Page 57 - 202011
P. 57
500
piece 400
number of each intersection, 300
200
100
0
B14 d vs. C14 d
B7 d vs. C7 d
C7 d vs. C14 d
B7 d vs. B14 d
B7 d vs. C14 d
B14 d vs. C7 d
A14 d vs. C7 d
A14 d vs. C14 d
A14 d vs. B7 d
A14 d vs. B14 d
1 000 500 0
number in each set,piece
图4 各组差异分析共有、特有DEGs的Upset图
Fig 4 Upset map of common and specific DEGs of differential analysis in each group
表2 DEGs统计结果(个) MF中,两组DEGs均富集于结合,包括蛋白质结合、阴离
Tab 2 Statistics of DEGs(piece) 子结合、阴离子配位等,同时还涉及半胱氨酸型内肽酶
对比组别 表达上调的DEGs 表达下调的DEGs 合计 活性、细胞因子受体结合、趋化因子受体结合等受体结
A组和B7 d组 702 184 886 合(A 组 vs. B7 d组)以及被动跨膜转运蛋白活性、底物比
A组和B14 d组 921 483 1 404
B7 d组和C7 d组 42 28 70 通道活性等转运活性(A 组 vs. B14 d组)。KEGG 富集分
B14 d组和C14 d组 31 35 66 析结果(图 6A、6B)显示,A、B 组的 DEGs 主要富集于细
表3 部分DEGs的筛选结果
Tab 3 Screening results of partial DEGs
对比组别 差异类型(数量) 具体变化(数量) 基因名称
A组和B7 d组与A 表达上调(42个) 在B7 d组和C7 d组表达上调而在A组和B7 d组表达下 Ncmap、Prx、Slc36a2、Cldn1、Ddn、Myoc、AABR07053509.2、Cyp39a1、Slc13a5、Dhh、Mpz、Cldn19、B3gnt5、Mlip、AABR07071891.2、
组和C7 d组 调(19个) Gldn、Gli1、Ptch2、Fam163a
在B7 d组和C7 d组、A组和B7 d组均表达上调(1个) Pimreg
仅在B7 d组和C7 d组表达上调(22个) Asb15、Ifit1、Neurl1b、Rasd2、Cpne1、Doc2b、Nmu、Lbx1、Slc9a3、Srms、Zfp831、Kif18a、Gpr26、Selp、Naa11、Grp、Prox2、Slc1a6、
AABR07041232.1、AABR07000398.1、LOC100359539、Gpx2
表达下调(28个) 在B7 d组和C7 d组表达下调而在A组和B7 d组表达上 Lilrb3、Calhm2、AABR07025272.1、AABR07025140.1、Unc93a、C2、Cdhr3、Romo1、Aoah、Cxcl16、F2rl3、F10、Meiob、Epsti1、Slfn2、
调(24个) Slc25a43、St14、Lrrn4cl、Lyc2、Scin、Mrc1、Clec12a、Folr1、Aif1
仅在B7 d组和C7 d组表达下调(4个) Otulin、LOC688459、Exo1、Ubd
A组和B14 d组与A 表达上调(31个) 在B14 d组和C14 d组表达上调而在A组和B14 d组表达 Gabrq、Gabrg2、LOC108348136、RGD1562420、Agtr2、Sprn、Cited1、LOC100362965、Rtl4、RGD1359290、Cntn5、Tmem266、
组和C14 d组 下调(16个) AABR07020786.1、Mab21l2、Fgf18、Grb14
在B14 d组和C14 d组、A组和B14 d组均表达上调(1个) Cxcl13
仅在B14 d组和C14 d组表达上调(14个) Romo1、Phyhip、RGD1310507、Smim18、Ces1d、Cpa2、Zfp541、Lhx1、Pck1、Pla2g2a、Tmem270、Rprml、Myom3、Ucp1
表达下调(35个) 在B14 d组和C14 d组表达下调而在A组和B14 d组表达 Cxcl14、Olr35、Clcf1、Acp4、Drd1、C1qtnf9、Batf3、Fam115c、Rgs1、Pla2g2e、Ly6g6e、Il18r1、Card14、Lmln2、Mapk13、Serpinf2、
上调(20个) Clec4a2、Dnah8、Dennd2d、Tnfaip6
仅在B14 d组和C14 d组表达下调(15个) Abcg3l3、LOC103693323、Tmem82、Igf2bp2、Scube2、Sh2d1b2、Aknad1、Amy1a、AC125873.1、Eqtn、Ifit1、Tal2、Dntt、
AABR07034739.1、Vax2
胞因子-细胞因子受体相互作用、CAMs、吞噬体、类固醇 主要富集的CC包括基底外侧质膜、质膜区、刷状缘等部
生物合成、抗原处理和呈递、自然杀伤细胞介导的细胞 位,主要具有外脱氧核糖核酸酶活性、二羧酸跨膜转运
毒性、补体和凝血级联等信号通路上。 蛋白活性、钙离子结合等MF。KEGG富集分析结果(图
3.4.2 B组与C组 ①B7 d组与C7 d组:GO富集分析结果 6C)显示,两组的 DEGs 主要富集于 CAMs、补体和凝血
(图 5C)显示,两组 DEGs 主要富集于与免疫应答、神经 级联、Hedgehog信号通路等信号通路上。②B14 d组与C14 d
元保护、有机酸转运等BP上,主要包括对IFN-γ的反应、 组:GO 富集分析结果(图 5D)显示,两组 DEGs 富集的
电压门控钠离子通道的聚集、髓鞘形成、神经鞘、神经元 BP 主要与含酚化合物代谢过程、细胞对内源性刺激的
离子通道聚集、固有免疫应答、羧酸跨膜转运等。DEGs 反应等有关,包括对儿茶酚类化合物代谢过程、对氮化
中国药房 2020年第31卷第11期 China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 11 ·1331 ·