Page 48 - 《中国药房》2022年11期
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性,结果见表2(表中,1 kcal=4.184 kJ)。在PubChem数
                                                            据库下载山豆根活性成分的 3D 结构,在 PDB 蛋白数据
                                                            库(https://www.rcsb.org/)下载核心靶点的结构,并对活
                                                            性成分进行去除水分子以及加氢处理,借助Dockthor平
                                                            台(https://dockthor.lncc.br/v2/)进行在线分子对接,采用
                                                            Pymol 软件将结合能力较好的对接结果进行可视化处
                                                            理,结果见图3。
                                                            表2   山豆根抗鼻咽癌核心靶点与潜在活性成分的分子
                                                                 对接测试结果
                                                                           分子对接结合能/               分子对接结合能/
                                                            核心靶点 活性成分                核心靶点 活性成分
                                                                            (kcal/mol)              (kcal/mol)
                                                            EGFR  染料木素       -7.121  PIK3CA  高丽槐素    -7.360
                                                                  苦参酮        -8.131        山豆根色烯素    -7.998
                                                                  槲皮素        -6.901        越南槐醇      -8.271
                                                                  山豆根色烯素     -8.561        苦参酮       -7.069
                                                            MAPK1  高丽槐素      -8.284  AKT1  越南槐醇      -8.061
                                                                  山豆根素       -8.307        槲皮素       -7.473
                                                                  山豆根色烯素     -7.981  MAPK8  苦参酮      -7.839
            注:图中节点越大表示其在网络中越重要                                    越南槐醇       -8.005  MAPK3  越南槐醇     -7.562
                 图2 山豆根抗鼻咽癌的PPI网络图                                苦参酮        -7.069  SRC   槲皮素       -8.393
                                                            JAK3  高丽槐素       -7.567  PTK2  槲皮素       -7.467
            对山豆根抗鼻咽癌化学成分-靶点网络分析发现,                          MAP2K1 越南槐醇      -7.865
        整个网络的平均 Degree 值为 3.5,网络中大于平均 De-
                                                                一般认为配体与受体结合的构象稳定时,发生作用
        gree值的化学成分分别为越南槐醇、槲皮素、山豆根素、
                                                            的可能性越大;并且当结合能<-7.0 kcal/mol 时,两者
        苦参酮、染料木素、山豆根色烯素、高丽槐素。由此推
                                                            具有较好的结合活性,且结合能越低,对接效果越
        测,这几种成分可能是山豆根抗鼻咽癌的潜在活性
                                                              [14]
                                                            好 。由表 1 可知,山豆根核心靶点与其对应的潜在活
        成分。
                                                            性成分的结合能均低于-7.0 kcal/mol,表明这些成分均
            由图2可知,图中Degree值排名前10位的靶点分别
                                                            具有一定的抗鼻咽癌活性。
        是 SRC、PIK3CA、MAPK1、MAPK3、AKT1、MAPK8、
                                                            2.3  山豆根潜在活性成分对鼻咽癌细胞增殖活性的
        MAP2K1、PTK2、EGFR、JAK3。由此推测,这些靶点可
        能是山豆根抗鼻咽癌的核心靶点。                                     影响
        2.2  山豆根抗鼻咽癌核心靶点与潜在活性成分的分子                          2.3.1  细胞培养     将人鼻咽癌CNE-1细胞复苏,接种于
        对接测试                                                培养瓶中,使用含 10%胎牛血清、1%双抗的 RPMI1640
            采用半柔性对接方式,将“2.1”项下筛选的山豆根抗                       培养基在 37 ℃、5%CO2的细胞培养箱中培养,隔夜换
        鼻咽癌核心靶点与潜在活性成分进行分子对接测试,并                            液,并观察细胞的生长状况,当细胞处于对数生长期时,
        计算活性成分与核心靶点间的结合能,评估其结合活                             进行细胞增殖实验。











              A.山豆根素-MAPK1               B.槲皮素-SRC              C.山豆根色烯素-EGFR             D.越南槐醇-PIK3CA









                E.苦参酮-EGFR             F.高丽槐素-MAPK1             G.越南槐醇-MAPK1              H.越南槐醇-AKT1
                           图3    山豆根抗鼻咽癌潜在活性成分与关键靶蛋白的分子对接可视化图


        ·1322 ·  China Pharmacy 2022 Vol. 33 No. 11                                 中国药房    2022年第33卷第11期
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