Page 83 - 《中国药房》2024年21期
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表3 MTRR rs10380 基因型对颅内肿瘤患儿预后的影                                  3.0        P=0.000 012 4
               响[例数(%%)]                                                 2.0
          基因型             CC(n=47)   CT(n=28)      P                     1.0 0
          是否发生转移                                  <0.001               归一化MTRR表达
           否              20(42.55)   21(75.00)                         -1.0
           是              27(57.45)   7(25.00)                          -2.0
          是否复发                                     0.81                 -3.0
           否              38(80.85)   22(78.57)                                 CC     CT      TT
                                                                              (n=172)  (n=32)  (n=1)
           是               9(19.15)   6(21.43)
                                                                                     A.脑皮层
          3.6 生物信息学分析结果                                                  3.0        P=0.000 008 03
              3DSNP v2.0 和 HaploReg v4.2 数据库分析结果显                        2.0
          示,rs10380的功能注释为错义突变,位于转录因子结合                                   1.0
          位点内,有结合转录因子 CTCF 和 YY1 的实验证据,提                               归一化MTRR表达  -1.0 0
          示该位点可能通过影响转录因子与靶基因的结合能力,                                      -2.0
          调控 MTRR 基因表达。表达数量性状基因座分析结果                                    -3.0
                                                                                       CT
                                                                                               TT
          显示,rs10380 基因型与脑皮层和额叶皮层 BA9 区组织                                     (n=147)  (n=27)  (n=1)
                                                                                CC
          中的MTRR基因表达显著相关,CT基因型的MTRR基因                                            B.脑额叶皮层(BA9区)
          表达显著高于CC基因型(P<0.05)。蛋白互作网络分析结                      图1 MTRR rs10380 基因型与脑组织中 MTRR 基因表
          果显示,MTRR 蛋白主要与 MMAA、CYP4F8、SHMT1、                       达的相关性小提琴图
          MTR、MMADHC、MTHFD1、CBS、CBSL、MTHFR、
          LMBRD1等蛋白协同发挥作用。结果见图1、图2。
              对以上分子进行GO功能富集分析,结果显示,生物
          过程条目富集的前5条通路分别为含硫氨基酸生物合成
          过程(sulfur amino acid biosynthetic process)、水溶性维
          生素代谢过程(water-soluble vitamin metabolic process)、
          维生素 B12代谢过程(cobalamin metabolic process)、α-氨
          基酸生物合成过程(alpha-amino acid biosynthetic pro‐
          cess)和细胞氨基酸生物合成过程(cellular amino acid
          biosynthetic process);分子功能条目富集的前 5 条通路
          分别为四吡咯结合(tetrapyrrole binding)、维生素结合                  MMAA:线粒体甲基丙二酸尿症 A 型蛋白;CYP4F8:细胞色素
         (vitamin binding)、维生素 B12结合(cobalamin binding)、     P450 家 族 4 亚 家 族 F 肽 8;SHMT1:丝 氨 酸 羟 甲 基 转 移 酶 1;
          以 NAD 或 NADP 为受体作用于供体 CH—NH 基团的                    MMADHC:线粒体甲基丙二酸尿症和高胱氨酸尿症 D 型蛋白;
          氧化还原酶活性(oxidoreductase activity,acting on the      MTHFD1:亚甲基四氢叶酸脱氢酶、环化水解酶和甲酰四氢叶酸合成
                                                             酶1;CBS:胱硫醚β 合成酶;CBSL:胱硫醚β 合成酶样蛋白;MTHFR:
          CH—NH group of donors,NAD or NADP as acceptor)和
                                                             亚甲基四氢叶酸还原酶;LMBRD1:人类可能的溶酶体钴胺素转运
          作用于供体 CH—NH 基团的氧化还原酶活性(oxidore‐                    蛋白。
          ductase activity,acting on the CH—NH group of donors),      图2 MTRR蛋白互作网络分析图
          具体见图3A。KEGG通路富集分析结果显示,富集的前
                                                             表明,MTRR rs162049与rs10380的风险单倍体型能够显
          5 条通路分别为一碳单位库(one carbon pool by folate),
          氨基酸生物合成(biosynthesis of amino acids),半胱氨酸          著提高同型半胱氨酸水平,且其蛋白表达量低于野生
                                                               [6]
          和蛋氨酸代谢(cysteine and methionine metabolism),甘       型 。这一发现为作者团队推测 MTRR 基因多态性与
          氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(glycine,serine and threonine          MTX药效及不良反应之间的关系提供了线索。尽管目
          metabolism)和抗叶酸药耐药(antifolate resistance),具体       前已有研究关注于 MTRR rs1801394 位点的多态性,但
          见图3B。                                              关于MTRR rs10380位点多态性与颅内肿瘤患儿MTX血
          4 讨论                                               药浓度及不良反应相关性的研究仍然较为缺乏,因此本
              MTRR基因位于人类5号染色体上,全长达2 094个                     研究探讨了颅内肿瘤患儿中 MTRR rs10380 C>T 多态
          碱基对,MTRR rs10380 是在 MTRR 基因外显子 14 上发               性的分布特点及其与 MTX 血药浓度、不良反应和预后
          生的错义突变,这一突变导致第 1 783 个碱基由 C 变为                     的相关性,旨在为此类人群安全应用 MTX 提供理论
                                               [12]
          T,使得第595个氨基酸由组氨酸变为酪氨酸 。有研究                         依据。

          中国药房  2024年第35卷第21期                                              China Pharmacy  2024 Vol. 35  No. 21    · 2649 ·
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