Page 24 - 《中国药房》2023年17期
P. 24
3.4 大鼠肠道菌群分析结果 3.4.3 肠道菌群结构分析结果
3.4.1 Alpha多样性分析结果 如图3所示,在门水平下与CON组比较,MOD组大
如表 2 所示,各组样本的 Goods-coverage 指数均大 鼠粪便中拟杆菌门(Bacteroidota)和变形菌门(Proteo‐
于 0.98,表明测序结果良好,能够反映各样本的微生物 bacteria)的相对丰度显著升高(P<0.01),厚壁菌门(Fir‐
[11]
群 落 情 况 。 与 CON 组 比 较 ,MOD 组 的 Observed- micutes)的相对丰度显著降低(P<0.01);与 MOD 组比
species、Shannon、Simpson、Chao1 指数均显著降低(P< 较,SGD-L组大鼠粪便中拟杆菌门和变形菌门的相对丰
0.01),说明 ALI 大鼠肠道内菌群的丰富度和多样性降 度显著降低(P<0.01),厚壁菌门的相对丰度显著升高
低。与 MOD 组比较,SGD-L 组上述 4 项指数均显著升 (P<0.01)。
高(P<0.05或P<0.01),表明SGD能够增加ALI大鼠肠 100
道内菌群的丰富度和多样性,恢复其菌群结构。
75 Firmicutes
表 2 各组大鼠肠道菌群的 Alpha 多样性分析结果 Bacteroidota
(n=6) 相对丰度/% 50 Proteobacteria
Actinobacteriota
Verrucomicrobiota
Observed-species Shannon指数 Simpson指数 Chao1指数 Goods-coverage Campylobacterota
Patescibacteria
组别 Desulfobacterota
指数(x±s) (x±s) (x±s) (x±s) 指数 25 Cyanobacteria
CON组 746.00±89.08 7.21±0.58 0.98±0.02 746.59±88.94 0.99 Other
MOD组 454.50±170.20 a 4.95±1.45 a 0.86±0.07 a 454.68±170.29 a 0.99 0
SGD-L组 719.67±150.83 b 7.00±0.80 c 0.97±0.02 b 720.32±151.11 b 0.99 MOD1 MOD2 MOD3 MOD4 MOD5 MOD6 SGD-L1 SGD-L2 SGD-L3 SGD-L4 SGD-L5 SGD-L6
a:与CON组比较,P<0.01;b:与MOD组比较,P<0.05;c:与MOD CON1 CON2 CON3 CON4 CON5 CON6
组比较,P<0.01。 图3 各组大鼠粪便中门水平菌群物种的相对丰度结果
3.4.2 Beta多样性分析结果 如图4所示,在属水平下与CON组比较,MOD组大
在 PCoA 图和 NMDS 图中,各组样本内部均能够显 鼠粪便中乳杆菌属(Lactobacillus)、大肠埃氏菌属-志贺
著聚类,表明各组样本内部肠道菌群趋于一致。CON组 氏菌属(Escherichia-Shigella)和链球菌属(Streptococ‐
和 MOD 组的菌群结构组成差异显著(P<0.05),表明 cus)的相对丰度显著升高(P<0.05 或 P<0.01),梭状芽
ALI大鼠的肠道菌群结构发生了紊乱;SGD-L组的肠道 孢杆菌属(Clostridia_UCG-014)、毛螺菌属(Lachnospira
菌群结构偏离了 MOD 组,并趋向 CON 组,表明经 SGD ceae_NK4A136_group)、厚壁菌属(Firmicutes)的相对丰
干预后,ALI大鼠的肠道菌群结构向正常状态回调。结 度 显 著 降 低(P<0.05 或 P<0.01);与 MOD 组 比 较 ,
果见图2。 SGD-L 组大鼠粪便中乳杆菌属、大肠埃氏菌属-志贺氏
菌属和链球菌属的相对丰度显著降低(P<0.05 或 P<
0.01),梭状芽孢杆菌属、毛螺菌属、瘤胃球菌属(Rumino‐
0.25
coccus)、杜氏杆菌属(Dubosiella)、阿克曼菌属(Akker‐
( 11.83% ) 0 CON组 mansia)的相对丰度显著升高(P<0.05 或 P<0.01)。上
述结果表明,SGD 能够逆转 ALI 大鼠的肠道菌群紊乱,
PCoA2 R=0.771 6 MOD组 并使其恢复到与正常情况相似的菌群结构。
P=0.001
SGD-L组
-0.25 100 Lactobacillus
Clostridia_UCG-014
Escherichia-Shigella
Muribaculaceae
75 Firmicutes
-0.4 -0.2 0 0.2 Lachnospiraceae_NK4A136_group
Ruminococcus
相对丰度/% Eubacterium_coprostanoligenes
PCoA1(60.04%) Allobaculum
Bacteroides
A. PCoA图 50 Lachnospiraceae
Clostridiales
NK4A214_group
Monoglobus
25 Akkermansia
Klebsiella
0.2 Streptococcus
Phascolarctobacterium
Dubosiella
0 Others
MDS2 0 R=0.771 6 CON组 CON1 CON2 CON3 CON4 CON5 CON6 MOD1 MOD2 MOD3 MOD4 MOD5 MOD6 SGD-L1 SGD-L2 SGD-L3 SGD-L4 SGD-L5 SGD-L6
P=0.001 MOD组
SGD-L组
图4 各组大鼠粪便中属水平菌群物种的相对丰度
-0.2
3.4.4 菌群差异分析结果
CON 组与 MOD 组、MOD 组与 SGD-L 组大鼠的肠
-0.25 0 0.25 道菌群组成和结构均存在显著差异。相比于 CON 组,
MDS1
B. NMDS图 MOD 组的差异菌属为乳杆菌属、链球菌属和大肠埃氏
图2 各组大鼠肠道菌群的Beta多样性分析结果 菌属-志贺氏菌属;相比于 MOD 组,SGD-L 组的差异菌
· 2066 · China Pharmacy 2023 Vol. 34 No. 17 中国药房 2023年第34卷第17期