Page 24 - 《中国药房》2022年12期
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表2 各组小鼠转录组测序样本RNA质量分析结果
样本 原始数据/个 有效数据/个(%) 数据接头序列/个(%) 低质量序列/个(%) 全部都是A碱基的序列/个(%) 含未知碱基比例大于10%的序列/个(%)
假手术2组1 89 330 528 89 197 784(99.85) 23 006(0.03) 109 454(0.12) 0(0) 284(<0.01)
假手术2组2 83 071 266 82 949 748(99.85) 21 466(0.03) 99 916(0.12) 0(0) 136(<0.01)
假手术2组3 103 528 790 103 398 828(99.87) 16 740(0.02) 113 206(0.11) 0(0) 16(<0.01)
模型2组1 92 918 014 92 806 848(99.88) 14 916(0.02) 96 232(0.10) 0(0) 18(<0.01)
模型2组2 114 180 380 114 028 524(99.87) 19 972(0.02) 131 848(0.12) 0(0) 36(<0.01)
模型2组3 97 215 760 97 071 690(99.85) 16 576(0.02) 127 474(0.13) 0(0) 20(<0.01)
干预组1 104 493 620 104 360 542(99.87) 18 288(0.02) 114 764(0.11) 0(0) 26(<0.01)
干预组2 101 788 986 101 654 222(99.87) 17 236(0.02) 117 510(0.12) 0(0) 18(<0.01)
干预组3 83 938 996 83 782 080(99.81) 22 836(0.03) 133 842(0.16) 0(0) 238(<0.01)
表达上升 表达上升
无差异 8 无差异
表达下降 表达下降
15
6
10 ( FDR )
( FDR ) -lg 4
-lg
5
2
0 0
-10 -5 0 5 10 -10 -5 0 5 10
log2 (FC) log2 (FC)
A.假手术2组与模型2组比较 B.模型2组与干预组比较
图6 假手术2组、模型2组、干预组两两比较的差异LncRNA散点图
细胞进程
生物学调节 生物调节
生物进程调节
细胞进程 刺激响应
生物进程阳性调节
生物进程阳性调节 代谢进程
免疫进程
生物进程调节 多细胞有机体进程
信号转导
发育进程 定位
生物进程
代谢进程 生物进程负性调节
发育进程
生物进程 细胞组件重组及再生
多细胞有机体进展
多器官进程
生物进程负性调节 细胞增殖
移动
刺激感应 生物黏附
再生
信号转导 再生进程
细胞杀伤
细胞增殖 生长
行为
细胞组件重组及再生 节律进程
解毒
免疫进程 色素沉积
细胞
基因定位 细胞组分
细胞膜
多器官进程
细胞器
细胞膜组分
细胞 细胞器组分
细胞组件 蛋白包含复合物
细胞组分
胞外区域
胞外区域 胞外区域组分
细胞膜内腔
细胞组件 胞外区域组分 细胞结合
超分子复合物
细胞器 突触
突触组分
细胞膜 其他有机体系
其他有机体系组分
细胞膜内腔 类核
分子结合
细胞器组分 催化活性
超分子复合物 分子功能 分子功能调节子
分子转导活性
分子功能 分子结合 转录调节活性
结构分子活性
转运子活性
分子功能调节因子
货物接收器活性
蛋白标签 劫持分子功能
抗氧化活性
0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 0 50 100 150 200 250 300 350
基因数 基因数
A. LncRNA与顺式mRNA B. 差异LncRNA与反式mRNA
图7 差异LncRNA与顺、反式mRNA关联的显著富集GO条目
·1426 · China Pharmacy 2022 Vol. 33 No. 12 中国药房 2022年第33卷第12期