Page 51 - 《中国药房》2024年23期
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列,以 20 批地菍石油醚提取物指纹图谱中 19 个共有峰 3.5
3.0
峰面积为比较序列,计算参考序列与比较序列的灰色关 2.5
2.0
1.5
联度值(即关联度),并对关联度大小进行排序,结果见 VIP值 1.0 0
0.5
-0.5
表 5。由表 5 可知,19 个共有峰与 NO、TNF-α 抑制率的 -1.0
-1.5
关联度均大于 0.7,具体为 0.781~0.923,表明共有峰与 17 9 19 13 5 6 15 1 14 16 3 7 2 12 4 8 18 10 11
峰号
药效指标间均有关联性 。由此可得,地菍石油醚提取 A.共有峰与NO抑制率的VIP值
[8]
物的抗炎作用是多成分协同起效的,其中以峰 16、15 对 1.0
应成分的贡献最大;关联度排名前8位的共有峰对应成 0.5 0
分均未知,但这些成分的保留时间靠后,说明其极性相 标准化回归系数 -0.5
-1.0
对较小,后续本课题组将进一步对其进行分离鉴定。 -1.5
-2.0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19
表5 20批地菍石油醚提取物中各共有峰与炎症因子抑 峰号
制率的关联度测定结果 B.共有峰与NO抑制率的标准化回归系数
与NO抑制率的 与NO抑制率的 与TNF-α抑制率的 与TNF-α抑制率的 2.5
共有峰 2.0
关联度 关联度排名 关联度 关联度排名 1.5
峰16 0.923 1 0.901 1 VIP值 1.0
0.5
峰15 0.916 2 0.900 2 0
-0.5
峰13 0.904 3 0.872 7 -1.0
11 8 16 19 4 12 10 2 17 15 14 18 3 13 6 5 7 1 9
峰14 0.901 4 0.882 6
峰号
峰19 0.889 5 0.885 5 C.共有峰与TNF-α抑制率的VIP值
峰18 0.888 6 0.887 3
峰17 0.882 7 0.887 4 4 2
峰12 0.874 8 0.850 8 0
峰11 0.850 9 0.825 13 标准化回归系数 -2
-4
峰5(牡荆素) 0.847 10 0.839 10 -6
峰8 0.846 11 0.837 11 -8 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19
峰10(木犀草素) 0.844 12 0.842 9 峰号
峰7(鞣花酸) 0.840 13 0.827 12 D.共有峰与TNF-α抑制率的标准化回归系数
峰6(异牡荆素) 0.830 14 0.821 14 图3 共有峰与 NO、TNF-α 抑制率的 VIP 值及标准化
峰1 0.818 15 0.815 16 回归系数
峰4 0.808 16 0.816 15
峰2 0.790 17 0.796 17 呈正相关;其余共有峰与TNF-α抑制率的标准化回归系
峰3 0.786 18 0.790 18
峰9(槲皮素) 0.781 19 0.781 19 数均小于0,提示其与TNF-α抑制率呈负相关(图3D)。
2.4 地菍石油醚提取物抗炎活性成分验证
2.3.2 偏最小二乘回归分析
分子对接是一种研究小分子配体与蛋白质受体之
在偏最小二乘回归分析中,回归系数的绝对值可反
间相互作用的理论方法,可针对某一特定的靶标蛋白,
映共有峰对药效指标的贡献程度,其数值越大,则贡献
筛选出具有活性的化合物 [10―11] 。通过谱效关联分析发
越大;变量重要性投影(variable importance in projection,
现,牡荆素、异牡荆素、槲皮素、木犀草素均为地菍发挥
VIP)值可解释自变量对因变量的贡献程度,当VIP值>
[9]
1 时,则表明自变量对因变量有显著贡献 。本研究以 抗炎活性的重要成分。牡荆素、异牡荆素、槲皮素与NO
20批地菍石油醚提取物指纹图谱中19个共有峰的峰面 抑制率呈正相关,而诱导型一氧化氮合酶(inducible ni‐
积为自变量,以NO、TNF-α抑制率为因变量,采用SIMCA tric oxide synthase,iNOS)可高效产生 NO,从而导致炎
[12]
14.1软件进行偏最小二乘回归分析,结果见图3。 症 。因此,本研究选择iNOS为靶点蛋白与牡荆素、异
结果显示,峰 17、9、19、13、5(牡荆素)、6(异牡荆 牡荆素、槲皮素进行分子对接。鞣花酸、木犀草素与
素)、15 与 NO 抑制率的 VIP 值均大于 1(图 3A)。峰 19、 TNF-α抑制率呈正相关,故本研究选择TNF-α为靶点蛋
13、9(槲皮素)、12、5(牡荆素)、6(异牡荆素)、8、7(鞣花 白与鞣花酸、木犀草素进行分子对接。通过 TCMSP 数
酸)、18、1 与 NO 抑制率的标准化回归系数均大于 0,提 据库(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)查找活性成分
示其与 NO 抑制率呈正相关;其余共有峰与 NO 抑制率 并保存为 mol2 格式,在 PDB 数据库(http://www.rcsb.
的标准化回归系数均小于 0,提示其与 NO 抑制率呈负 org/)中找到iNOS、TNF-α蛋白质受体结构并保存为pdb
相关(图 3B)。峰 11、8、16、19、4、12、10(木犀草素)与 格式,通过AutoDock Tools 1.5.7软件设置对接参数。使
TNF-α抑制率的VIP值均大于1(图3C)。峰8、10(木犀 用 Autodock Vina 软件进行分子对接,并计算最低结合
草素)、13、15、3、19、17、7(鞣花酸)、18、1 与 TNF-α 抑制 能。结果显示,牡荆素、异牡荆素、槲皮素与 iNOS 蛋白
率的标准化回归系数均大于 0,提示其与 TNF-α 抑制率 质受体的结合能均小于-5.0 kcal/mol。
中国药房 2024年第35卷第23期 China Pharmacy 2024 Vol. 35 No. 23 · 2881 ·