Page 47 - 《中国药房》2021年第9期
P. 47

表1 良附丸活性成分信息
              Tab 1 Active ingredients of Liangfu pills
         化合物                       来源        OB，％   DL
         美迪紫檀素（Medicarpin）         高良姜        49.22  0.34
         8-异戊烯基山柰酚（8-isopentenyl-kaempferol）  香附  38.04  0.39
         延胡索乙素（Hyndarin）           香附         73.94  0.64
         豆甾醇（Stigmasterol）         香附         43.83  0.76
         木犀草素（Luteolin）            香附         36.16  0.25
         异鼠李素（Isorhamnetin）        高良姜、香附     49.60  0.31
         β-谷甾醇（β-sitosterol）       高良姜、香附     36.91  0.75
         山柰酚（Kaempferol）           高良姜、香附     41.88  0.24
         槲皮素（Quercetin）            高良姜、香附     46.43  0.28
        www.omim.org/）、DisGeNET 数据库（http：//www.disgen-
        et.org/web/DisGeNET/menu/home）中检索收集胃溃疡相
        关的靶点基因，去重后即得到胃溃疡的相关靶点 3 724
        个。将“2.1”项下收集的 206 个良附丸活性成分的潜在
        作用靶点和胃溃疡的相关靶点共同映射，通过Venny 2.1
        软件，寻找出两者共同的靶点，并绘制韦恩图。结果，共
        获得166个共同靶点，详见图1。
                                                                   图2 良附丸治疗胃溃疡的PPI网络图
                                                           Fig 2  PPI network plot of Liangfu pills in the treat-
                       胃溃疡相         良附丸活
                        关靶点         性成分相
                               166  关靶点                           ment of gastric ulcer
                             （4.4％）
                        3 558        40
                       （94.5％）      （1.1％）                 前 15 位的 KEGG 通路。采用 Cytoscape 3.7.2 软件中的
                                                           Merge功能，构建良附丸活性成分-胃溃疡靶点-KEGG通
         图1 良附丸活性成分与胃溃疡的共同靶点的韦恩图                           路网络图，并筛选 Degree 值排名前 5 位的靶点。结果，
        Fig 1  Venn diagram of common targets of active in-  良附丸治疗胃溃疡的 GO 功能主要包括 Cellular re-
              gredients of Liangfu pills and gastric ulcer  sponse to chemical stimulus（细胞对化学刺激的反应）、
                                                           Response to chemical（对化学反应）、Positive regulation
        2.3  良附丸治疗胃溃疡的蛋白互作（PPI）网络的构建
                                                           of biological process（积极调控生物过程）等生物过程，
            将“2.2”项下的共同靶点上传至 STRING 数据库
       （https：//string-db.org/）中，构建 PPI 网络，设置置信度大          Identical protein binding（蛋白质结合）、Protein dimeriza-
        于 0.7，其他参数设置不变，去掉网络中的单一节点，获                        tion activity（蛋白质二聚活性）、Steroid hormone receptor
        得 PPI 结果。将 PPI 结果导入 Cytoscape 3.7.2 软件进行           activity（类固醇激素受体活性）等分子功能，以及 Extra-
        拓扑分析，选取 Degree 大于中位数 2 倍（即 19）以上，且                 cellular space（细胞外空间）、Cytosol（细胞质溶胶）、
        Betweenness大于中位数（即0.013）的靶点作为良附丸治                  Membrane Microdomain（膜微区）等细胞成分，详见图
        疗胃溃疡的核心靶点。结果，构建的 PPI 网络共有 164                      3。共筛选出癌症、乙型肝炎、膀胱癌、胰腺癌、TNF信号
        个节点、3 250 条边，详见图 2。经拓扑分析共得到 15 个                   通路、前列腺癌等KEGG通路，详见表2。构建的良附丸
        核心靶点，分别为 TP53、c-Jun、Akt1、MAPK1（丝裂原活                活性成分-胃溃疡靶点-KEGG 通路共有节点 185 个、边
        化蛋白激酶1）、TNF-α、HSP90AA1（热休克蛋白90α编码                  453 条，详见图 4。Degree 值排名前 5 位的靶点分别为
        基因）、NF-κB（核因子κB p65）、CXCL8（趋化因子配体                  TP53、c-Jun、Akt1、MAPK1、TNF-α。
        8）、IL-6、MAPK14、MAPK8、RB1（视网膜母细胞瘤基因                 2.5 动物实验
        1）、ESR1（雌激素受体α）、VEGFA（血管内皮生长因子）                        基于上述筛选的良附丸治疗胃溃疡排名前5位的靶
        和CCND1（细胞周期素1）。                                    点蛋白（TP53、c-Jun、Akt1、MAPK1、TNF）进行动物实
        2.4 GO功能与KEGG通路富集分析                                验，以探讨良附丸对胃溃疡的治疗作用并验证相关靶
            将“2.2”项 下 的 共 同 靶 点 输 入 DAVIAD 数 据 库           点。MAPK 可分为细胞外调节蛋白激酶（ERK）、p38、
       （https：//david.ncifcrf.gov/）进行基因本体（GO）功能和京          JNK和ERK5这4个亚族，其中，ERK广泛存在于各种组
        都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，以                          织，参与调控细胞的增殖、分化；JNK家族是细胞对各种
        P＜0.05筛选排名前10位的显著富集的GO功能和排名                        应激原诱导的信号转导的关键分子，参与细胞对辐射、


        中国药房    2021年第32卷第9期                                              China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 9  ·1065 ·
   42   43   44   45   46   47   48   49   50   51   52