Page 49 - 《中国药房》2021年第4期
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(人)”,标识符(Identifier)为“Official gene symbol(官方 主要涉及细胞外间隙、胞外区、质膜外侧等;分子功能主
名称)”,保留P<0.05的富集条目,并按照P值从小到大 要涉及蛋白质结合、细胞因子活性、生长因子活性等,详
进行排序。选择排名前 20 位的条目导入 OmicShare 见表3、表4、表5。
Tools 在线作图平台(http://www.omicshare.com/tools/in- 表1 “柴胡-黄芩”药对活性成分基本信息
dex.php/),实现富集分析结果的可视化。 Tab 1 Basic information of active components of coup-
2 结果 let medicine of“B. falcatum-S. baicalensis”
2.1 “柴胡-黄芩”药对化学成分筛选结果 药物 TCMSP编号 化学成分(英文名称) OB,% DL
基于 TCMSP 数据库,在 OB≥30%、DL≥0.18 的筛 柴胡 MOL001645 乙酸芳樟酯(Linoleyl acetate) 42.10 0.20
MOL002776 黄芩苷(Baicalin) 40.12 0.75
选条件下共检索到52种化学成分,剔出无对应靶点的化
MOL000354 异鼠李素(Isorhamnetin) 49.60 0.31
学成分后,最终共筛选得到活性化学成分 44 种。共有 MOL000422 山柰酚(Kaempferol) 41.88 0.24
13种成分来自柴胡、32种化学成分来自黄芩,其中豆甾 MOL004598 3,5,6,7-四甲基化-2-(3,4,5-三甲氧苯基)[3,5,6, 31.97 0.59
7-tetramethoxy-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)chromone]
醇为柴胡、黄芩相同成分。“柴胡-黄芩”活性化学成分基
MOL004609 茵陈黄酮(Areapillin) 48.96 0.41
本信息详见表1。 MOL013187 过筚澄茄素(Cubebin) 57.13 0.64
2.2 “中药-成分-靶点”网络图分析结果 MOL004624 长贝壳杉素A(Longikaurin A) 47.72 0.53
“柴胡-黄芪”药对的“中药-成分-靶点”网络图详见 MOL004653 (+)-川白芷内酯[(+)-anomalin] 46.06 0.66
MOL004718 α-菠菜甾醇(α-spinasterol) 42.98 0.76
图 1[图中,节点代表中药及其对应的活性成分(活性成 MOL000490 牵牛花色素(Petunidin) 30.05 0.31
分标签由M+TCMSP编号最后4/5位数字表示)、靶点蛋 MOL000098 槲皮素(Quercetin) 46.43 0.28
白,连线代表中药与活性成分、活性成分与潜在靶点间 黄芩 MOL001689 刺槐素(Acacetin) 34.97 0.24
MOL000173 汉黄芩素(Wogonin) 30.68 0.23
的关系]。由图1所知,该图共包含节点267个、连线834
MOL000228 (2R)-7-羟基-5-甲氧基-2-苯并吡喃-4-酮[(2R)-7-hydroxy- 55.23 0.20
条。其中,中药节点2个、活性成分节点44个、靶点蛋白 5-methoxy-2-phenylchroman-4-one]
节点 221 个。拓扑学分析结果显示,该网络中潜在作用 MOL002714 黄芩素(Baicalein) 33.52 0.21
MOL002909 5,7,2,5-四羟基-8,6-二甲氧基黄酮(5,7,2,5-tetra- 33.82 0.45
靶点较多的化合物为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、黄芩 hydroxy-8,6-dimethoxyflavone)
素、β-谷甾醇等,节点度值依次为 149、51、45、37、37;节 MOL002910 红花素(Carthamidin) 41.15 0.24
点度值较高靶点蛋白依次为前列腺素内过氧化物合酶2 MOL002913 二氢黄芩苷(Dihydrobaicalin) 40.04 0.21
MOL002914 黄烷酮(Eriodyctiol) 41.35 0.24
(PTGS2,又称 COX-2)、PTGS1、核受体共激活因子 2 MOL002915 鼠尾草素(Salvigenin) 49.07 0.33
