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筛选出Degree值最高的5个靶标(即网络图上节点面积 腺增生的活性成分-潜在作用靶标47个,详见表2。
最大的5个节点),作为潜在核心靶标,并进行分子对接 表1 “柴胡-白术”药对的活性成分
验证。将潜在核心靶标导入SystemsDock Web Site服务 Tab 1 Active components of couplet medicine of“Bu-
器(http://systemsdock.unit.oist.jp/iddp/home/index)与“柴 pleuri Radix-A. macrocephalea Rhizoma”
胡-白术”药对的活性成分进行分子对接,得到两者之间 序号 来源药材 中文名(英文全称) OB,% DL
的对接评分(Docking Score)。当对接评分<4.25,则表 1 柴胡 乙酸芳樟酯(Linoleyl acetate) 42.10 0.20
2 柴胡 黄芩苷(Baicalin) 40.12 0.75
示活性成分分子和潜在核心靶标具有较弱的结合亲和 3 柴胡 豆甾醇(Stigmasterol) 43.83 0.76
性;对接评分为 4.25~<5.0,则表示两者之间具有一定 4 柴胡 异鼠李素(Isorhamnetin) 49.60 0.31
的结合亲和性;对接评分为5.0~<7.0,则表示两者之间 5 柴胡 山柰素(Kaempferol) 41.88 0.24
6 柴胡 3,5,6,7-四甲基化-2-(3,4,5-三甲氧苯基)色酮苷(3,5,6, 31.97 0.59
具有较强的结合亲和性;对接评分≥7.0 则表示两者之 7-tetramethoxy-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)chromone)(简称为“色酮
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间具有很强的结合亲和性 。根据对接评分≥4.25的活 苷”)
7 柴胡 茵陈黄酮(Areapillin) 48.96 0.41
性成分所占比例评价上述5个潜在核心靶标与活性成分
8 柴胡 过荜澄茄素(Cubebin) 57.13 0.64
之间的结合亲和性,进而验证潜在核心靶标的真实性。 9 柴胡 长贝壳杉素A(Longikaurin A) 47.72 0.53
1.7 “柴胡-白术”药对治疗乳腺增生相关生物学过程与 10 柴胡 (+)-川白芷内酯[(+)-anomalin] 46.06 0.66
11 柴胡 α-菠菜甾醇(α-spinasterol) 42.98 0.76
通路分析
12 柴胡 牵牛花色素(Petunidin) 30.05 0.31
将“1.3”项下获取的潜在作用靶标导入DAVID数据 13 柴胡 槲皮素(Quercetin) 46.43 0.28
库(https://david.ncifcrf.gov/),选择“Select identifier”为 14 白术 14-乙酰基-12-异戊烯酰基-2E,8Z,10E-白术三醇(14-acetyl-12- 63.37 0.30
senecioyl-2E,8Z,10E-atractylentriol)(简称为“白术三醇”)
“Official gene symbol”、“List type”为“Gene list”、物种为
15 白术 3S,8S,9S,10R,13R,14S,17R)-10,13-二甲基-17-[(2R,5S)-5-丙 36.23 0.78
“Human”,进行 GO 分类富集分析和 KEGG 通路富集分 烷-2-yloctan-2- yl]-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-十二面体-1H-
环戊基[a]菲-3-ol(简称为“菲-3-ol”)
析。GO 分类富集分析结果包括分子功能(Molecular
16 白术 3β-乙酸化苍术酮(3β-acetoxyatractylone) 54.07 0.22
function,MF)、生物过程(Biological process,BP)和细胞 17 白术 8β-乙氧基白术内酯Ⅲ(8β-ethoxy atractylenolide Ⅲ) 35.95 0.21
组分(Cellular component,CC)三部分。对所获得的P< 2.3 活性成分-潜在作用靶标网络构建结果
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0.001 的生物学过程与通路,根据富集靶标数量由多到 “柴胡-白术”药对治疗乳腺增生的活性成分-潜在作
少进行排序,再选取富集靶标数量最多的前10条生物学 用靶标网络图见图 1。由图 1 可见,该网络上有节点 64
过程与通路,作为本研究的主要分析对象。结合相关研 个、边线 257 条,其中六边形节点代表“柴胡-白术”药对
究文献对该10条通路进行分析,筛选出可能与治疗乳腺 活性成分,圆形节点代表潜在作用靶标,边线代表两者
增生相关的通路,作为关键通路。 的相互关联。由该网络图可知,同一活性成分可以作用
1.8 活性成分-潜在作用靶标-关键通路网络构建 于不同靶标,而同一靶标也可对应不同活性成分,体现
通过DAVID数据库获取富集于“1.7”项所获关键通 出“柴胡-白术”药对能通过多成分、多靶标发挥抗乳腺
路上的潜在作用靶标,并与相应的活性成分相匹配,得 增生作用的特点。
出三者之间的网络关系,并采用 Cytoscape 3.6.0 软件绘 2.4 潜在作用靶标相互作用网络构建
制活性成分-潜在作用靶标-关键通路网络,直观地展现 潜在作用靶标的相互作用网络见图 2。由图 2 可
“柴胡-白术”药对治疗乳腺增生的成分、靶标、通路三者 见,该相互作用网络上共有节点47个、边线352条,其中
之间的复杂网络关系,多方面阐释该药对治疗乳腺增生 圆形节点代表潜在作用靶标,边线代表各靶标之间的相
的作用机制。 互关联。根据该网络图可知,潜在作用靶标之间存在复
2 结果 杂的相互作用关系,因此本团队推测“柴胡-白术”药对
2.1 “柴胡-白术”药对活性成分获取结果 治疗乳腺增生不仅是通过多成分作用于多靶标来发挥
共检索获得“柴胡-白术”药对活性成分 17 个,其中 网络调节作用,还可能会通过潜在作用靶标之间的相互
柴胡活性成分 13 个、白术活性成分 4 个,主要包括乙酸 影响,进而产生了复杂的调节关系,发挥治疗作用。
芳樟酯、黄芩苷、3β-乙酸化苍术酮、8β-乙氧基白术内酯 2.5 核心靶标的筛选及验证结果
Ⅲ等,详见表1。 由图2可见,潜在核心靶标(即节点面积最大的5个
2.2 活性成分-潜在作用靶标的获取结果 节点)分别为 PRKCE、PRKCA、AKT1、PIK3CA、HRas。
根据 DRAR-CPI 服务器检索结果,共获得“柴胡-白 上述靶标与“柴胡-白术”药对的17个活性成分的分子对
术”药对活性成分的预测靶标 128 个;与 Genecards 数据 接结果显示,PRKCE、PRKCA 与 15 个活性成分(均占
库和 OMIM 数据库中获得的乳腺增生的疾病相关靶标 88.2%)具有一定或更强的结合亲和性,AKT1、PIK3A、
进行对比取交集后,共筛选出“柴胡-白术”药对治疗乳 HRas与14个活性成分(均占82.4%)具有一定或更强的
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