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toscape 3.5.1软件,采用Merge工具构建出金荞麦优效组 续表1
分-靶点蛋白-信号通路网络图;采用Network Analysis工 Continued tab 1
具对网络图进行拓扑性质分析,筛选出连接度(Degree) 编号 化合物 中文名 分子式 结构式
10 (+)Epicatechin (+)表儿茶素
排名前10位的靶点蛋白和信号通路进行分析。 C15H14O6
2 结果
2.1 金荞麦中优效组分的筛选结果
根据 DL>0.18、OB>30%的标准,在 TCMSP 数据 11 (+)Catechin gallate (+)儿茶素没食子酸酯 C22H18O10
库中共筛选出15种金荞麦优效组分,如槲皮素、木犀草
素、原矢车菊素B1、儿茶素、β-谷甾醇等。金荞麦中15种
优效组分的基本信息见表1。
表1 金荞麦中15种优效组分的基本信息 12 β-sitosterol β-谷甾醇 C29H50O
Tab 1 General information of 15 superior compo-
nents in F. dibotrys
编号 化合物 中文名 分子式 结构式
1 Quercetin 槲皮素 C15H10O7 13 Sitosterol 谷甾醇 C29H50O
2 Eriodyctiol(flavanone) (2R)-2-(3,4-二羟基苯 C15H12O6
基)-5,7-二羟基-2,3-二 14 Digallic acid 没食子酸 C14H10O9
氢-4-酮
3 Isorhamnetin 异鼠李素 C16H12O7
15 N-trans-coumaroyl tyramine N-反式香豆酰胺 C17H17NO3
4 Luteolin 木犀草素 C15H10O6
2.2 金荞麦中优效组分的潜在作用靶点预测结果
将 15 种优效组分导入 PharmMapper 数据库后各取
5 3-methylquercetin 3-甲基槲皮素 C16H12O7 前20位潜在靶蛋白的信息,共得300个靶点蛋白。经手
动处理整理、去除重复的靶点蛋白信息后,共得到114个
潜 在 的 靶 蛋 白 ,如 雌 二 醇 17-β- 脱 氢 酶 1、环 腺 苷 酸
(cAMP)特异性 3,5-环磷酸二酯酶 4D、维生素 D3受体、
6 3,8-dihydroxy-10- 3,8- 二 羟 基 -10- 甲 C17H12O6 尿苷胞苷激酶 2、HRAS 基因编码的三磷酸尿苷(GTP)
methoxy-5H-isochromeno 基-5H-异色烯-[4,3-b]色 酶、性激素结合球蛋白、血管内皮生长因子受体 2、细胞
[4,3-b]chromen-7-one 烯-7-酮
分裂蛋白激酶2靶点等。金荞麦中优效组分的潜在作用
靶点(部分)见表2。
7 Procyanidin B1 原矢车菊素B1 C30H26O12
2.3 KEGG通路分析结果
运用DAVID数据库分析得到金荞麦中15种优效组
分的 114 个潜在靶蛋白所涉及的 KEGG 通路,进而获得
8 (+)Catechin (+)儿茶素 C15H14O6 重要通路 34 条(P<0.05)。其中,与癌症相关的通路有
11 条(如前列腺癌通路、黑素瘤通路、非小细胞肺癌通
路),与代谢相关的通路有7条(如药物代谢通路、谷胱甘
肽代谢调节通路),与内分泌系统相关的通路有4条,与
9 (-)Catechin (-)儿茶素 C15H14O6 免疫系统相关的通路有4条,与信号转导相关的通路有
3 条,与细胞进程相关的通路有 2 条,与神经系统、排泄
系统和细菌传染病相关的通路各有1条。金荞麦中优效
组分的重要KEGG通路见表3。
·560 · China Pharmacy 2020 Vol. 31 No. 5 中国药房 2020年第31卷第5期