Page 72 - 《中国药房》2021年10期

个。两者取交集后共得到交集靶点基因126个。黄芪与 的筛选流程见图4，核心靶点基因的拓扑参数详见表2。
UC交集靶点基因的韦恩图见图1。
药物

63 126 4 230

疾病
图1 黄芪与UC交集靶点基因的韦恩图
Fig 1 Venn map of the intersection target genes of As-
tragali Radix and UC
“药物-化合物-交集靶点”相互作用网络见图 2（图
中，中央圆形节点代表黄芪，外周圆形节点代表黄芪活
性成分，节点上的编号为化合物对应的TCMSP编号，绿
色矩形代表“药物-疾病”交集靶点，活性成分节点的大
小代表与其所连接的靶点数目成正比）。由图2可见，该
网络中共包括节点141个、边274条。该网络中，每个化
合物平均与 18.571 个靶点相互作用，每个靶点平均与
图3 黄芪与UC交集靶点基因的PPI网络
2.063个化合物相互作用。通过比较“药物-化合物-交集
Fig 3 PPI network of interaction target genes of As-
靶点”网络中各成分的度值，筛选出排名前 5 位的活性 tragali Radix and UC
成分分别是槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、
2.4 GO功能注释和KEGG 通路富集分析的结果
7-O-methylisomucronulatol，分别能与 108、35、20、20、18
通过 GO 功能注释分析共得到条目 2 294 个（q 值＜
个靶点蛋白发生作用；排名前5位的靶点蛋白分别是前
0.05），包括生物过程2 093个、细胞组成49个、分子功能
列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）、PTGS1、热休克蛋白 152个。分析发现，其生物过程涉及对脂多糖的反应、对
90α家族A类成员1（HSP90AA1）、蛋白质丝氨酸蛋白酶 细菌来源分子的反应、细胞对化学应激的反应等；细胞
1（PRSS1）、类视黄醇 X 受体α（RXR-α），分别能与 13、 组成涉及膜筏、膜微区、膜区域、转录调节复合物等；分
11、10、10、8个成分发生作用。 子功能主要集中于核受体活性、配体激活的转录因子活

性、DNA结合转录因子结合等，详见表3、表4、表5。
KEGG通路富集共获得条目160个（q值＜0.05），排
名靠前的通路包括糖尿病并发症中晚期糖基化终产物
及其受体（AGE-RAGE）信号通路、流体剪切应力和动脉
粥样硬化信号通路、前列腺癌信号通路、乙型肝炎、白细
胞介素 17（IL-17）信号通路等。KEGG 富集分析结果
（前20条）见表6，其富集网络（前20条）见图5。
2.5 黄芪主要活性成分与核心靶点蛋白的分子对接
图 2 黄芪治疗 UC 的“药物-化合物-交集靶点”互作
结果
网络
“药物-化合物-交集靶点”互作网络中度值排名前5
Fig 2 “Drug-compound-interaction target”network
位的主要活性成分与 PPI 核心靶点基因 JUN、MAPK1、
of Astragali Radix in the treatment of UC
ATK1、IL2、MAPK14、RB1（RELA 和 MYC 基因在数据库
2.3 PPI网络构建及核心靶点基因的筛选结果 中未找到对应蛋白晶体结构）编码蛋白分子对接的结合
拓扑学分析结果显示，PPI 网络中共包含节点 112 能分数色 阶图见图 6。由图 6 可知，各组合对接分数均
个、边 447 条。经 Cytoscape 3.7.0 软件中“CytoNCA”插 小于－5.0 kcal/mol，表明结合活性良好。以上结果说
件两次筛选后最终得到 8 个核心靶点基因，即 RELA、 明，黄芪的主要活性成分对 UC 的核心靶点具有很强的
MYC、IL2、MAPK14、JUN、MAPK1、AKT1、RB1。黄芪与 关联性，而上述活性成分与核心靶点可能是黄芪治疗
UC 交集靶点基因的 PPI 网络如图 3，PPI 核心靶点基因 UC的主要作用靶点。

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