Page 83 - 《中国药房》2024年21期
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表3 MTRR rs10380 基因型对颅内肿瘤患儿预后的影 3.0 P=0.000 012 4
响[例数(%%)] 2.0
基因型 CC(n=47) CT(n=28) P 1.0 0
是否发生转移 <0.001 归一化MTRR表达
否 20(42.55) 21(75.00) -1.0
是 27(57.45) 7(25.00) -2.0
是否复发 0.81 -3.0
否 38(80.85) 22(78.57) CC CT TT
(n=172) (n=32) (n=1)
是 9(19.15) 6(21.43)
A.脑皮层
3.6 生物信息学分析结果 3.0 P=0.000 008 03
3DSNP v2.0 和 HaploReg v4.2 数据库分析结果显 2.0
示,rs10380的功能注释为错义突变,位于转录因子结合 1.0
位点内,有结合转录因子 CTCF 和 YY1 的实验证据,提 归一化MTRR表达 -1.0 0
示该位点可能通过影响转录因子与靶基因的结合能力, -2.0
调控 MTRR 基因表达。表达数量性状基因座分析结果 -3.0
CT
TT
显示,rs10380 基因型与脑皮层和额叶皮层 BA9 区组织 (n=147) (n=27) (n=1)
CC
中的MTRR基因表达显著相关,CT基因型的MTRR基因 B.脑额叶皮层(BA9区)
表达显著高于CC基因型(P<0.05)。蛋白互作网络分析结 图1 MTRR rs10380 基因型与脑组织中 MTRR 基因表
果显示,MTRR 蛋白主要与 MMAA、CYP4F8、SHMT1、 达的相关性小提琴图
MTR、MMADHC、MTHFD1、CBS、CBSL、MTHFR、
LMBRD1等蛋白协同发挥作用。结果见图1、图2。
对以上分子进行GO功能富集分析,结果显示,生物
过程条目富集的前5条通路分别为含硫氨基酸生物合成
过程(sulfur amino acid biosynthetic process)、水溶性维
生素代谢过程(water-soluble vitamin metabolic process)、
维生素 B12代谢过程(cobalamin metabolic process)、α-氨
基酸生物合成过程(alpha-amino acid biosynthetic pro‐
cess)和细胞氨基酸生物合成过程(cellular amino acid
biosynthetic process);分子功能条目富集的前 5 条通路
分别为四吡咯结合(tetrapyrrole binding)、维生素结合 MMAA:线粒体甲基丙二酸尿症 A 型蛋白;CYP4F8:细胞色素
(vitamin binding)、维生素 B12结合(cobalamin binding)、 P450 家 族 4 亚 家 族 F 肽 8;SHMT1:丝 氨 酸 羟 甲 基 转 移 酶 1;
以 NAD 或 NADP 为受体作用于供体 CH—NH 基团的 MMADHC:线粒体甲基丙二酸尿症和高胱氨酸尿症 D 型蛋白;
氧化还原酶活性(oxidoreductase activity,acting on the MTHFD1:亚甲基四氢叶酸脱氢酶、环化水解酶和甲酰四氢叶酸合成
酶1;CBS:胱硫醚β 合成酶;CBSL:胱硫醚β 合成酶样蛋白;MTHFR:
CH—NH group of donors,NAD or NADP as acceptor)和
亚甲基四氢叶酸还原酶;LMBRD1:人类可能的溶酶体钴胺素转运
作用于供体 CH—NH 基团的氧化还原酶活性(oxidore‐ 蛋白。
ductase activity,acting on the CH—NH group of donors), 图2 MTRR蛋白互作网络分析图
具体见图3A。KEGG通路富集分析结果显示,富集的前
表明,MTRR rs162049与rs10380的风险单倍体型能够显
5 条通路分别为一碳单位库(one carbon pool by folate),
氨基酸生物合成(biosynthesis of amino acids),半胱氨酸 著提高同型半胱氨酸水平,且其蛋白表达量低于野生
[6]
和蛋氨酸代谢(cysteine and methionine metabolism),甘 型 。这一发现为作者团队推测 MTRR 基因多态性与
氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(glycine,serine and threonine MTX药效及不良反应之间的关系提供了线索。尽管目
metabolism)和抗叶酸药耐药(antifolate resistance),具体 前已有研究关注于 MTRR rs1801394 位点的多态性,但
见图3B。 关于MTRR rs10380位点多态性与颅内肿瘤患儿MTX血
4 讨论 药浓度及不良反应相关性的研究仍然较为缺乏,因此本
MTRR基因位于人类5号染色体上,全长达2 094个 研究探讨了颅内肿瘤患儿中 MTRR rs10380 C>T 多态
碱基对,MTRR rs10380 是在 MTRR 基因外显子 14 上发 性的分布特点及其与 MTX 血药浓度、不良反应和预后
生的错义突变,这一突变导致第 1 783 个碱基由 C 变为 的相关性,旨在为此类人群安全应用 MTX 提供理论
[12]
T,使得第595个氨基酸由组氨酸变为酪氨酸 。有研究 依据。
中国药房 2024年第35卷第21期 China Pharmacy 2024 Vol. 35 No. 21 · 2649 ·