Page 54 - 2019年10月第30卷第19期

键靶点通过 Systems Dock WebSite 在线平台（网址为 2.2 昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分-靶点网络的
http：//systemsdock.unit.oist.jp/iddp/home/index）进行分子 构建结果
对接评估其结合活性，使用Docking Score评价中药与靶 2.2.1 昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分和靶点的获
点之间的结合活性，当Docking Score值＞4.25表示分子 取 通过TCMSP和TCMID数据库，昆明山海棠共纳入
与靶标具有一定的结合能力，＞5.00 表示结合能力较 10 个成分；鸡血藤共纳入 20 个活性成分。将成分通过
强，＞7.00表示结合能力很强 。 DrugBank 数据库预测靶点，并通过 Uniprot 数据库校正
[12]
1.4 昆明山海棠-鸡血藤药对与RA共有靶点筛选 并删除重复项后，昆明山海棠纳入93个靶点，鸡血藤纳
将昆明山海棠-鸡血藤药对与RA靶点导入Genom- 入 136 个靶点。昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分见
ics 平台（网址为 http：//bioinformatics.psb.ugent.be/webt- 表2。
ools/Venn/）进行映射构建韦恩图，取三者交集得到昆明 表2 昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分
山海棠-鸡血藤药对和RA的共有靶点。 Tab 2 Active components of couplet medicine of T. hy-
1.5 共有靶点通路富集分析及昆明山海棠-鸡血藤药对 poglaucum-S. suberectus
的活性成分-靶点-KEGG通路网络构建 编码 活性成分ID 活性成分名称 OB，％ DL HL，h
将共有靶点导入 Cytoscape 3.2.1 软件中的 Clugo 插 TH01 MOL003272 维粗榧碱 29.27 0.65
TH02 MOL000492 （+）-儿茶素 54.83 0.24 0.61
件进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集
TH03 MOL011038 （+）-儿茶素-5-O-葡萄糖苷 2.90 0.79
（P＜0.05），结合相关文献筛选与 RA 相关的通路，并将 TH04 MOL003225 山海棠二萜内酯A 76.13 0.49 0.06
与RA相关的通路、活性成分和靶点导入Cytoscape 3.2.1 TH05 MOL006791 没食子儿茶素 24.18 0.27
TH06 MOL003224 雷公藤内酯二醇酮 56.40 0.67 4.91
软件构建昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分-靶点- TH07 MOL003245 雷酚二萜酸 42.56 0.39 1.88
KEGG通路网络进行可视化处理，从而更直观地反映昆 TH08 MOL003280 雷公藤内酯二醇 49.51 0.49 17.90
TH09 MOL003187 雷公藤甲素 51.29 0.68 4.14
明山海棠-鸡血藤的活性成分、靶点与通路之间的关系。
TH10 MOL003186 雷公藤红素 17.84 0.78
2 结果 SSD01 MOL000296 常春藤皂苷元 36.91 0.75 5.35
2.1 RA靶点获取与PPI网络构建结果 SSD02 MOL000033 （3S，8S，9S，10R，13R，14S，17R）-10，13-dimethyl-17-[（2R， 36.23 0.78 5.22
5S）-5-propan-2-yloctan-2-yl]-2，3，4，7，8，9，11，12，14，15，
本研究共筛选到 1 956 个 RA 靶点。通过 STRING 16，17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-ol
平台构建 PPI 网络，并使用 Cytoscape 3.2.1 软件进行分 SSD03 MOL000358 β-谷甾醇 36.91 0.75 5.36
析。PPI 网络包含 1 807 个节点，61 986 条边，平均度值 SSD04 MOL000392 芒柄花黄素 69.67 0.21 17.04
SSD05 MOL000417 毛蕊异黄酮 47.75 0.24 17.10
68.61，平均介度中心性 0.52（本网络介度中心性数值较 SSD06 MOL000449 豆甾醇 43.83 0.76 5.57
小，结果是取 lg 对数后的值，下同）。选取度值、介度中 SSD07 MOL000461 3，7-二羟基-6-甲氧基二氢黄酮 43.80 0.26 15.14
SSD08 MOL000468 8-甲雷杜辛 70.32 0.27 15.83
心性同时满足排名前15的节点作为其关键靶点，包括白
SSD09 MOL000469 3-羟基-豆甾-5-烯-7-酮 40.93 0.78 4.89
细胞介素 6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、苏氨酸激酶 1 SSD10 MOL000470 8-C-α-L-arabinosylluteolin 35.54 0.66 15.61
（AKT1）、胰岛素（INS）、甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAP- SSD11 MOL000471 芦荟大黄素 83.38 0.24 31.49
SSD12 MOL000483 （Z）-3-（4-羟基-3-甲氧基-苯基）-N-[2-（4-羟基苯基）乙基]丙 118.35 0.26 4.26
DH）、细胞肿瘤抗原 p53（TP53）、血清白蛋白（ALB）、血 烯酰胺
管内皮生长因子A（VEGFA）、信号转导和转录激活因子 SSD13 MOL000493 菜油甾醇 37.58 0.71 4.71
SSD14 MOL000497 甘草查耳酮A 40.79 0.29 16.20
3（STAT3）、表皮生长因子受体（EGFR）、丝裂原活化蛋
SSD15 MOL000501 Consume close grain 68.12 0.27 16.23
白激酶3（MAPK3）。RA的关键靶点见表1。 SSD16 MOL000502 Cajinin 68.80 0.27 14.23
表1 RA的关键靶点 SSD17 MOL000503 苜蓿内酯 57.49 0.60 11.10
SSD18 MOL000506 Lupinidine 61.89 0.21 7.46
Tab 1 Key targets of RA
SSD19 MOL000507 Psi-Baptigenin 70.12 0.31 21.95
靶点 度值 介度中心性 SSD20 MOL000006 木犀草素 36.16 0.25 15.94
IL-6 696 0.69 2.2.2 昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分-靶点网络
TNF 669 0.66
AKT1 622 0.66 的构建 将昆明山海棠-鸡血藤药对的活性成分和靶点
INS 573 0.70 导入 Cytoscape 3.2.1 软件构建昆明山海棠-鸡血藤药对
GAPDH 562 0.63 活性成分-靶点网络，详见图1。结果，昆明山海棠-鸡血
TP53 546 0.68
ALB 537 0.63 藤药对活性成分-靶点网络中共202个节点，503条边，平
VEGFA 530 0.59 均度值为4.91，平均介度中心性为0.01。其中，节点代表
STAT3 479 0.53
EGFR 474 0.58 成分和靶点，边代表节点之间的作用关系；度值越大，相
MAPK3 450 0.53 应节点越大。选取度值、介度中心性同时满足排名前10

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