Page 49 - 《中国药房》2021年第4期
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(人)”,标识符(Identifier)为“Official gene symbol(官方       主要涉及细胞外间隙、胞外区、质膜外侧等;分子功能主
        名称)”,保留P<0.05的富集条目,并按照P值从小到大                       要涉及蛋白质结合、细胞因子活性、生长因子活性等,详
        进行排序。选择排名前 20 位的条目导入 OmicShare                     见表3、表4、表5。
        Tools 在线作图平台(http://www.omicshare.com/tools/in-          表1 “柴胡-黄芩”药对活性成分基本信息
        dex.php/),实现富集分析结果的可视化。                            Tab 1 Basic information of active components of coup-
        2 结果                                                      let medicine of“B. falcatum-S. baicalensis”
        2.1 “柴胡-黄芩”药对化学成分筛选结果                              药物   TCMSP编号  化学成分(英文名称)               OB,%   DL
            基于 TCMSP 数据库,在 OB≥30%、DL≥0.18 的筛               柴胡   MOL001645  乙酸芳樟酯(Linoleyl acetate)  42.10  0.20
                                                                MOL002776  黄芩苷(Baicalin)           40.12  0.75
        选条件下共检索到52种化学成分,剔出无对应靶点的化
                                                                MOL000354  异鼠李素(Isorhamnetin)      49.60  0.31
        学成分后,最终共筛选得到活性化学成分 44 种。共有                              MOL000422  山柰酚(Kaempferol)         41.88  0.24
        13种成分来自柴胡、32种化学成分来自黄芩,其中豆甾                              MOL004598  3,5,6,7-四甲基化-2-(3,4,5-三甲氧苯基)[3,5,6,  31.97  0.59
                                                                        7-tetramethoxy-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)chromone]
        醇为柴胡、黄芩相同成分。“柴胡-黄芩”活性化学成分基
                                                                MOL004609  茵陈黄酮(Areapillin)        48.96  0.41
        本信息详见表1。                                                MOL013187  过筚澄茄素(Cubebin)          57.13  0.64
        2.2 “中药-成分-靶点”网络图分析结果                                   MOL004624  长贝壳杉素A(Longikaurin A)   47.72  0.53
           “柴胡-黄芪”药对的“中药-成分-靶点”网络图详见                            MOL004653  (+)-川白芷内酯[(+)-anomalin]  46.06  0.66
                                                                MOL004718  α-菠菜甾醇(α-spinasterol)   42.98  0.76
        图 1[图中,节点代表中药及其对应的活性成分(活性成                              MOL000490  牵牛花色素(Petunidin)        30.05  0.31
        分标签由M+TCMSP编号最后4/5位数字表示)、靶点蛋                            MOL000098  槲皮素(Quercetin)          46.43  0.28
        白,连线代表中药与活性成分、活性成分与潜在靶点间                           黄芩   MOL001689  刺槐素(Acacetin)           34.97  0.24
                                                                MOL000173  汉黄芩素(Wogonin)           30.68  0.23
        的关系]。由图1所知,该图共包含节点267个、连线834
                                                                MOL000228  (2R)-7-羟基-5-甲氧基-2-苯并吡喃-4-酮[(2R)-7-hydroxy-  55.23  0.20
        条。其中,中药节点2个、活性成分节点44个、靶点蛋白                                      5-methoxy-2-phenylchroman-4-one]
        节点 221 个。拓扑学分析结果显示,该网络中潜在作用                             MOL002714  黄芩素(Baicalein)          33.52  0.21
                                                                MOL002909  5,7,2,5-四羟基-8,6-二甲氧基黄酮(5,7,2,5-tetra-  33.82  0.45
        靶点较多的化合物为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、黄芩                                        hydroxy-8,6-dimethoxyflavone)
        素、β-谷甾醇等,节点度值依次为 149、51、45、37、37;节                      MOL002910  红花素(Carthamidin)        41.15  0.24
        点度值较高靶点蛋白依次为前列腺素内过氧化物合酶2                                MOL002913  二氢黄芩苷(Dihydrobaicalin)  40.04  0.21
                                                                MOL002914  黄烷酮(Eriodyctiol)        41.35  0.24
       (PTGS2,又称 COX-2)、PTGS1、核受体共激活因子 2                        MOL002915  鼠尾草素(Salvigenin)        49.07  0.33
