Page 57 - 202011
P. 57

500
                                   piece  400
                                   number of each intersection,  300



                                    200

                                    100
                                      0
                                B14 d vs. C14 d
                                B7 d vs. C7 d
                                C7 d vs. C14 d
                                B7 d vs. B14 d
                                B7 d vs. C14 d
                                B14 d vs. C7 d
                                A14 d vs. C7 d
                                A14 d vs. C14 d
                                A14 d vs. B7 d
                                A14 d vs. B14 d
                   1 000  500  0
                   number in each set,piece
                                     图4 各组差异分析共有、特有DEGs的Upset图
                     Fig 4 Upset map of common and specific DEGs of differential analysis in each group

                    表2 DEGs统计结果(个)                         MF中,两组DEGs均富集于结合,包括蛋白质结合、阴离
                 Tab 2 Statistics of DEGs(piece)           子结合、阴离子配位等,同时还涉及半胱氨酸型内肽酶
        对比组别          表达上调的DEGs     表达下调的DEGs     合计       活性、细胞因子受体结合、趋化因子受体结合等受体结
        A组和B7 d组         702           184        886      合(A 组 vs. B7 d组)以及被动跨膜转运蛋白活性、底物比
        A组和B14 d组        921           483       1 404
        B7 d组和C7 d组       42           28          70      通道活性等转运活性(A 组 vs. B14 d组)。KEGG 富集分
        B14 d组和C14 d组     31           35          66      析结果(图 6A、6B)显示,A、B 组的 DEGs 主要富集于细

                                             表3 部分DEGs的筛选结果
                                        Tab 3  Screening results of partial DEGs
        对比组别     差异类型(数量)        具体变化(数量)                                   基因名称
        A组和B7 d组与A 表达上调(42个) 在B7 d组和C7 d组表达上调而在A组和B7 d组表达下 Ncmap、Prx、Slc36a2、Cldn1、Ddn、Myoc、AABR07053509.2、Cyp39a1、Slc13a5、Dhh、Mpz、Cldn19、B3gnt5、Mlip、AABR07071891.2、
        组和C7 d组          调(19个)                   Gldn、Gli1、Ptch2、Fam163a
                         在B7 d组和C7 d组、A组和B7 d组均表达上调(1个)  Pimreg
                         仅在B7 d组和C7 d组表达上调(22个)   Asb15、Ifit1、Neurl1b、Rasd2、Cpne1、Doc2b、Nmu、Lbx1、Slc9a3、Srms、Zfp831、Kif18a、Gpr26、Selp、Naa11、Grp、Prox2、Slc1a6、
                                                  AABR07041232.1、AABR07000398.1、LOC100359539、Gpx2
                 表达下调(28个) 在B7 d组和C7 d组表达下调而在A组和B7 d组表达上 Lilrb3、Calhm2、AABR07025272.1、AABR07025140.1、Unc93a、C2、Cdhr3、Romo1、Aoah、Cxcl16、F2rl3、F10、Meiob、Epsti1、Slfn2、
                         调(24个)                   Slc25a43、St14、Lrrn4cl、Lyc2、Scin、Mrc1、Clec12a、Folr1、Aif1
                         仅在B7 d组和C7 d组表达下调(4个)    Otulin、LOC688459、Exo1、Ubd
        A组和B14 d组与A 表达上调(31个) 在B14 d组和C14 d组表达上调而在A组和B14 d组表达 Gabrq、Gabrg2、LOC108348136、RGD1562420、Agtr2、Sprn、Cited1、LOC100362965、Rtl4、RGD1359290、Cntn5、Tmem266、
        组和C14 d组         下调(16个)                  AABR07020786.1、Mab21l2、Fgf18、Grb14
                         在B14 d组和C14 d组、A组和B14 d组均表达上调(1个)  Cxcl13
                         仅在B14 d组和C14 d组表达上调(14个)  Romo1、Phyhip、RGD1310507、Smim18、Ces1d、Cpa2、Zfp541、Lhx1、Pck1、Pla2g2a、Tmem270、Rprml、Myom3、Ucp1
                 表达下调(35个) 在B14 d组和C14 d组表达下调而在A组和B14 d组表达 Cxcl14、Olr35、Clcf1、Acp4、Drd1、C1qtnf9、Batf3、Fam115c、Rgs1、Pla2g2e、Ly6g6e、Il18r1、Card14、Lmln2、Mapk13、Serpinf2、
                         上调(20个)                  Clec4a2、Dnah8、Dennd2d、Tnfaip6
                         仅在B14 d组和C14 d组表达下调(15个)  Abcg3l3、LOC103693323、Tmem82、Igf2bp2、Scube2、Sh2d1b2、Aknad1、Amy1a、AC125873.1、Eqtn、Ifit1、Tal2、Dntt、
                                                  AABR07034739.1、Vax2

        胞因子-细胞因子受体相互作用、CAMs、吞噬体、类固醇                        主要富集的CC包括基底外侧质膜、质膜区、刷状缘等部
        生物合成、抗原处理和呈递、自然杀伤细胞介导的细胞                           位,主要具有外脱氧核糖核酸酶活性、二羧酸跨膜转运
        毒性、补体和凝血级联等信号通路上。                                  蛋白活性、钙离子结合等MF。KEGG富集分析结果(图
        3.4.2 B组与C组      ①B7 d组与C7 d组:GO富集分析结果             6C)显示,两组的 DEGs 主要富集于 CAMs、补体和凝血
       (图 5C)显示,两组 DEGs 主要富集于与免疫应答、神经                      级联、Hedgehog信号通路等信号通路上。②B14 d组与C14 d
        元保护、有机酸转运等BP上,主要包括对IFN-γ的反应、                       组:GO 富集分析结果(图 5D)显示,两组 DEGs 富集的
        电压门控钠离子通道的聚集、髓鞘形成、神经鞘、神经元                          BP 主要与含酚化合物代谢过程、细胞对内源性刺激的
        离子通道聚集、固有免疫应答、羧酸跨膜转运等。DEGs                         反应等有关,包括对儿茶酚类化合物代谢过程、对氮化


        中国药房    2020年第31卷第11期                                             China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 11  ·1331  ·
   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62