Page 134 - 《中国药房》2021年07期
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则可介导 PER 和 CRY 的磷酸化,并增强其对 CLOCK- 分子化合物具有十分重要的意义。目前,还没有发现作
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BMAL1 异二聚体的抑制作用 ;泛素化影响钟蛋白的 用于 PERs、BMAL1 等钟蛋白的小分子化合物,且已知
稳定性,如 F-box 蛋白介导 PER 和 CRY 单体发生泛素 的生物钟调节物也大多缺乏对蛋白亚型的选择性,因此
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化,而后被蛋白酶体降解 。翻译后修饰过程可显著影 更具针对性的靶向筛选法将在进一步的研究中起到重
响生物钟自主调控过程中的关键蛋白的活性和功能,对 要作用。靶向筛选法的局限性主要表现在其研究范围
于生理或病理情况下生物钟的调节与重置具有重要意 仅限于直接作用于已知蛋白质结构的小分子化合物,而
义,异常的翻译后修饰将导致生物钟节律的紊乱,例如 无法筛选其他作用方式的化合物,例如影响钟蛋白的亚
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在家族性晚期睡眠综合征中,PER蛋白磷酸化的缺失会 细胞定位的小分子物质 。
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导致节律周期前移4 h 。 3 生物钟相关蛋白调控小分子化合物对钟基因的
2 调控生物钟的小分子化合物的筛选和鉴定方法 调控及应用
生物化学和高通量筛选技术的发展使得从成千上 生物钟与睡眠、代谢、情绪反应等多种生理活动息
万的小分子物质中筛选出影响生物钟节律的小分子化 息相关,研究人员也一直致力于探索生物钟调控药物对
合物成为可能。目前,表型筛选法和靶向筛选法是筛选 这些生理功能障碍引起的疾病的作用。数量众多的符
与鉴定调控生物钟的小分子化合物的主要方法。 合Lipinski规则的小分子化合物是具有潜力的生物钟调
2.1 基于细胞表型的高通量筛选法 控药物,这些小分子化合物可结合生物钟相关蛋白并改
基于细胞表型的高通量筛选方法以无偏差方式筛 变其生物活性,从而影响钟基因的表达以起到调控生物
选影响生物钟节律的小分子化合物,该方法依赖高通量 钟的作用 [3,16] 。最初,研究人员使用基于表型的高通量
筛选技术和信息技术从众多特征良好的化合物中挑选 筛选法鉴定出多种影响钟蛋白翻译后修饰过程的小分
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出能显著改变细胞节律表型的小分子化合物 。 子化合物,发现蛋白激酶(如 CK1、CK2、GSK-3)为其主
该方法对小分子化合物的作用靶点和作用机制没 要的作用靶点;最近,研究人员尝试使用小分子化合物
有限制,能更全面地筛选出影响生物钟的小分子化合 直接靶向调控钟基因的核心蛋白,包括 CRY、核受体
物;并且在确定候选化合物的作用靶点时,有可能发现 (REV-ERB、ROR)和 CLOCK。下文将分别描述靶向多
新的节律相关蛋白和作用机制。表型筛选法还能直接 种生物钟相关蛋白的小分子化合物对钟基因和生物钟
筛选出强烈影响生物钟动态的小分子化合物,并能对化 的影响,及其在相关疾病中的应用。
合物的功能表现进行明确的鉴定与选择。但广泛而全 3.1 靶向蛋白激酶
面的筛选也造成了该方法的局限性,由于筛选容量庞 蛋白激酶参与的翻译后修饰在生物钟的调控中具
大,对实验处理的精确性、一致性要求高,因此较难获得 有重要作用,蛋白激酶的突变可能参与了多种由于生物
高质量和高准确度的数据。 钟紊乱所致的疾病的发生、发展,因此蛋白激酶是小分
2.2 靶向筛选法 子药物研发中备受关注的调控靶点。靶向蛋白激酶的
X 射线晶体学的发展对蛋白晶体结构的解析起到 生物钟调控小分子化合物见表1。
了巨大的推动作用,而对钟蛋白结构的认识又使得筛选 蛋白激酶CK1在钟基因的调控中发挥着重要作用,
靶向特定蛋白的小分子化合物成为可能 。 PER蛋白是其主要作用靶点 。小分子化合物Longday-
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该方法可有针对性地寻找作用于目的蛋白的小分 sin 是最先被鉴定出的 CK1 抑制剂,具有延长周期的作
子化合物,避免了无偏差筛选的盲目性和偶然性,保证 用 。虚拟分子对接研究显示,Longdaysin 的嘌呤环和
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了筛选出的活性小分子能直接作用于调节生物钟的核 亚胺基与 CK1 亮氨酸残基间形成氢键,介导两者结合;
心蛋白,而不是通过其他途径间接影响生物钟的节律。 抑制 CK1 活性将导致 PER 磷酸化减弱,并使 PER-CRY
这些优点使靶向筛选法对于筛选鉴定调节生物钟的小 复合物对 CLOCK-BMAL1 异二聚体的抑制作用减弱,
表1 靶向蛋白激酶生物钟的调控小分子化合物(部分)
项目 Longdaysin NCC007 IC261 PF-4800567 PF-670462 DMAT CX-4945 GO289 CHIR99021
作用靶点 CK1 CK1 CK1 CK1 CK1 CK2 CK2 CK2 GSK-3
结构式
作用 CK1α/δ抑制剂 CK1α/δ抑制剂 CK1抑制剂 CK1ε 抑制剂 CK1δ抑制剂 CK2抑制剂 CK2抑制剂 CK2抑制剂 GSK-3α/β抑制剂
表型影响 延长周期 延长周期 延长周期 延长周期 延长周期 延长周期 延长周期 延长周期 缩短周期
应用领域 睡眠障碍 睡眠障碍 睡眠障碍 - - - - 癌症 代谢障碍
注:“-”表示无相关内容
·892 · China Pharmacy 2021 Vol. 32 No. 7 中国药房 2021年第32卷第7期