Page 51 - 《中国药房》2021年第6期
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500
0.1
400
0.01
%
个 300
OTUs数量, 空白对照组1 相对丰度, 0.001 空白对照组
空白对照组2
200
空白对照组3
空白对照组4
空白对照组5
空白对照组6
模型组1 模型组
100 模型组2 0.000 1
模型组3
模型组4
模型组5
模型组6
0
0 10 000 20 000 30 000 40 000 50 000 60 000 70 000 0 100 200 300 400 500 600
序列数量 物种等级
A.样本稀释曲线 B.等级聚类曲线
700 空白对照组 模型组
600
个
观察到的物种, 500 112 580 63
400
300
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
样本数量
C.物种累积箱形图 D.分组OTUs韦恩图
图1 造模期大鼠粪便样本DNA测序质量评估及肠道菌群的Alpha多样性分析结果
Fig 1 Results of DNA sequencing quality evaluation and Alpha diversity analysis of intestinal flora in fecal samples of
rats during modeling period
(P<0.01),说明空白对照组大鼠肠道菌群的多样性显 两组大鼠肠道中细菌组成的相似度聚类可分成2类,模
著高于模型组。模型组大鼠Chao1、ACE指数虽低于空 型组除有1只大鼠与空白对照组归为同类外,其余均为
白对照组,但差异无统计学意义(P>0.05)。空白对照 不同类,表明空白对照组大鼠的肠道菌群整体与模型组
组和模型组大鼠的 Goods coverage 均为 0.99,这进一步 不同。造模期大鼠肠道菌群的 Beta 多样性分析结果见
表明两个组的测序深度足够,样品中序列未被检测到的 图2。
可能性较低。造模期两组大鼠肠道菌群的Alpha多样性 3.1.4 造模期大鼠肠道菌群结构组成分析结果 在门
指数统计结果见表1。 水平上,空白对照组和模型组大鼠的优势菌门均为厚壁
表1 造模期两组大鼠肠道菌群的Alpha多样性指数统 菌门和拟杆菌门,但与空白对照组比较,模型组大鼠肠
计结果(x±±s,n=6) 道中厚壁菌门丰度显著降低(P<0.05),拟杆菌门丰度
Tab 1 Statistical results of Alpha diversity indexes of 显著升高(P<0.05),厚壁菌门/拟杆菌门(F/B)比值分别
intestinal flora of rats in 2 groups during mo- 为1.87和0.67。在属水平上,空白对照组大鼠的优势菌
deling period(x±±s,n=6) 属为拟杆菌属和乳杆菌属,而模型组大鼠的优势菌属为
组别 Shannon指数 Chao1指数 ACE指数 Goods coverage 拟杆菌属和 Romboutsia。空白对照组大鼠肠道中乳杆
空白对照组 4.55±0.55 457.00±78.36 460.39±81.13 0.99±0.00 菌属、双歧杆菌属(因排序不在前10,限于篇幅结果未详
模型组 3.27±0.62 ** 421.77±51.10 428.01±47.99 0.99±0.00
细展示)以及考拉杆菌属、阿克曼氏菌属的丰度均显著
**
注:与空白对照组比较, P<0.01
Note:vs. blank control group, P<0.01 高于模型组(P<0.05),而拟杆菌属、肠球菌属和粪芽孢
**
3.1.3 造模期大鼠肠道菌群的 Beta 多样性分析结果 菌属(因排序不在前10,限于篇幅结果未详细展示)的丰
NMDS分析结果显示,空白对照组和模型组大鼠肠道 度均显著低于模型组(P<0.05)。造模期两组大鼠肠道
中菌群分为2群,并分布在不同区域,表明两组大鼠肠道 菌群(丰度排名前10位)结构组成分析结果见表2(表中
菌群存在明显差异。UPGMA 样本聚类分析结果显示, 数值为0.00±0.00的表示其对应菌株的丰度<0.005)。
中国药房 2021年第32卷第6期 China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 6 ·685 ·