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理学、计算机科学等多学科的技术和知识,可多方位地 过NIST 11.L质谱数据库检索、匹配后,经人工解析并确
阐释药物治疗疾病的潜在靶点及作用机制,体现了药物 定各化学成分的结构。
作用的整体性和系统性,与中药作用特点相一致 [27-30] 。 2.3 网络药理学分析
为此,本研究通过气质联用技术(GC-MS)对青皮挥发油 2.3.1 青皮挥发油活性成分的筛选 将“2.2.3”项下已
中的活性成分进行定性分析,并借助网络药理学的研究 鉴定出的青皮挥发油成分输入至中药系统药理学分析
思路对所鉴定出的化学成分进行信息挖掘,筛选出青皮 平台(TCMSP,http://lsp.nwu.du.cn/tcmsp.php),以口服
挥发油防治 AD 的关键活性成分、关键作用靶点以及潜 利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18作为筛选条件 [31]
在信号通路,旨在为青皮挥发油用于防治 AD 的深入研 对青皮挥发油活性成分进行筛选。
究提供参考。 2.3.2 青皮挥发油对应靶点的收集 将“2.3.1”项所得
1 材料 青皮挥发油活性成分录入TCMSP和PharmMapper数据
1.1 仪器 库(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/),限定物种
7890A/5975C型GC-MS仪,配电子轰击(EI)离子源 为“人类(Homo sapiens)”。将检索所得各靶点以反向对
以 及 5975C-GC/MSD 数 据 处 理 系 统(美 国 Agilent 公 接结合值(即 Fit 值)降序排列,选择前 20 位作为每个成
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司);TC-15 型恒温电热套(海宁市新华医疗器械厂); 分对应的主要靶点 。将上述主要靶点录入 UniProt 数
Milli-Q型超纯水系统(美国Millipore公司)。 据库(http://www.uniprot.org),限定物种为“人类(Homo
1.2 药材与试剂 sapiens)”,检索相应的UniProt ID,并获取对应的基因简
青皮幼果采自江西省吉安市新干县山湖镇青皮种 称(Gene symbol),去重后即得青皮挥发油活性成分的对
植基地,经广东省中医药科学院黄志海教授鉴定为芸香 应靶点。
科植物橘(C. reticulata Blanco)的幼果。将其果皮上纵 2.3.3 AD 相关靶点的收集 以“Alzheimer’s disease”
剖成四瓣至基部,除尽瓜瓣,将所得果皮部分自然晒干 为关键词,在 GeneCards 数据库(https://www.genecards.
后,即得四花青皮药材。无水硫酸钠、甲苯、石油醚 org/)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM,https://omim.
(60~90 ℃)等试剂均为分析纯,水为超纯水。 org/)中检索 AD 相关靶点。其中,GeneCards 数据库中
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2 方法 以相关分数(Relevance score)>10 为标准 进行筛选。
2.1 挥发油提取 将两个数据库的检索结果去重后,即得AD相关靶点。
参照 2015 年版《中国药典》(四部)通则中“2204 挥 2.3.4 青皮挥发油防治AD直接靶点的收集 利用Ven-
发油测定法”项下“甲法”操作:称取四花青皮药材50 g, ny 2.1.0 软件映射“2.3.2”“2.3.3”项下所得青皮挥发油活
加10倍量(mL/g)水,浸泡2 h,回流提取9 h,得黄色透明 性成分对应靶点和 AD 相关靶点,即得青皮挥发油防治
液体,经无水硫酸钠干燥后,即得青皮挥发油。平行操 AD的直接靶点。
作3次。每克药材可得挥发油(1.367±0.058)mL。 2.3.5 青皮挥发油防治AD作用靶点的确定 为明确青
2.2 GC-MS分析 皮挥发油成分靶点与疾病 AD 靶点之间的相互作用关
2.2.1 GC 条件 色谱柱:HP-5MS 5 Phenyl-Methyl Si- 系,将“2.3.2”“2.3.3”项下所得青皮挥发油活性成分对应
loxane石英毛细管柱(30 m×250 μm,0.25 μm);升温程序 靶 点 和 AD 相 关 靶 点 导 入 STRING 数 据 库(https://
(初始温度 50.00 ℃,以 0.40 ℃/min 升至 55.92 ℃,以 string-db.org/),限定物种为“人类(Homo sapiens)”,设置
0.20 ℃/min 升 至 58.00 ℃ ,再 以 15.00 ℃/min 升 至 较高置信度(High confidence)≥0.700 ,除去未相互连
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88.00 ℃并保持 2.00 min;以 1.30 ℃/min 升至 131.70 ℃, 接的节点(Node)后,得“靶点互作”网络并保存为“tsv”
以 0.80 ℃/min 升 至 137.00 ℃ ,再 以 1.50 ℃/min 升 至 格式文件;将上述文件导入Cytoscape 7.2.1软件,运用软
148.00 ℃ 并 保 持 2.00 min;以 15.00 ℃/min 升 至 件中的“CentiScaPe 2.2”插件计算节点度值(Degree),选
248.00 ℃,以20.00 ℃/min升至280.00 ℃。总运行时间: 取度值大于平均度值 2 倍的靶点作为核心节点(Hub
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87.04 min);进样口温度:250 ℃;气化室温度:250 ℃;载 node) 。利用 Venny 2.1.0 软件将该核心靶点与“2.3.2”
气(氦气)流速:1.0 mL/min;进样量:1.0 μL;进样方式: “2.3.3”项下所得青皮挥发油活性成分对应靶点和AD相
分流进样,分流比:10∶1。 关靶点进行映射,选择与活性成分对应靶点的交集靶
2.2.2 MS 条件 离子源:EI 离子源;离子源温度: 点,在排除与“2.3.4”项下直接靶点重复的靶点之后,即
230 ℃;四极杆温度:150 ℃;电子轰击能量:70 eV;溶剂 得青皮挥发油防治AD的间接靶点。将直接靶点与间接
延迟:3 min;扫描范围:m/z 50~500。 靶点合并,即得青皮挥发油防治AD作用靶点。
2.2.3 青皮挥发油成分分析 取“2.1”项下青皮挥发油, 2.3.6 基因本体(GO)功能和KEGG通路富集分析 将
用适量石油醚溶解后,按“2.2.1”“2.2.2”项下 GC-MS 条 “2.3.5”项下所得青皮挥发油防治 AD 作用靶点录入
件进样分析,记录色谱图和质谱数据。所得质谱数据通 DAVID 6.7 数据库(https://david-d.ncifcrf.gov/summary.
中国药房 2020年第31卷第17期 China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 17 ·2095 ·