴胡-黄芩”与足细胞病变的交集基因进行 GO 功能注
将“1.1”项下检索所得的柴胡、黄芩包含的活性成分 释和 KEGG 通路富集分析。设置物种为“Homo sapiens

·426 · China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 4 中国药房 2021年第32卷第4期