       (NCOA2)、热休克蛋白90α(HSP90α)、雄激素受体(AR)                       MOL002917  5,2′,6′-三羟基-7,8-二甲氧基黄酮(5,2′,6′-trihydr-  45.05  0.33
        等,分别与37、30、25、25、22个活性成分相关联。                                    oxy-7,8-dimethoxyflavone)
                                                                MOL002925  5,7,2′,6′-四羟基黄酮(5,7,2′,6′-tetrahydroxyflavone)  37.01  0.24
        2.3 “柴胡-黄芩”作用靶点与足细胞病变相关靶点交集                             MOL002927  黄芩酮Ⅱ(Skullcapflavone Ⅱ)  69.51  0.44
        基因筛选结果                                                  MOL002928  木蝴蝶A(Oroxylin A)        41.37  0.23
            经检索获取足细胞病变相关基因 140 个、柴胡作用                           MOL002932  榄核莲黄酮(Panicolin)        76.26  0.29
                                                                MOL002933  5,7,4′-三羟基-8-甲氧基黄酮(5,7,4′-trihydroxy-8-  36.56  0.27
        靶点186个、黄芩作用靶点119个。将其导入Venny2.1.0                                methoxyflavone)
        在线作图工具制作韦恩图(见图2)后,获取“柴胡-黄芩”                             MOL002934  黄芩新素(Neobaicalein)      104.34  0.44
        作用靶点与足细胞病变交集基因20个,其中9个为柴胡                               MOL002937  二氢曲霉素(Dihydrooroxylin)  66.06  0.23
                                                                MOL000358  β-谷甾醇(β-sitosterol)     36.91  0.75
        与黄芩共同作用靶点[PTGS2、VEGFA、MMP9、TNF、IL6、
                                                                MOL000359  谷甾醇(Sitosterol)         36.91  0.75
        MCP1(又称CCL2)、TGFB1、IL8(又称CXCL8)、CDKN1A]。                MOL000525  去甲汉黄芩素(Norwogonin)      39.40  0.21
        2.4  PPI网络的构建与分析结果                                      MOL000552  5,2′-二羟基-6,7,8-三甲氧基黄酮(5,2′-dihydroxy-6,  31.71  0.35
                                                                        7,8-trimethoxyflavone)
           “柴胡-黄芩”作用靶点与足细胞病变相关靶点交集
                                                                MOL000073  表儿茶素(ent-epicatechin)   48.96  0.24
        基因的PPI网络图见图3(图中,节点表示交集基因对应                              MOL001458  小檗碱(Coptisine)          30.67  0.86
        蛋白,每条边表示 PPI 关系)。拓扑学分析结果显示,该                            MOL001490  双[(2S)-2-乙基己基]苯-1,2-二羧酸盐{bis[(2S)-2-  43.59  0.35
                                                                        ethylhexyl] benzene-1,2-dicarboxylate}
        网络图包含节点 20 个、连线 110 条;根据中心度、介度
                                                                MOL002879  邻苯二甲酸二异辛酯(Diisooctyl phthalate)  43.59  0.39
        性、中心紧密度等参数判定,MMP9、VEGFA、IL6、TNF、                        MOL002897  表小檗碱(Epiberberine)      43.09  0.78
        PTGS2等基因处于核心位置,其拓扑学参数详见表2(由                             MOL008206  荠苎黄酮(Moslosooflavone)   44.09  0.25
        于RUNX1T1未与其他蛋白相连,故表中无其参数)。                              MOL010415  11,13-二十碳二烯酸甲酯(11,13-eicosadienoic acid  39.28  0.23
                                                                        methyl ester)
        2.5 GO基因注释与KEGG通路富集结果
                                                                MOL012245  5,7,4′-三羟基-6-甲氧基黄烷酮(5,7,4'-trihydroxy-  36.63  0.27
            通过 GO 基因注释分析得到 154 个条目(P<0.05),                             6-methoxyflavanone)
        包括生物过程条目139个、细胞组成条目8个、分子功能                              MOL012246  5,7,4′-三羟基-8-甲氧基黄烷酮(5,7,4′-trihydroxy-  74.24  0.26
                                                                        8-methoxyflavanone)
        条目7个。生物过程主要以一氧化氮生物合成过程的正                                MOL012266  三甲氧基黄酮(Rivularin)       37.94  0.37
        调控、炎症反应、免疫反应等为主要富集条目;细胞组成                          共有成分 MOL000449  豆甾醇(Stigmasterol)       43.83  0.76


        中国药房    2021年第32卷第4期                                               China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 4  ·427 ·
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