(NCOA2)、热休克蛋白90α(HSP90α)、雄激素受体(AR) MOL002917 5,2′,6′-三羟基-7,8-二甲氧基黄酮(5,2′,6′-trihydr- 45.05 0.33
等,分别与37、30、25、25、22个活性成分相关联。 oxy-7,8-dimethoxyflavone)
MOL002925 5,7,2′,6′-四羟基黄酮(5,7,2′,6′-tetrahydroxyflavone) 37.01 0.24
2.3 “柴胡-黄芩”作用靶点与足细胞病变相关靶点交集 MOL002927 黄芩酮Ⅱ(Skullcapflavone Ⅱ) 69.51 0.44
基因筛选结果 MOL002928 木蝴蝶A(Oroxylin A) 41.37 0.23
经检索获取足细胞病变相关基因 140 个、柴胡作用 MOL002932 榄核莲黄酮(Panicolin) 76.26 0.29
MOL002933 5,7,4′-三羟基-8-甲氧基黄酮(5,7,4′-trihydroxy-8- 36.56 0.27
靶点186个、黄芩作用靶点119个。将其导入Venny2.1.0 methoxyflavone)
在线作图工具制作韦恩图(见图2)后,获取“柴胡-黄芩” MOL002934 黄芩新素(Neobaicalein) 104.34 0.44
作用靶点与足细胞病变交集基因20个,其中9个为柴胡 MOL002937 二氢曲霉素(Dihydrooroxylin) 66.06 0.23
MOL000358 β-谷甾醇(β-sitosterol) 36.91 0.75
与黄芩共同作用靶点[PTGS2、VEGFA、MMP9、TNF、IL6、
MOL000359 谷甾醇(Sitosterol) 36.91 0.75
MCP1(又称CCL2)、TGFB1、IL8(又称CXCL8)、CDKN1A]。 MOL000525 去甲汉黄芩素(Norwogonin) 39.40 0.21
2.4 PPI网络的构建与分析结果 MOL000552 5,2′-二羟基-6,7,8-三甲氧基黄酮(5,2′-dihydroxy-6, 31.71 0.35
7,8-trimethoxyflavone)
“柴胡-黄芩”作用靶点与足细胞病变相关靶点交集
MOL000073 表儿茶素(ent-epicatechin) 48.96 0.24
基因的PPI网络图见图3(图中,节点表示交集基因对应 MOL001458 小檗碱(Coptisine) 30.67 0.86
蛋白,每条边表示 PPI 关系)。拓扑学分析结果显示,该 MOL001490 双[(2S)-2-乙基己基]苯-1,2-二羧酸盐{bis[(2S)-2- 43.59 0.35
ethylhexyl] benzene-1,2-dicarboxylate}
网络图包含节点 20 个、连线 110 条;根据中心度、介度
MOL002879 邻苯二甲酸二异辛酯(Diisooctyl phthalate) 43.59 0.39
性、中心紧密度等参数判定,MMP9、VEGFA、IL6、TNF、 MOL002897 表小檗碱(Epiberberine) 43.09 0.78
PTGS2等基因处于核心位置,其拓扑学参数详见表2(由 MOL008206 荠苎黄酮(Moslosooflavone) 44.09 0.25
于RUNX1T1未与其他蛋白相连,故表中无其参数)。 MOL010415 11,13-二十碳二烯酸甲酯(11,13-eicosadienoic acid 39.28 0.23
methyl ester)
2.5 GO基因注释与KEGG通路富集结果
MOL012245 5,7,4′-三羟基-6-甲氧基黄烷酮(5,7,4'-trihydroxy- 36.63 0.27
通过 GO 基因注释分析得到 154 个条目(P<0.05), 6-methoxyflavanone)
包括生物过程条目139个、细胞组成条目8个、分子功能 MOL012246 5,7,4′-三羟基-8-甲氧基黄烷酮(5,7,4′-trihydroxy- 74.24 0.26
8-methoxyflavanone)
条目7个。生物过程主要以一氧化氮生物合成过程的正 MOL012266 三甲氧基黄酮(Rivularin) 37.94 0.37
调控、炎症反应、免疫反应等为主要富集条目;细胞组成 共有成分 MOL000449 豆甾醇(Stigmasterol) 43.83 0.76
中国药房 2021年第32卷第4期 China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 4 ·427 ·