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           A组                                                                                      B2(7 d)
                                                                                                       0.95
                                                                                                   B4(14 d)
                                                                                                       0.9
                                                                                                   A1(14 d)
                                                                                                       0.85
                                                                                                   B3(7 d)
                                                                                                   B5(14 d)
           B组                                                                                      B6(14 d)
                                                                                                   C5(14 d)
                                                                                                   B1(7 d)
                                                                                                   C1(7 d)
                                                                                                   C6(14 d)
           C组                                                                                      C2(7 d)
                                                                                                   C3(7 d)
                                                                                                   C4(14 d)
                     造模后7 d             造模后14 d                                                    A2(14 d)
                              A. HE染色                                                              A3(14 d)
                                                                   B2 ( 7 d )  B4 ( 14 d )  A1 ( 14 d )  B3 ( 7 d )  B5 ( 14 d )  B6 ( 14 d )  C5 ( 14 d )  B1 ( 7 d )  C1 ( 7 d )  C6 ( 14 d )  C2 ( 7 d )  C3 ( 7 d )  C4 ( 14 d )  A2 ( 14 d )  A3 ( 14 d )
                                                                        图3 样本相关性检验结果
           A组
                                                                  Fig 3 Correlation test results of samples
                                                            in each set”表示各组鉴定到的差异基因的总数,“num-
                                                            ber of each intersection”表示多个比较组鉴定到的共有
           B组
                                                            差异基因的数目;横坐标的单一“·”表示该组鉴定到的
                                                            特有差异基因的数目,横坐标多个“·”之间的连线所对
                                                            应的“number of each intersection”表示连线连接的多个
           C组                                               比较组鉴定到的共有差异基因的数目)。结果,A 组和
                                                            B7 d组、A组和B14 d组、B7 d组和C7 d组、B14 d组和C14 d组大鼠
                                                            比较,分别涉及 DEGs 886、1 404、70、66 个,详见表 2;涉
                    造模后7 d              造模后14 d
                              B.尼氏染色                        及 Ncmap、Prx、Gabrq、Gabrg2 等基因,部分 DEGs 筛选
                       图1 染色结果(×400)                        结果见表3。
                  Fig 1  Results of staining(×400)          3.4  生物信息学分析
                                                                由于生物过程条目众多,故本研究根据P值大小将
                                                            排序前 10 位的 GO 富集结果进行展示,详见图 5(图中,
            4
                                                            CC 为细胞部位,MF 为分子功能,BP 为生物过程;MHC
                                                            为主要组织相容性复合体,LUBAC 为线性泛素装配复
                                                            合体,IFN-γ为γ干扰素,CRLF 为细胞因子受体样因子,
            2                                               CLCF1为心肌营养素样细胞因子1,CNTFR为睫状神经
                                                            营养因子受体,GABA 为γ-氨基丁酸)。根据 FDR 值
          lgFPKM                                           (FDR即未发现率,一般取值范围为0~1,越接近于零则

                                                                          [15]
                                                            表示富集越显著 )大小将排序前20位的KEGG富集结
            0
                                                            果(P<0.05)进行展示,详见图 6(图中,HLTV-1 为人类
                                                            嗜 T 淋巴细胞病毒 1,CAMs 为细胞黏附因子,TNF 为肿
                                                            瘤坏死因子,FoxO为叉头框蛋白O,PPAR为过氧化物酶
           -2                                               体增殖物激活受体)。
                                                            3.4.1 A 组与 B 组    GO 富集分析结果(图 5A、5B)显
               A1 ( 14 d )  A2 ( 14 d )  A3 ( 14 d )  B1 ( 7 d )  B2 ( 7 d )  B3 ( 7 d )  B4 ( 14 d )  B5 ( 14 d )  B6 ( 14 d )  C1 ( 7 d )  C2 ( 7 d )  C3 ( 7 d )  C4 ( 14 d )  C5 ( 14 d )  C6 ( 14 d )  示,A、B 组 DEGs 富集的 BP 主要与免疫系统过程、生物
                                                            过程调节、应激反应、细胞激活等有关,具体包括免疫应
                   图2 FPKM密度分布小提琴图
                                                            答、防御反应、对细胞因子的反应等。两组DEGs富集的
           Fig 2  Violin chart of FPKM density distribution
                                                            CC 主要为细胞外区、细胞膜、细胞表面等部位,还涉及
            在此基础上,对各组间的DEGs进行筛选,各组差异                        到MHC蛋白复合物、炎症复合物(A组vs. B7 d组)和受体
        分析共有、特有 DEGs 的 Upser 图见图 4(图中,“number               复合物(A 组 vs. B14 d组)、溶酶体(A 组 vs. B 组)等。在


        ·1330  ·  China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 11                                中国药房    2020年第31卷第11期
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