Page 28 - 《中国药房》2025年22期
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2.1.4 色谱条件 血成分作用靶点通过jvenn在线网站(https://www.bioin‐
采用 Inertsil ODS-3(150 mm×2.1 mm,2 μm)色谱 formatics.com.cn)进行交集分析,获取交集靶点。
柱,以 0.1% 甲酸(A)-乙腈(B)为流动相进行梯度洗脱 2.2.3 蛋白-蛋白互作网络的构建
(0~4 min,5%B;4~10 min,5%B→8%B;10~12 min, 将交集靶点导入STRING数据库(https://cn.string-db.
8%B;12~20 min,8%B→18%B;20~24 min,18%B→ org/),设置物种为“Homo sapiens”、置信值>0.9,进行蛋
20%B;24~28 min,20%B→23%B;28~34 min,23%B→ 白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析。
30%B;34~38 min,30%B→38%B;38~42 min,38%B→ 利用 Cytoscape 3.9.1 软件对 PPI 网络进行可视化分析。
68%B;42~46 min,68%B→90%B;46~48 min,90%B); 通过 Cytoscape 3.9.1 软件内置的 Analyze Network 工具
柱温为35 ℃;流速为0.3 mL/min;进样量为2 μL。 计算各节点的“degree”值,选取“degree”值>2倍中位数
2.1.5 质谱条件 的靶点作为关键靶点。
采用电喷雾离子源在正、负离子模式下扫描,离子 2.2.4 基因功能和通路富集分析
源电压分别为 5 000 V(正离子)和-4 000 V(负离子), 将 筛 选 出 的 关 键 靶 点 导 入 DAVID 6.8 数 据 库
扫描范围为 m/z 50~1 000;离子源温度为 200 ℃;雾化 (https://david.ncifcrf.gov/),进行基因本体(Gene Onto-
气压力为 29 psi;毛细管电压为 3.5 V;喷雾气压力为 50 logy,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto
psi;辅助加热气压力为60 psi;气帘气压力为35 psi;去簇 Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分
1
电压为 100 V;MS 碰撞能量分别为 10 V(正离子)和 析,预测鸡骨草、毛鸡骨草抗肝炎关键靶点涉及的生物
2
-10 V(负离子),MS 碰撞能量分别为10 V(正离子)和 功能与信号通路。
-10 V(负离子),碰撞能量步长为 15 V;候选离子数为 2.2.5 “活性成分-靶点”网络的构建
550(正离子)和450(负离子);干燥气体流量为8 L/min。 将筛选获得的关键靶点及其对应的活性成分数据
2.1.6 血清样品的前处理 导入Cytoscape 3.10.0软件,构建“活性成分-靶点”网络。
取各组大鼠每个时间点的血浆各50 μL,混匀,加入 2.3 分子对接
600 μL 甲醇,涡旋 3 s 以沉淀蛋白。将混合物在 4 ℃下 选取“活性成分-靶点”网络中排名前 4 位的活性成
以 13 000 r/min 离心 10 min。干燥后,将残留物复溶于 分,以及 PPI 网络中排名靠前且与所选活性成分均存在
100 μL 甲醇中,经 0.22 μm 微孔滤膜过滤,收集滤液作 相互作用的靶点,将二者导入Autodock软件进行分子对
为血清供试品。 接,并用Pymol软件对对接结果进行可视化分析。
2.1.7 样品进样及数据分析 3 结果
取“2.1.2”项下混合对照品溶液和“2.1.6”项下血清 3.1 鸡骨草与毛鸡骨草入血成分分析结果
供试品,分别按“2.1.4”“2.1.5”项下条件进样分析,收集 通过对比混合对照品、空白血清、鸡骨草含药血清
色谱图及质谱信息。使用 Data Analysis 4.3 软件对所采 和毛鸡骨草含药血清的基峰图,并结合保留时间、准分
集的数据进行分析。通过查阅豆科相思子属植物化学 子离子峰和二级质谱碎片信息等,从鸡骨草、毛鸡骨草
成分的相关文献,建立化学成分数据库,根据化合物名 含药血清中均鉴定出35种原型成分,且均以黄酮类成分
称、分子式、相对分子质量以及已知的特征离子碎片等 为主。鸡骨草与毛鸡骨草含药血清中共有 24 种相同原
信息,设置各化合物的相对分子质量误差为±5 ppm、二 型成分,包括葫芦巴碱、半乳糖、半乳糖醛酸等。此外,
级碎片离子误差为±10 ppm,对化合物进行鉴定。 邻羟基苯甲酸、相思子碱等11种成分仅在鸡骨草含药血
2.2 鸡骨草与毛鸡骨草入血成分的网络药理学分析 清中检测到,葡萄糖酸、天冬氨酸等11种成分仅在毛鸡
2.2.1 活性成分作用靶点的获取 骨草含药血清中检测到。鉴定的入血成分信息见表 1
通过 Chemical Book(https://www.chemicalbook.com/) (基峰图可扫描本文首页二维码,进入“增强出版”页面
和 PubChem 数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) 查看附图1)。
获取“2.1”项下鉴定出的各成分的化学结构信息,将mol 3.2 网络药理学分析结果
和 SMILES 格 式 的 文 件 导 入 PharmMapper 数 据 库 3.2.1 药材入血成分与抗肝炎交集靶点及PPI网络
(http://lilab-ecust.cn/pharmmapper/)和 Swiss Target Pre‐ 鸡骨草、毛鸡骨草的入血成分作用靶点分别有803、
diction 数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/),收 918个,二者与肝炎疾病(相关靶点1 975个)的交集靶点
集鸡骨草与毛鸡骨草入血成分的作用靶点。 分别有 269、291 个。PPI 网络分析结果显示,信号传导
2.2.2 交集靶点的获取 与转录激活因子 3、类固醇受体共激活因子(steroid re‐
以“hepatitis”为 关 键 词 ,从 OMIM(https://omim. ceptor coactivator,SRC)、表皮生长因子受体(epidermal
org/)、GeneCards(https://www.genecards.org/)和 TTD 数 growth factor receptor,EGFR)、磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸
据库(https://db.idrblab.net/ttd/)中检索疾病相关靶点,以 3-激酶催化亚基 α(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate
相关性评分(relevance score)大于其平均值(1.9分)作为 3-kinase catalytic subunit alpha,PIK3CA)、蛋 白 激 酶 B1
筛选标准,经合并、去重后,将其与鸡骨草、毛鸡骨草入 (protein kinase B1,Akt1)等均为PPI网络核心靶点(图略)。
· 2774 · China Pharmacy 2025 Vol. 36 No. 22 中国药房 2025年第36卷第22期

