Page 61 - 《中国药房》2023年6期
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2.5 大鼠肠道菌群测序                                       3.2 火麻仁油对 UC 模型大鼠血清中 TNF-α、IL-6、IL-
              末次给药后,对照组、模型组、火麻仁油组大鼠分别                        10含量的影响
          随机收集粪便5份,置于无菌离心管中,迅速冻存于液氮                              与对照组比较,模型组大鼠血清中 TNF-α、IL-6 含
          中,再转存于-80 ℃冰箱中,备用。采用基因组DNA提                        量均显著增加,IL-10含量显著降低(P<0.05);与模型组
          取试剂盒提取粪便样本中的微生物基因组DNA,严格按                          比较,火麻仁油组和柳氮磺胺吡啶组大鼠血清中 TNF-
          照试剂盒说明书操作。以上述DNA为模板,对细菌16S                         α、IL-6 含量均显著降低,IL-10 含量均显著增加(P<
          rRNA 基因双高变 V3~V4 区[特异性引物为 338F(5′-                 0.05)。结果见表3。
          ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3′)和806R(5′-GGACT-             表3 火麻仁油对UC模型大鼠血清中TNF-α、IL-6、IL-
          ACHVGGGTWTCTAAT-3′)]进行 PCR 扩增。所得 PCR                    10含量的影响(x±s,n=10,pg/mL)
          扩增产物经纯化、定量和均一化处理后进行高通量测                             组别           TNF-α         IL-6         IL-10
                                                              对照组         96.75±10.56  34.16±9.97   168.42±23.05
          序。首先,使用 QIIME 软件对测序序列进行聚类分析,                        模型组         132.04±11.46 a  68.34±8.17 a  67.22±16.48 a
          获得操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs);         火麻仁油组       102.30±12.07 b  51.05±11.52 b  75.59±16.80 b
          对所获OTUs进行分类学注释并生成不同分类水平下的                           柳氮磺胺吡啶组     99.67±12.53 b  42.23±10.57 b  105.97±18.29 b
          物种丰度。其次,利用Mothur软件计算样品的Alpha多                         a:与对照组比较,P<0.05;b:与模型组比较,P<0.05
          样性指数(ACE 指数、Chao1 指数、Shannon 指数、Simp‐              3.3 火麻仁油对 UC 模型大鼠结肠组织病理变化的
          son指数)分析单个样品内部的物种多样性;绘制稀释性                         影响
                                                                 对照组大鼠结肠组织上皮层完整,杯状细胞丰富,
          曲线和Shannon指数曲线,分析样品测序结果质量;基于
                                                             肠腺排列整齐且结构清晰。模型组大鼠结肠组织上皮
          weighted UniFrac算法中的主坐标分析(principal coordi‐
                                                             层发生脱落,边缘散乱,隐窝不清晰,黏膜层有水肿,炎
          nates analysis,PCoA)比较不同样品在物种多样性方面
                                                             症细胞浸润且入侵黏膜下层,肠腺紊乱。火麻仁油组和
          的相似程度,即 Beta 多样性。最后,通过线性判别分析
                                                             柳氮磺胺吡啶组大鼠结肠组织上皮层较完整,可见少量
          效应大小[linear discriminant analysis(LDA) effect size,
                                                             炎症细胞浸润,杯状细胞增加,肠腺排列较整齐。结果
          LEfSe]分析并寻找差异菌群[以LDA score(log10)>2为
                                                             见图1。
          标准 。
              [5]
          2.6 统计学方法
              采用SPSS 20.0软件对数据进行统计分析。多组间
          比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用 Tukey 检
          验。检验水准α=0.05。
          3 结果
          3.1 火麻仁油对 UC 模型大鼠体质量、DAI 评分、结肠                              A.对照组                    B.模型组
          长度、结肠质量及结肠单位长度质量的影响
              与对照组比较,模型组大鼠的体质量显著下降,DAI
          评分显著升高,结肠长度显著缩短,结肠质量和结肠单
          位长度质量均显著增加(P<0.05);且该组大鼠隐血测
          试为阳性,部分大鼠可见便血。与模型组比较,火麻仁
          油组和柳氮磺胺吡啶组大鼠的上述指标均显著逆转
                                                                    C.火麻仁油组                 D.柳氮磺胺吡啶组
         (P<0.05),大鼠隐血测试虽为阳性,但没有出现便血的
                                                             图1 火麻仁油对UC模型大鼠结肠组织病理变化的影响
          情况。结果见表2。
                                                             3.4 火麻仁油对UC模型大鼠肠道菌群的影响
         表2 火麻仁油对 UC 模型大鼠体质量、DAI 评分、结
               肠长度、结肠质量及结肠单位长度质量的影响                          3.4.1 样品测序结果质量分析 本实验 15 个样品测序
                                                             共获得 1 199 355 对 reads,经过双端 reads 拼接、质控过
              (x±s,n=10)
                                                             滤和去除嵌合体后,共产生 1 126 576 条有效序列,平均
                                                结肠单位长度质量/
          组别       体质量/g   DAI评分  结肠长度/cm  结肠质量/g
                                                  (g/cm)     每个样品产生 75 105 条有效序列。在 97% 的相似度水
          对照组     257.48±9.16  0.12±0.01  23.21±0.78  1.45±0.09  0.062 5±0.006 2  平下对序列进行聚类,共获得 834 个 OTUs。稀释性曲
          模型组     186.03±8.21 a  1.43±0.21 a  17.88±0.93 a  1.71±0.12 a  0.095 3±0.004 3 a  线和 Shannon 指数曲线均随测序量的增加而趋于平缓,
          火麻仁油组   213.45±6.03 b  0.61±0.03 b  19.10±1.02 b  1.57±0.11 b  0.082 2±0.007 1 b
          柳氮磺胺吡啶组 247.65±8.12 b  0.45±0.01 b  20.21±1.09 b  1.49±0.12 b  0.074 1±0.005 9 b  说明样品序列充分,能够覆盖样品中的大部分微生物,
             a:与对照组比较,P<0.05;b:与模型组比较,P<0.05                 可用于数据分析。结果见图2。


          中国药房  2023年第34卷第6期                                                 China Pharmacy  2023 Vol. 34  No. 6    · 695 ·
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