Page 10 - 《中国药房》2024年14期
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3.1.3 脑脊液样本 放入无菌采样管内,标记条码后立即送检。
脑脊液是诊断中枢神经系统感染最主要的样本。 3.1.9 菌液样本
对采集部位皮肤消毒后,通常在第 3、4 腰椎或第 4、5 腰 用于靶向WGS的菌液样本,通常需要培养获得,因
椎间隙插入带有管芯针的空针,进针至蛛网膜间隙,拔 此需要测试合适的分离纯化及培养条件,从临床样本中
去管芯针,收集脑脊液。为防止污染,建议取第二管以 得到纯培养物;用于非靶向PCR-Free WGS的菌液样本,
后的脑脊液,约3~5 mL,标记条码后立即送检。 应保证采集的样本所提取的核酸>1 μg,菌液采集后置
3.1.4 胸腔积液、腹水、关节积液和尿液样本 于5 mL无菌管中,标记条码后立即送检。
(1)胸腔积液/腹水/关节积液一般由临床医师经皮 3.2 样本运输及保存
穿刺或外科方式获得。通过影像学、超声等技术定位穿 (1)样本应根据实际送检情况选择合适的运输方
刺部位后,消毒穿刺部位皮肤,麻醉穿刺部位,用中空孔 式:若样本可在 24 h 内送达实验室并开始检测,可考虑
针穿刺至目标部位,抽取胸腔积液/腹水/关节积液样本 用冰袋低温运输;若运输时间在 24~72 h 内,应使用干
5 mL于无菌管中,标记条码后立即送检。 冰运输,送达实验室后应立即进行样本前处理和核酸提
(2)尿液一般由受检者自行采集。受检者清晨采集 取,以防止核酸降解影响检测效果 [16―17] 。运输过程中应
中段尿样本 5 mL 于无菌采样管中,标记条码后立即 尽量避免剧烈颠簸,以规避漏液导致的污染风险。若怀
送检。
疑高致病性或新发突发传染病,运输中应严格按照《传
3.1.5 脓肿样本
染病防治法(2013修正)》等相关法规要求及实验室安全
对于开放性脓腔,先用无菌生理盐水清洁创面,再 [18]
管理要求 进行包装及转运。若外送至第三方测序公
用拭子采集深部伤口或溃疡基底部的分泌物,或剪取深
司测序,应尽可能在生物安全防护条件下抽提核酸,然
部病损边缘的组织;对于封闭的脓肿,先对病灶局部的
后用干冰运输。
皮肤或黏膜表面彻底消毒,再用注射器抽取脓液3 mL,
(2)样本采集完成后应立即送检,若无法立即送检,
或将脓肿切开引流后,取脓肿壁的一部分送检;对于瘘
可暂存于4 ℃的环境中(不超过7 h),且需当天送检;若
管或窦道脓肿,最好在外科探查时采集最深处组织。样
短期内不送检,样本应立即置于-20 ℃以下冰箱暂存
本采集完放入无菌采样管内,标记条码后立即送检。
(不得超过7 d);长期保存应立即置于-80 ℃冰箱保存。
3.1.6 深部组织样本
RNA 测序样本应直接置于-80 ℃冰箱保存 [16―17] 。保存
深部组织样本一般在手术探查时才可获得,应采集
过程中应尽量避免反复冻融(一般不超过3次)。
3
足够量的组织样本,一般以≥5 mm 为宜,至少绿豆大
4 检测过程
小。小块组织宜用1~2 mL无菌水或生理盐水保湿,大
4.1 样本前处理
块组织应剪碎后取适量分装到无菌采样管内,标记条码
按照前述各个样本的相应要求进行样本的采集及
后立即送检。
运输保存,防止污染和核酸降解,并及时做好样本初始
3.1.7 房水/玻璃体液样本
状态的记录。
房水/玻璃体液样本的采集一般由培训过的眼科医
各实验室应建立样本前处理的标准操作流程,包括
师在手术室内完成。房水样本,需麻醉患者并进行常规
结膜囊清洁后,用1 mL无菌注射器,于角巩膜缘平行虹 样本液化、样本浓缩及去除宿主等前处理方法。对于不
膜平面穿刺入前房,抽取房水约0.1 mL;玻璃体液样本, 同类型的临床样本,应建立针对性的前处理程序。例
则于角巩膜缘后平坦部垂直巩膜向眼球中心方向穿刺 如,对于痰液等黏性较高的样本,需进行液化处理,且各
入玻璃体腔 10 mm,抽取尽可能多的玻璃体样品(不少 实验室应针对液化过程建立样本黏稠程度分级、液化液
于 0.2 mL)。样本采集完放入无菌采样管内,标记条码 使用体积、液化时间等标准化程序,以保证微生物核酸
后立即送检。 的完整性;对于血液样本,需根据实际检测需求决定是
3.1.8 粪便样本 否离心进行血浆分离;对于组织样本,为提高核酸提取
[7]
粪便样本一般由受检者自行采集,通常根据项目检 效率,需先将其切碎后再进行操作 。样本提取前是否
测需求选择自然排便法或直肠拭子法。自然排便法采 需要去除宿主细胞或核酸,应结合样本类型及应用方向
集时需注意:应弃去前段容易污染的部分,选择中段粪 综合考虑。例如,tNGS 可靶向捕获特异性病原微生物
便0.5~1 g(约黄豆粒大小);直肠拭子法采集时需注意: 的核酸,人源核酸对检测结果的干扰较小;而对于
先用肥皂水将肛门周围洗净,将沾有无菌生理盐水的棉 mNGS 而言,如果样本中宿主细胞含量较高,在测序数
拭子插入肛门4~5 cm(儿童为2~3 cm),将棉拭子与直 据量恒定的条件下,会导致病原微生物检测的灵敏度降
肠黏膜表面接触,轻轻旋转拭子,拭子上可明显见到粪 低,因此,高宿主背景样本提取前可考虑采用经过验证
[6]
便即可,最好采集2个或以上拭子。样本采集完,将拭子 的方法去除宿主细胞或核酸 。
· 1676 · China Pharmacy 2024 Vol. 35 No. 14 中国药房 2024年第35卷第14期