Page 7 - 《中国药房》2024年14期
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·指南与共识·
纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识
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张述耀 ,侯铁英 ,黎小妍 ,钟诗龙 ,伍俊妍 ,黄 彬 ,中国药理学会治疗药物监测研究专业基层委员会,
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广东省药学会临床治疗精准用药专家委员会,《纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识》编写组[1.暨
南大学附属广州红十字会医院临床精准治疗中心,广州 510240;2.华中科技大学协和深圳医院(南山医院),
广东 深圳 518101;3. 中山大学附属第六医院药学部,广州 510510;4. 广东省人民医院药学部,广州
519041;5.中山大学孙逸仙纪念医院药学部,广州 510120;6.中山大学附属第一医院检验科,广州 510080]
中图分类号 R446.5 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2024)14-1673-10
DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2024.14.01
摘 要 目的 提高危重症感染性疾病的诊断及救治水平,规范纳米孔测序的临床应用,促进该技术的良性发展。方法 由中国药
理学会治疗药物监测研究专业基层委员会和广东省药学会临床治疗精准用药专家委员会发起并组织多学科专家,采用名义群体
法讨论确定共识编写大纲,形成共识初稿;采用德尔菲法进行专家咨询,对专家意见进行分析和修订,形成共识。结果与结论 最
终制定的《纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识》涵盖了靶向测序、宏基因组测序和全基因组测序等方向,对纳米孔测
序的样本采集与保存、检测过程、生物信息学分析、报告解读等全流程进行了规范,并对其中的关键问题给出了推荐意见。
关键词 第三代测序;纳米孔测序;病原微生物;危重症感染;临床检验;微生物学诊断
Expert consensuses on the application of nanopore sequencing technology in the detection of pathogenic
microorganisms
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ZHANG Shuyao , HOU Tieying , LI Xiaoyan , ZHONG Shilong , WU Junyan , HUANG Bin , Division of
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Therapeutic Drug Monitoring of Chinese Pharmacological Society, Expert Committee of Precision Medicine for
Clinical Treatment of Guangdong Pharmaceutical Association, the Writing Group of the Expert Consensuses on
the Application of Nanopore Sequencing Technology in the Detection of Pathogenic Microorganisms[1. Clinical
Precision Treatment Center, the Affiliated Guangzhou Red Cross Hospital, Jinan University, Guangzhou
510240, China;2. Huazhong University of Science and Technology Union Hospital (Nanshan Hospital),
Guangdong Shenzhen 518101, China;3. Dept. of Pharmacy, the Sixth Affiliated Hospital of Sun Yat-sen
University, Guangzhou 510510, China;4. Dept. of Pharmacy, Guangdong Provincial People’s Hospital,
Guangzhou 519041, China;5. Dept. of Pharmacy, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University,
Guangzhou 510120, China;6. Dept. of Clinical Laboratory, the First Affiliated Hospital of Sun Yat-sen
University, Guangzhou 510080, China]
ABSTRACT OBJECTIVE To improve the diagnosis and treatment level of critically ill infectious diseases, standardize the
clinical application of nanopore sequencing and promote the
Δ 基金项目 广东省科技创新战略专项(“大专项+任务清单”)项
sound development of the technology. METHODS Division of
目(No.STKJ202209072);广东省基础与应用基础研究基金自然科学基
Therapeutic Drug Monitoring of Chinese Pharmacological
金-面上项目(No.2024A1515010633);浙江省科技计划项目“尖兵”“领
雁”研发攻关计划(No.2023C03068);中国红十字基金会医学赋能公益 Society and Expert Committee of Precision Medicine for
专项(No.HSZH202200909);毕节市“揭榜挂帅”重大专项(No. 毕科合 Clinical Treatment of Guangdong Pharmaceutical Association
重大专项〔2023〕2-2号) initiated and organized multidisciplinary experts to discuss and
*第一作者 主任药师,博士生导师,博士。研究方向:药物基因组 determine the consensus writing outline by using the nominal
学、微生物药学。E-mail:shuyao0754@qq.com
group method, forming a preliminary consensus draft; expert
#a 通信作者 主任医师,博士生导师,博士。研究方向:微生物医
consultation was performed by using Delphi method, and then
学。E-mail:houtieying001@126.com
#b 通信作者 主任药师,博士。研究方向:药理学、微生物药学。 experts’ opinions were analyzed and revised to form
E-mail:lxyzzj@126.com consensus. RESULTS & CONCLUSIONS Consensuses of
中国药房 2024年第35卷第14期 China Pharmacy 2024 Vol. 35 No. 14 · 1673 ·