Page 69 - 《中国药房》2021年10期
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基于网络药理学与分子对接探讨黄芪治疗溃疡性结肠炎的作用

        机制     Δ



                                             2,4
                                                      1 #
        郝民琦   1,2,3* ,王佳慧 ,李晓玲 ,李海龙 ,吴玉泓 (1.甘肃中医药大学基础医学院,兰州 730000;2.甘肃中
                          1,2
                                    1,2
        医药大学敦煌医学与转化教育部重点实验室,兰州 730000;3.甘肃中医药大学中医方药挖掘与创新转化重点
        实验室,兰州 730000;4.甘肃中医药大学第一临床医学院,兰州 730000)

        中图分类号 R285;R574.1         文献标志码      A      文章编号     1001-0408(2021)10-1215-09
        DOI  10.6039/j.issn.1001-0408.2021.10.10


        摘  要   目的:预测黄芪对溃疡性结肠炎(UC)的可能作用靶点与机制,为临床应用黄芪治疗UC的后续研究提供参考。方法:经
        中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和UniProt KB数据库检索黄芪的活性成分及其对应靶点基因,经Gene Cards数据库检
        索UC疾病相关靶点基因,借助Venny 2.1.0在线作图工具获取黄芪与UC的交集靶点基因,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建“药物-
        化合物-交集靶点”相互作用网络。利用 STRING 数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,并应用 Cyto-
        scape 3.7.0软件进行可视化分析和拓扑学分析以获取核心靶点基因。借助DAVID数据库对交集靶点基因进行基因本体(GO)功
        能注释及KEGG通路富集,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建“靶点-通路”富集网络。通过AutoDock vina 1.1.2软件将度值排名前5
        位的活性成分与核心靶点基因编码蛋白进行分子对接,应用Discovery Studio 3.5软件绘制结合模式图。结果:黄芪中共有化合物
        143个,共筛选出了活性成分20个,对应的靶点基因189个;UC疾病相关靶点基因共4 356个。黄芪(涉及14种活性成分)与UC的
        交集靶点基因有126个。PPI网络中的核心靶点基因为AKT1、MAPK1、RB1、JUN等。GO功能注释共得到GO条目2 294个(q值<
        0.05),包括生物过程条目2 093个(如对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应等)、细胞组成条目49个(如膜筏、膜微区等)、分子
        功能条目152个(如核受体活性、配体激活的转录等)。KEGG通路富集分析共得到条目160个(q值<0.05),如流体剪切应力和动
        脉粥样硬化信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、白细胞介素17(IL-17)信号通路等。分子对接结果显示,度值排
        名前 5 位的活性成分(槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、7-O-methylisomucronulatol)与核心靶点编码蛋白的结合能均小
        于-5.0 kcal/mol。结论:黄芪中的槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素异等活性成分可能通过作用于MAPK14、JUN、AKT1等靶点基因,
        进而对PI3K/Akt、IL-17等信号通路产生调控作用,最终发挥对UC的治疗作用。
        关键词 黄芪;活性成分;溃疡性结肠炎;网络药理学;分子对接;作用机制


        Study on the Mechanism of Astragali Radix in the Treatment of Ulcerative Colitis Based on Network
        Pharmacology and Molecular Docking
                                  1,2
                                                                         1
                                               1,2
                                                            2,4
        HAO Minqi 1,2,3 ,WANG Jiahui ,LI Xiaoling ,LI Hailong ,WU Yuhong(1. School of Basic Medicine,Gansu
        University of TCM,Lanzhou 730000,China;2. Key Laboratory of Dunhuang Medicine and Its Transformation
        of Ministry of Education,Gansu University of TCM,Lanzhou 730000,China;3. Key Laboratory of TCM
        Mining and Innovation Transformation,Gansu University of TCM,Lanzhou 730000,China;4. First Clinical
        Medicial School,Gansu University of Chinese Medicine,Lanzhou,730000,China)

        ABSTRACT    OBJECTIVE:To predict the potential target and mechanism of Astragali Radix in the treatment of ulcerative colitis
       (UC),and to provide reference for the clinical application of Astragali Radix in the treatment of UC. METHODS:The active
                                                           components and their corresponding target genes of Astragali
           Δ 基金项目:国家自然科学基金资助项目(No.81860810);国家中
                                                           Radix were retrieved by TCMSP and UniProt KB database.
        医药管理局第四批全国中医基础优秀人才研修项目(No.国中医药人
        教 发〔2017〕24 号);2018 年 甘 肃 省 中 医 药 管 理 局 科 研 项 目(No.  The related target genes of UC were searched by Gene Cards
        GZK-2018-5);敦煌医学与转化教育部重点实验室2018年度开放基金              database. The intersection target genes of Astragali Radix and
        项目(No.DHYX18-17);甘肃中医药大学科学研究与创新基金项目                UC were obtained by Venny 2.1.0 online mapping tool,and
       (No.2019KCZD-5)
                                                           interaction network of “drug-compound-intersection target”
           *硕士研究生。研究方向:脾胃病及病证结合动物模型。E-mail:
                                                           was constructed by using Cytoscape 3.7.0 software. PPI
        1277891052@qq.com
           # 通信作者:教授,硕士生导师,博士。研究方向:脾胃病及病证                  network of intersecting targets was obtained by using STRING
        结合动物模型。E-mail:172924249@qq.com                     database, and the visualization analysis and topological


        中国药房    2021年第32卷第10期                                            China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 10  ·1215 ·
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