Page 50 - 《中国药房》2021年24期
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tone and other components may be important nodes of the target network related to active component-PAA. FOS,APP,ACHE,
        CASP3 and PTGS2 may be the hub genes in PPI network of intersecting targets. Results of GO enrichment showed that the
        intersecting targets were mainly concentrated in adrenergic receptor activity,catecholamine binding,G protein-coupled amine
        receptor activity and so on;KEGG pathway enrichment analysis showed that the intersecting targets were mainly enriched in
        neuroactive ligand-receptor interaction, cGMP-PKG signaling pathway, endocrine resistance, EGFR-tyrosine kinase inhibitor
        resistance and calcium signaling pathway.Molecular docking analysis showed that tanshinone Ⅱ A could form hydrogen bonds with
        many amino acid residues such as VAL-580 of proto oncogenes c-Fos,amyloid precursor protein,acetylcholinesterase,caspase 3
        and prostaglandin G/H synthase 2. CONCLUSIONS:The active components of S. miltiorrhiza play a role in the treatment of PAA
        by directly or indirectly acting on neuroactive ligand-receptor interaction,cGMP-PKG signaling pathway,endocrine resistance,
        EGFR-tyrosine kinase inhibitor resistance resistance and calcium signaling pathway.
        KEYWORDS     Postoperative abdominal adhesion;Salvia miltiorrhiza;Network pharmacology;Molecular docking



            术后腹腔粘连(PAA)是腹部手术后的常见并发症,                        白,然后利用 Perl 数据库(http://www.perl.org/)和 Uni-
        临床表现为腹腔内脏器之间或脏器与腹壁之间的异常                             Prot 数据库(http://www.uniprot.org/uploadlists/)获取靶
        病理性连接,可导致小肠梗阻、女性不孕、慢性腹腔疼痛                           点蛋白对应的基因,去重后即得到丹参活性成分的靶点
                                          [1]
        等,给患者带来沉重的经济和精神负担 。既往研究表                            基因。
        明,PAA 的形成与炎症反应、免疫反应、纤维蛋白溶解、                         1.3 PAA相关靶点基因的筛选
        胶原降解、氧化应激等过程密切相关               [2-5] 。                  利 用 GeneCards 数 据 库(http://www.genecards.
            丹参Salvia miltiorrhiza Beg.是我国著名的传统中药            org/)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM,http://omim.
        材,临床应用已有数千年的历史,具有抗炎、抗氧化、抗                           org/)和 PubMed 数 据 库(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.
                           [6]
        肿瘤等多种药理活性 。研究发现,含有丹参的中药复                            gov/)等3个数据库,以“postoperative abdominal adhesion”
        方如丹红注射液、常通口服液等对PAA均有良好的治疗                           或“PAA”“abdominal adhesion,postoperative”“postopera-
        效果   [7-8] 。然而,丹参治疗 PAA 的具体作用机制目前尚                  tive peritoneal adhesion”“PAA”或“peritoneal adhesion,
        不明确。中药常通过多靶点协同发挥治疗作用,使得其                            postoperative”为关键词,检索与PAA相关的靶点基因。
        作用机制研究的开展较为困难。网络药理学主要研究                             1.4  成分-疾病交叉靶点的筛选
        药物与疾病之间的生物网络,其能识别、预测中药活性                                利用生物信息学在线数据库作图工具(http://bioin-
        成分与疾病靶点基因之间可能的结合位点,而分子对接                            formatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)获得维恩(Venn)
        技术则有助于进一步研究活性成分与靶点的对接方                              图,筛选出丹参活性成分靶点基因与PAA相关靶点基因
          [9]
        式 。基于此,本研究拟从网络药理学和分子对接两方                            的交叉靶点。
        面探讨丹参治疗PAA的潜在作用机制,为相关基础和临                           1.5  网络构建与分析
        床研究提供新的方向。                                              将“1.4”项下所得靶点导入 STRING 平台(https://
        1 资料与方法                                             string-db.org)构建蛋白互作(PPI)网络。采用 Cytoscape
        1.1  丹参活性成分的筛选                                      3.7.1 软件构建可视化网络,包括活性成分预测靶点网
            利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP,                         络、PAA相关靶点网络、活性成分-PAA相关靶点网络和
        http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)收集并选择口服生物利          交叉靶点的 PPI 网络。在网络中,节点(degree)用于表
        用度(OB)≥30%、类药性指数(DL)≥0.18、Caco-2细胞                  示成分或靶点蛋白,边(edge)用于表示成分、疾病和靶
        渗透性≥0.4 的丹参活性成分           [10-12] 。其中,OB 是口服药       点蛋白之间的关系。利用 Cytoscape 3.7.1 的 CytoHubba
                                                                                       [12]
        物的重要药动学指标,代表活性成分经口服后进入体循                            插件来探索网络中的重要节点 。为考察靶点基因与
        环并产生理化效应的能力;DL 是判断活性成分相似性                           其邻近靶点基因之间的关系以及基因与整个网络的关
        的指标,通过与已知药物进行比较来确定某种活性成分                            系,本研究采用接近中心性(closeness centrality)、度中心
        是否具有治疗作用;Caco-2细胞渗透性是一种基于化学                         性(degree centrality)和最大邻居组件(maximum neigh-
        结构和理化特性的“金标准”渗透性筛选试验方法的重                            borhood component)3 个指标对丹参治疗 PAA 的枢纽基
        要指标。然后,利用 SwissADME 数据库(http://www.                 因进行分析     [16-17] 。
        swissadme.ch/index.php)检索并选择具有高胃肠道吸收                1.6 GO和KEGG通路富集分析
        的候选活性成分作为后续分析的活性成分                  [13-15] 。           使用带有生物导体包的 R3.6.1 软件对交叉靶点基
        1.2  丹参活性成分靶点基因的筛选                                  因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书
            利用 TCMSP 数据库获得丹参活性成分的靶点蛋                       (KEGG)通路富集分析(P<0.05)及可视化展示。


        ·2988 ·  China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 24                                 中国药房    2021年第32卷第24期
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